RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588780.5

CAPNS1-205, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,035 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-205ENST00000588780 TYMPP19971 482 aa23.63■■□□□ 1.37
CAPNS1-205ENST00000588780 GUCY2FP51841 1108 aa23.63■■□□□ 1.37
CAPNS1-205ENST00000588780 PPP2R3AQ06190 1150 aa23.63■■□□□ 1.37
CAPNS1-205ENST00000588780 ANKRD1Q15327 319 aa23.63■■□□□ 1.37
CAPNS1-205ENST00000588780 C11orf74Q86VG3 221 aa23.63■■□□□ 1.37
CAPNS1-205ENST00000588780 TTC30AQ86WT1 665 aa23.63■■□□□ 1.37
CAPNS1-205ENST00000588780 TSTD1Q8NFU3 115 aa23.63■■□□□ 1.37
CAPNS1-205ENST00000588780 SNX29Q8TEQ0 813 aa23.63■■□□□ 1.37
CAPNS1-205ENST00000588780 BICD1Q96G01 975 aa23.63■■□□□ 1.37
CAPNS1-205ENST00000588780 TPSD1Q9BZJ3 242 aa23.63■■□□□ 1.37
CAPNS1-205ENST00000588780 SLC32A1Q9H598 525 aa23.63■■□□□ 1.37
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CAPNS1-205ENST00000588780 DNM3Q9UQ16 869 aa23.63■■□□□ 1.37
CAPNS1-205ENST00000588780 CCL26Q9Y258 94 aa23.63■■□□□ 1.37
CAPNS1-205ENST00000588780 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
CAPNS1-205ENST00000588780 ZZEF1O43149 2961 aa23.62■■□□□ 1.37
CAPNS1-205ENST00000588780 SFI1A8K8P3 1242 aa23.62■■□□□ 1.37
CAPNS1-205ENST00000588780 PATE3B3GLJ2 98 aa23.62■■□□□ 1.37
CAPNS1-205ENST00000588780 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
CAPNS1-205ENST00000588780 GUCY1B3Q02153 619 aa23.62■■□□□ 1.37
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CAPNS1-205ENST00000588780 IL21Q9HBE4 155 aa23.62■■□□□ 1.37
CAPNS1-205ENST00000588780 TDP1Q9NUW8 608 aa23.62■■□□□ 1.37
CAPNS1-205ENST00000588780 HSFX1Q9UBD0 423 aa23.62■■□□□ 1.37
CAPNS1-205ENST00000588780 EBF1Q9UH73 591 aa23.62■■□□□ 1.37
CAPNS1-205ENST00000588780 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
CAPNS1-205ENST00000588780 E9PMD0 336 aa23.61■■□□□ 1.37
CAPNS1-205ENST00000588780 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
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CAPNS1-205ENST00000588780 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP23.61■■□□□ 1.37
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CAPNS1-205ENST00000588780 DAW1Q8N136 415 aa23.61■■□□□ 1.37
CAPNS1-205ENST00000588780 CPA6Q8N4T0 437 aa23.61■■□□□ 1.37
CAPNS1-205ENST00000588780 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
CAPNS1-205ENST00000588780 FAM212AQ96EL1 285 aa23.61■■□□□ 1.37
CAPNS1-205ENST00000588780 SENP8Q96LD8 212 aa23.61■■□□□ 1.37
CAPNS1-205ENST00000588780 KIF9Q9HAQ2 790 aa23.61■■□□□ 1.37
CAPNS1-205ENST00000588780 ATF6P18850 670 aa23.6■■□□□ 1.37
CAPNS1-205ENST00000588780 SMTNP53814 917 aa23.6■■□□□ 1.37
CAPNS1-205ENST00000588780 IRX4P78413 519 aa23.6■■□□□ 1.37
CAPNS1-205ENST00000588780 PMS2CLQ68D20 193 aa23.6■■□□□ 1.37
CAPNS1-205ENST00000588780 METTL23Q86XA0 190 aa23.6■■□□□ 1.37
CAPNS1-205ENST00000588780 OR10T2Q8NGX3 314 aa23.6■■□□□ 1.37
CAPNS1-205ENST00000588780 CD101Q93033 1021 aa23.6■■□□□ 1.37
CAPNS1-205ENST00000588780 RUSC1Q9BVN2 902 aa23.6■■□□□ 1.37
CAPNS1-205ENST00000588780 C17orf75Q9HAS0 396 aa23.6■■□□□ 1.37
CAPNS1-205ENST00000588780 ABCA7Q8IZY2 2146 aa23.59■■□□□ 1.37
CAPNS1-205ENST00000588780 LACTBL1A8MY62 500 aa23.59■■□□□ 1.37
CAPNS1-205ENST00000588780 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
CAPNS1-205ENST00000588780 JAK2O60674 1132 aa23.59■■□□□ 1.37
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CAPNS1-205ENST00000588780 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa23.59■■□□□ 1.37
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CAPNS1-205ENST00000588780 TXNDC8Q6A555 127 aa23.59■■□□□ 1.37
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CAPNS1-205ENST00000588780 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
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CAPNS1-205ENST00000588780 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa23.59■■□□□ 1.37
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CAPNS1-205ENST00000588780 TTC26A0AVF1 554 aa23.58■■□□□ 1.37
CAPNS1-205ENST00000588780 PPEF2O14830 753 aa23.58■■□□□ 1.37
CAPNS1-205ENST00000588780 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP23.58■■□□□ 1.37
CAPNS1-205ENST00000588780 TNFSF9P41273 254 aa23.58■■□□□ 1.37
CAPNS1-205ENST00000588780 LILRA4P59901 499 aa23.58■■□□□ 1.37
CAPNS1-205ENST00000588780 MCL1Q07820 350 aa23.58■■□□□ 1.37
CAPNS1-205ENST00000588780 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
CAPNS1-205ENST00000588780 TTC38Q5R3I4 469 aa23.58■■□□□ 1.37
CAPNS1-205ENST00000588780 ZPBP2Q6X784 338 aa23.58■■□□□ 1.37
CAPNS1-205ENST00000588780 THEM5Q8N1Q8 247 aa23.58■■□□□ 1.37
CAPNS1-205ENST00000588780 GTF3C6Q969F1 213 aa23.58■■□□□ 1.37
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CAPNS1-205ENST00000588780 STK24Q9Y6E0 443 aa23.58■■□□□ 1.37
CAPNS1-205ENST00000588780 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.36
CAPNS1-205ENST00000588780 THADAQ6YHU6 1953 aa23.58■■□□□ 1.36
CAPNS1-205ENST00000588780 SPEGQ15772 3267 aa23.57■■□□□ 1.36
CAPNS1-205ENST00000588780 RDXP35241 583 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
CAPNS1-205ENST00000588780 IFNAR2P48551 515 aa23.57■■□□□ 1.36
CAPNS1-205ENST00000588780 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP23.57■■□□□ 1.365e-6■■□□□ 12.9
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CAPNS1-205ENST00000588780 CCDC26Q8TAB7 109 aa23.57■■□□□ 1.36
CAPNS1-205ENST00000588780 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
CAPNS1-205ENST00000588780 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa23.57■■□□□ 1.36
CAPNS1-205ENST00000588780 ECT2Q9H8V3 914 aa23.57■■□□□ 1.36
CAPNS1-205ENST00000588780 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
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CAPNS1-205ENST00000588780 KLK13Q9UKR3 277 aa23.57■■□□□ 1.36
CAPNS1-205ENST00000588780 LAMA1P25391 3075 aa23.57■■□□□ 1.36
CAPNS1-205ENST00000588780 MAP3K13O43283 966 aa23.56■■□□□ 1.36
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