RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000570051.5

RNPS1-226, Transcript of RNA binding protein with serine rich domain 1, humanhuman

TSL 2

Gene RNPS1, Length 735 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNPS1-226ENST00000570051 TNNC1P63316 161 aa22.14■■□□□ 1.13
RNPS1-226ENST00000570051 TWF1Q12792 350 aa22.14■■□□□ 1.13
RNPS1-226ENST00000570051 SMARCB1Q12824 385 aa22.14■■□□□ 1.13
RNPS1-226ENST00000570051 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
RNPS1-226ENST00000570051 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
RNPS1-226ENST00000570051 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa22.14■■□□□ 1.13
RNPS1-226ENST00000570051 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
RNPS1-226ENST00000570051 PKMYT1Q99640 499 aa22.14■■□□□ 1.13
RNPS1-226ENST00000570051 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
RNPS1-226ENST00000570051 NUP62CLQ9H1M0 184 aa22.14■■□□□ 1.13
RNPS1-226ENST00000570051 TMLHEQ9NVH6 421 aa22.14■■□□□ 1.13
RNPS1-226ENST00000570051 GOLGA6L22H0YM25 854 aa22.13■■□□□ 1.13
RNPS1-226ENST00000570051 TACC1O75410 805 aa22.13■■□□□ 1.13
RNPS1-226ENST00000570051 HLA-DRAP01903 254 aa22.13■■□□□ 1.13
RNPS1-226ENST00000570051 FSHRP23945 695 aa22.13■■□□□ 1.13
RNPS1-226ENST00000570051 PCSK1P29120 753 aa22.13■■□□□ 1.13
RNPS1-226ENST00000570051 PAK1Q13153 545 aa22.13■■□□□ 1.13
RNPS1-226ENST00000570051 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
RNPS1-226ENST00000570051 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
RNPS1-226ENST00000570051 PLCD3Q8N3E9 789 aa22.13■■□□□ 1.13
RNPS1-226ENST00000570051 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
RNPS1-226ENST00000570051 MYADMQ96S97 322 aa22.13■■□□□ 1.13
RNPS1-226ENST00000570051 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
RNPS1-226ENST00000570051 CEP72Q9P209 647 aa22.13■■□□□ 1.13
RNPS1-226ENST00000570051 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
RNPS1-226ENST00000570051 MUTYHQ9UIF7 546 aa22.13■■□□□ 1.13
RNPS1-226ENST00000570051 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa22.13■■□□□ 1.13
RNPS1-226ENST00000570051 BICDL2A1A5D9 508 aa22.12■■□□□ 1.13
RNPS1-226ENST00000570051 RHOP08100 348 aa22.12■■□□□ 1.13
RNPS1-226ENST00000570051 FAM163BP0C2L3 166 aa22.12■■□□□ 1.13
RNPS1-226ENST00000570051 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
RNPS1-226ENST00000570051 GTF2H1P32780 548 aa22.12■■□□□ 1.13
RNPS1-226ENST00000570051 PIK3CAP42336 1068 aa22.12■■□□□ 1.13
RNPS1-226ENST00000570051 CDR1P51861 262 aa22.12■■□□□ 1.13
RNPS1-226ENST00000570051 PLD1Q13393 1074 aa22.12■■□□□ 1.13
RNPS1-226ENST00000570051 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa22.12■■□□□ 1.13
RNPS1-226ENST00000570051 ZNF667Q5HYK9 610 aa22.12■■□□□ 1.13
RNPS1-226ENST00000570051 SPPL2BQ8TCT7 592 aa22.12■■□□□ 1.13
RNPS1-226ENST00000570051 GPT2Q8TD30 523 aa22.12■■□□□ 1.13
RNPS1-226ENST00000570051 ELMO3Q96BJ8 720 aa22.12■■□□□ 1.13
RNPS1-226ENST00000570051 CEP63Q96MT8 703 aa22.12■■□□□ 1.13
RNPS1-226ENST00000570051 MMRN2Q9H8L6 949 aa22.12■■□□□ 1.13
RNPS1-226ENST00000570051 TMEM8AQ9HCN3 771 aa22.12■■□□□ 1.13
RNPS1-226ENST00000570051 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
RNPS1-226ENST00000570051 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP22.12■■□□□ 1.13
RNPS1-226ENST00000570051 NME7Q9Y5B8 376 aa22.12■■□□□ 1.13
RNPS1-226ENST00000570051 PI4K2BG5E9Z4 385 aa22.11■■□□□ 1.13
RNPS1-226ENST00000570051 DCXO43602 365 aa22.11■■□□□ 1.13
RNPS1-226ENST00000570051 SOAT2O75908 522 aa22.11■■□□□ 1.13
RNPS1-226ENST00000570051 ASS1P00966 412 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
RNPS1-226ENST00000570051 PTPN2P17706 415 aa22.11■■□□□ 1.13
RNPS1-226ENST00000570051 LMO2P25791 158 aa22.11■■□□□ 1.13
RNPS1-226ENST00000570051 STX17P56962 302 aa22.11■■□□□ 1.13
RNPS1-226ENST00000570051 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
RNPS1-226ENST00000570051 CCDC142Q17RM4 750 aa22.11■■□□□ 1.13
RNPS1-226ENST00000570051 ELMOD1Q8N336 334 aa22.11■■□□□ 1.13
RNPS1-226ENST00000570051 ITFG1Q8TB96 612 aa22.11■■□□□ 1.13
RNPS1-226ENST00000570051 TAS1R2Q8TE23 839 aa22.11■■□□□ 1.13
RNPS1-226ENST00000570051 TAF4BQ92750 862 aa22.11■■□□□ 1.13
RNPS1-226ENST00000570051 SYT15Q9BQS2 421 aa22.11■■□□□ 1.13
RNPS1-226ENST00000570051 CORO1BQ9BR76 489 aa22.11■■□□□ 1.13
RNPS1-226ENST00000570051 DNAJC25Q9H1X3 360 aa22.11■■□□□ 1.13
RNPS1-226ENST00000570051 SMYD3Q9H7B4 428 aa22.11■■□□□ 1.13
RNPS1-226ENST00000570051 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
RNPS1-226ENST00000570051 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
RNPS1-226ENST00000570051 GTF3C4Q9UKN8 822 aa22.11■■□□□ 1.13
RNPS1-226ENST00000570051 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa22.11■■□□□ 1.13
RNPS1-226ENST00000570051 TRIOO75962 3097 aa22.11■■□□□ 1.13
RNPS1-226ENST00000570051 MYO10Q9HD67 2058 aa22.11■■□□□ 1.13
RNPS1-226ENST00000570051 CLSTN1O94985 981 aa22.1■■□□□ 1.13
RNPS1-226ENST00000570051 ALDH1A3P47895 512 aa22.1■■□□□ 1.13
RNPS1-226ENST00000570051 TUFMP49411 452 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
RNPS1-226ENST00000570051 MXI1P50539 228 aa22.1■■□□□ 1.13
RNPS1-226ENST00000570051 SLC5A9Q2M3M2 681 aa22.1■■□□□ 1.13
RNPS1-226ENST00000570051 MGAT5BQ3V5L5 792 aa22.1■■□□□ 1.13
RNPS1-226ENST00000570051 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
RNPS1-226ENST00000570051 KRT39Q6A163 491 aa22.1■■□□□ 1.13
RNPS1-226ENST00000570051 IQCEQ6IPM2 695 aa22.1■■□□□ 1.13
RNPS1-226ENST00000570051 FAM171BQ6P995 826 aa22.1■■□□□ 1.13
RNPS1-226ENST00000570051 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa22.1■■□□□ 1.13
RNPS1-226ENST00000570051 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
RNPS1-226ENST00000570051 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
RNPS1-226ENST00000570051 EPHX3Q9H6B9 360 aa22.1■■□□□ 1.13
RNPS1-226ENST00000570051 EPS15L1Q9UBC2 864 aa22.1■■□□□ 1.13
RNPS1-226ENST00000570051 LIMD1Q9UGP4 676 aa22.1■■□□□ 1.13
RNPS1-226ENST00000570051 CDH9Q9ULB4 789 aa22.1■■□□□ 1.13
RNPS1-226ENST00000570051 MYBPHLA2RUH7 354 aa22.09■■□□□ 1.13
RNPS1-226ENST00000570051 STX10O60499 249 aa22.09■■□□□ 1.13
RNPS1-226ENST00000570051 ATP2C2O75185 946 aa22.09■■□□□ 1.13
RNPS1-226ENST00000570051 PDGFRBP09619 1106 aa22.09■■□□□ 1.13
RNPS1-226ENST00000570051 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
RNPS1-226ENST00000570051 ATF6P18850 670 aa22.09■■□□□ 1.13
RNPS1-226ENST00000570051 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
RNPS1-226ENST00000570051 EPHB3P54753 998 aa22.09■■□□□ 1.13
RNPS1-226ENST00000570051 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
RNPS1-226ENST00000570051 TCERG1LQ5VWI1 586 aa22.09■■□□□ 1.13
RNPS1-226ENST00000570051 SPOPLQ6IQ16 392 aa22.09■■□□□ 1.13
RNPS1-226ENST00000570051 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa22.09■■□□□ 1.13
RNPS1-226ENST00000570051 FRMD5Q7Z6J6 570 aa22.09■■□□□ 1.13
RNPS1-226ENST00000570051 OR6B3Q8NGW1 331 aa22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.5 ms