RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567434.5

CCNDBP1-211, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene CCNDBP1, Length 713 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-211ENST00000567434 CCDC127Q96BQ5 260 aa18.36■□□□□ 0.53
CCNDBP1-211ENST00000567434 ABCB6Q9NP58 842 aa18.36■□□□□ 0.53
CCNDBP1-211ENST00000567434 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP18.36■□□□□ 0.53
CCNDBP1-211ENST00000567434 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa18.36■□□□□ 0.53
CCNDBP1-211ENST00000567434 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa18.36■□□□□ 0.53
CCNDBP1-211ENST00000567434 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa18.36■□□□□ 0.53
CCNDBP1-211ENST00000567434 GABRDO14764 452 aa18.35■□□□□ 0.53
CCNDBP1-211ENST00000567434 CALUO43852 315 aaPredicted RBP18.35■□□□□ 0.53
CCNDBP1-211ENST00000567434 STAU1O95793 577 aaKnown RBP18.35■□□□□ 0.53
CCNDBP1-211ENST00000567434 FAM163BP0C2L3 166 aa18.35■□□□□ 0.53
CCNDBP1-211ENST00000567434 PRR29P0C7W0 189 aa18.35■□□□□ 0.53
CCNDBP1-211ENST00000567434 CLDN10P78369 228 aa18.35■□□□□ 0.53
CCNDBP1-211ENST00000567434 NFIL3Q16649 462 aa18.35■□□□□ 0.53
CCNDBP1-211ENST00000567434 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP18.35■□□□□ 0.53
CCNDBP1-211ENST00000567434 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP18.35■□□□□ 0.53
CCNDBP1-211ENST00000567434 SIX5Q8N196 739 aa18.35■□□□□ 0.53
CCNDBP1-211ENST00000567434 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP18.35■□□□□ 0.53
CCNDBP1-211ENST00000567434 ELSPBP1Q96BH3 223 aa18.35■□□□□ 0.53
CCNDBP1-211ENST00000567434 TCEAL4Q96EI5 215 aa18.35■□□□□ 0.53
CCNDBP1-211ENST00000567434 MCRS1Q96EZ8 462 aa18.35■□□□□ 0.53
CCNDBP1-211ENST00000567434 FAM84AQ96KN4 292 aa18.35■□□□□ 0.53
CCNDBP1-211ENST00000567434 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP18.35■□□□□ 0.53
CCNDBP1-211ENST00000567434 DNAJC25Q9H1X3 360 aa18.35■□□□□ 0.53
CCNDBP1-211ENST00000567434 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP18.35■□□□□ 0.53
CCNDBP1-211ENST00000567434 MAPK13O15264 365 aa18.34■□□□□ 0.53
CCNDBP1-211ENST00000567434 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP18.34■□□□□ 0.53
CCNDBP1-211ENST00000567434 NR3C1P04150 777 aa18.34■□□□□ 0.53
CCNDBP1-211ENST00000567434 CFHP08603 1231 aa18.34■□□□□ 0.53
CCNDBP1-211ENST00000567434 MYL4P12829 197 aa18.34■□□□□ 0.53
CCNDBP1-211ENST00000567434 ATICP31939 592 aa18.34■□□□□ 0.53
CCNDBP1-211ENST00000567434 CCR2P41597 374 aa18.34■□□□□ 0.53
CCNDBP1-211ENST00000567434 PFKPQ01813 784 aa18.34■□□□□ 0.53
CCNDBP1-211ENST00000567434 FAM160A1Q05DH4 1040 aa18.34■□□□□ 0.53
CCNDBP1-211ENST00000567434 TCF15Q12870 199 aa18.34■□□□□ 0.53
CCNDBP1-211ENST00000567434 SOWAHAQ2M3V2 549 aa18.34■□□□□ 0.53
CCNDBP1-211ENST00000567434 MGAT5BQ3V5L5 792 aa18.34■□□□□ 0.53
CCNDBP1-211ENST00000567434 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP18.34■□□□□ 0.53
CCNDBP1-211ENST00000567434 LRRTM3Q86VH5 581 aa18.34■□□□□ 0.53
CCNDBP1-211ENST00000567434 TMC8Q8IU68 726 aa18.34■□□□□ 0.53
CCNDBP1-211ENST00000567434 HS6ST3Q8IZP7 471 aa18.34■□□□□ 0.53
CCNDBP1-211ENST00000567434 TTC9BQ8N6N2 239 aa18.34■□□□□ 0.53
CCNDBP1-211ENST00000567434 PARD3BQ8TEW8 1205 aa18.34■□□□□ 0.53
CCNDBP1-211ENST00000567434 LRRC3Q9BY71 257 aa18.34■□□□□ 0.53
CCNDBP1-211ENST00000567434 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP18.34■□□□□ 0.53
CCNDBP1-211ENST00000567434 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP18.34■□□□□ 0.53
CCNDBP1-211ENST00000567434 RMND1Q9NWS8 449 aa18.34■□□□□ 0.53
CCNDBP1-211ENST00000567434 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP18.34■□□□□ 0.53
CCNDBP1-211ENST00000567434 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP18.34■□□□□ 0.53
CCNDBP1-211ENST00000567434 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa18.34■□□□□ 0.53
CCNDBP1-211ENST00000567434 MOSPD3O75425 235 aa18.33■□□□□ 0.52
CCNDBP1-211ENST00000567434 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP18.33■□□□□ 0.52
CCNDBP1-211ENST00000567434 VCPP55072 806 aaKnown RBP18.33■□□□□ 0.52
CCNDBP1-211ENST00000567434 TRPC3Q13507 836 aa18.33■□□□□ 0.52
CCNDBP1-211ENST00000567434 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP18.33■□□□□ 0.52
CCNDBP1-211ENST00000567434 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP18.33■□□□□ 0.52
CCNDBP1-211ENST00000567434 TMC2Q8TDI7 906 aa18.33■□□□□ 0.52
CCNDBP1-211ENST00000567434 GPR152Q8TDT2 470 aa18.33■□□□□ 0.52
CCNDBP1-211ENST00000567434 SMARCD2Q92925 531 aa18.33■□□□□ 0.52
CCNDBP1-211ENST00000567434 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP18.33■□□□□ 0.52
CCNDBP1-211ENST00000567434 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP18.33■□□□□ 0.52
CCNDBP1-211ENST00000567434 ASB16Q96NS5 453 aa18.33■□□□□ 0.52
CCNDBP1-211ENST00000567434 TRPV4Q9HBA0 871 aa18.33■□□□□ 0.52
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZFP14Q9HCL3 533 aa18.33■□□□□ 0.52
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZMYM5Q9UJ78 669 aa18.33■□□□□ 0.52
CCNDBP1-211ENST00000567434 TACC1O75410 805 aa18.32■□□□□ 0.52
CCNDBP1-211ENST00000567434 ATF6P18850 670 aa18.32■□□□□ 0.52
CCNDBP1-211ENST00000567434 WARSP23381 471 aaKnown RBP18.32■□□□□ 0.52
CCNDBP1-211ENST00000567434 RPL13P26373 211 aaKnown RBP18.32■□□□□ 0.52
CCNDBP1-211ENST00000567434 TNNC1P63316 161 aa18.32■□□□□ 0.52
CCNDBP1-211ENST00000567434 ENPEPQ07075 957 aa18.32■□□□□ 0.52
CCNDBP1-211ENST00000567434 CFAP221Q4G0U5 840 aa18.32■□□□□ 0.52
CCNDBP1-211ENST00000567434 FAM78AQ5JUQ0 283 aa18.32■□□□□ 0.52
CCNDBP1-211ENST00000567434 SCARA3Q6AZY7 606 aa18.32■□□□□ 0.52
CCNDBP1-211ENST00000567434 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa18.32■□□□□ 0.52
CCNDBP1-211ENST00000567434 ENGASEQ8NFI3 743 aa18.32■□□□□ 0.52
CCNDBP1-211ENST00000567434 SHKBP1Q8TBC3 707 aa18.32■□□□□ 0.52
CCNDBP1-211ENST00000567434 FAM200AQ8TCP9 573 aa18.32■□□□□ 0.52
CCNDBP1-211ENST00000567434 E2F7Q96AV8 911 aa18.32■□□□□ 0.52
CCNDBP1-211ENST00000567434 SHDQ96IW2 340 aa18.32■□□□□ 0.52
CCNDBP1-211ENST00000567434 TIGD1Q96MW7 591 aa18.32■□□□□ 0.52
CCNDBP1-211ENST00000567434 GSDMAQ96QA5 445 aa18.32■□□□□ 0.52
CCNDBP1-211ENST00000567434 GCNAQ96QF7 691 aa18.32■□□□□ 0.52
CCNDBP1-211ENST00000567434 MMS19Q96T76 1030 aa18.32■□□□□ 0.52
CCNDBP1-211ENST00000567434 PKMYT1Q99640 499 aa18.32■□□□□ 0.52
CCNDBP1-211ENST00000567434 KXD1Q9BQD3 176 aa18.32■□□□□ 0.52
CCNDBP1-211ENST00000567434 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP18.32■□□□□ 0.52
CCNDBP1-211ENST00000567434 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa18.32■□□□□ 0.52
CCNDBP1-211ENST00000567434 VRTNQ9H8Y1 702 aa18.32■□□□□ 0.52
CCNDBP1-211ENST00000567434 ARHGEF3Q9NR81 526 aa18.32■□□□□ 0.52
CCNDBP1-211ENST00000567434 CDH9Q9ULB4 789 aa18.32■□□□□ 0.52
CCNDBP1-211ENST00000567434 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP18.31■□□□□ 0.52
CCNDBP1-211ENST00000567434 IKBKBO14920 756 aa18.31■□□□□ 0.52
CCNDBP1-211ENST00000567434 PHACTR2O75167 634 aa18.31■□□□□ 0.52
CCNDBP1-211ENST00000567434 SOAT2O75908 522 aa18.31■□□□□ 0.52
CCNDBP1-211ENST00000567434 SMC2O95347 1197 aa18.31■□□□□ 0.52
CCNDBP1-211ENST00000567434 CST3P01034 146 aaPredicted RBP18.31■□□□□ 0.52
CCNDBP1-211ENST00000567434 AOC1P19801 751 aa18.31■□□□□ 0.52
CCNDBP1-211ENST00000567434 FCARP24071 287 aa18.31■□□□□ 0.52
CCNDBP1-211ENST00000567434 CDC25CP30307 473 aa18.31■□□□□ 0.52
CCNDBP1-211ENST00000567434 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.5 ms