RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560754.1

RNF31-223, Transcript of ring finger protein 31, human

TSL 3

Gene RNF31, Length 606 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RNF31-223	ENST00000560754	TPR	P12270	2363 aa	Known RBP	14.73	□□□□□ -0.05
RNF31-223	ENST00000560754	MYMK	A6NI61	221 aa		14.73	□□□□□ -0.05
RNF31-223	ENST00000560754	SLC38A8	A6NNN8	435 aa		14.73	□□□□□ -0.05
RNF31-223	ENST00000560754	SPECC1L-ADORA2A	F8WAN1	911 aa		14.73	□□□□□ -0.05
RNF31-223	ENST00000560754	F11	P03951	625 aa		14.73	□□□□□ -0.05
RNF31-223	ENST00000560754	PDC	P20941	246 aa		14.73	□□□□□ -0.05
RNF31-223	ENST00000560754	HOXA6	P31267	233 aa		14.73	□□□□□ -0.05
RNF31-223	ENST00000560754	KPNA1	P52294	538 aa	Predicted RBP	14.73	□□□□□ -0.05
RNF31-223	ENST00000560754	PLCB2	Q00722	1185 aa		14.73	□□□□□ -0.05
RNF31-223	ENST00000560754	ARHGAP15	Q53QZ3	475 aa		14.73	□□□□□ -0.05
RNF31-223	ENST00000560754	TXNDC11	Q6PKC3	985 aa		14.73	□□□□□ -0.05
RNF31-223	ENST00000560754	SV2B	Q7L1I2	683 aa		14.73	□□□□□ -0.05
RNF31-223	ENST00000560754	TMEM150A	Q86TG1	271 aa		14.73	□□□□□ -0.05
RNF31-223	ENST00000560754	SYNPO	Q8N3V7	929 aa		14.73	□□□□□ -0.05
RNF31-223	ENST00000560754	CXorf38	Q8TB03	319 aa		14.73	□□□□□ -0.05
RNF31-223	ENST00000560754	POMGNT1	Q8WZA1	660 aa		14.73	□□□□□ -0.05
RNF31-223	ENST00000560754	SECISBP2L	Q93073	1101 aa	Known RBP	14.73	□□□□□ -0.05
RNF31-223	ENST00000560754	LPIN3	Q9BQK8	851 aa		14.73	□□□□□ -0.05
RNF31-223	ENST00000560754	OLFML3	Q9NRN5	406 aa		14.73	□□□□□ -0.05
RNF31-223	ENST00000560754	MORC2	Q9Y6X9	1032 aa	Predicted RBP	14.73	□□□□□ -0.05
RNF31-223	ENST00000560754	EPG5	Q9HCE0	2579 aa		14.73	□□□□□ -0.05
RNF31-223	ENST00000560754	SPAG17	Q6Q759	2223 aa		14.72	□□□□□ -0.05
RNF31-223	ENST00000560754	SDK1	Q7Z5N4	2213 aa		14.72	□□□□□ -0.05
RNF31-223	ENST00000560754	MED19	A0JLT2	244 aa	Predicted RBP	14.72	□□□□□ -0.05
RNF31-223	ENST00000560754	PRR5-ARHGAP8	B1AHC4	643 aa		14.72	□□□□□ -0.05
RNF31-223	ENST00000560754		K7ESF4	209 aa		14.72	□□□□□ -0.05
RNF31-223	ENST00000560754	DPYSL4	O14531	572 aa		14.72	□□□□□ -0.05
RNF31-223	ENST00000560754	HR	O43593	1189 aa		14.72	□□□□□ -0.05
RNF31-223	ENST00000560754	LDHA	P00338	332 aa	Known RBP	14.72	□□□□□ -0.05
RNF31-223	ENST00000560754	HMGA1	P17096	107 aa	Known RBP	14.72	□□□□□ -0.05
RNF31-223	ENST00000560754	GAP43	P17677	238 aa		14.72	□□□□□ -0.05
RNF31-223	ENST00000560754	CDC25C	P30307	473 aa		14.72	□□□□□ -0.05
RNF31-223	ENST00000560754	CTH	P32929	405 aa		14.72	□□□□□ -0.05
RNF31-223	ENST00000560754	CNR2	P34972	360 aa		14.72	□□□□□ -0.05
RNF31-223	ENST00000560754	PNPLA4	P41247	253 aa		14.72	□□□□□ -0.05
RNF31-223	ENST00000560754	SOX9	P48436	509 aa		14.72	□□□□□ -0.05
RNF31-223	ENST00000560754	ARHGAP8	P85298	464 aa		14.72	□□□□□ -0.05
RNF31-223	ENST00000560754	SATB1	Q01826	763 aa		14.72	□□□□□ -0.05
RNF31-223	ENST00000560754	CCIN	Q13939	588 aa		14.72	□□□□□ -0.05
RNF31-223	ENST00000560754	LRRC32	Q14392	662 aa		14.72	□□□□□ -0.05
RNF31-223	ENST00000560754	VEPH1	Q14D04	833 aa		14.72	□□□□□ -0.05
RNF31-223	ENST00000560754	MGAT5B	Q3V5L5	792 aa		14.72	□□□□□ -0.05
RNF31-223	ENST00000560754	SV2C	Q496J9	727 aa		14.72	□□□□□ -0.05
RNF31-223	ENST00000560754	RRAGB	Q5VZM2	374 aa		14.72	□□□□□ -0.05
RNF31-223	ENST00000560754	DCP1B	Q8IZD4	617 aa	Known RBP	14.72	□□□□□ -0.05
RNF31-223	ENST00000560754	CMTM8	Q8IZV2	173 aa		14.72	□□□□□ -0.05
RNF31-223	ENST00000560754	BPIFB1	Q8TDL5	484 aa		14.72	□□□□□ -0.05
RNF31-223	ENST00000560754	ZFYVE19	Q96K21	471 aa		14.72	□□□□□ -0.05
RNF31-223	ENST00000560754	ACCS	Q96QU6	501 aa		14.72	□□□□□ -0.05
RNF31-223	ENST00000560754	SEPT5	Q99719	369 aa	Predicted RBP	14.72	□□□□□ -0.05
RNF31-223	ENST00000560754	FAM83C	Q9BQN1	747 aa		14.72	□□□□□ -0.05
RNF31-223	ENST00000560754	MRPL44	Q9H9J2	332 aa	Known RBP	14.72	□□□□□ -0.05
RNF31-223	ENST00000560754	PCDHB13	Q9Y5F0	798 aa		14.72	□□□□□ -0.05
RNF31-223	ENST00000560754	GREB1	Q4ZG55	1949 aa		14.72	□□□□□ -0.05
RNF31-223	ENST00000560754	ANAPC1	Q9H1A4	1944 aa		14.72	□□□□□ -0.05
RNF31-223	ENST00000560754	FRMD3	A2A2Y4	597 aa		14.71	□□□□□ -0.05
RNF31-223	ENST00000560754	PRAMEF12	O95522	483 aa		14.71	□□□□□ -0.05
RNF31-223	ENST00000560754	GART	P22102	1010 aa		14.71	□□□□□ -0.05
RNF31-223	ENST00000560754	WNT7B	P56706	349 aa		14.71	□□□□□ -0.05
RNF31-223	ENST00000560754	NLRP12	P59046	1061 aa		14.71	□□□□□ -0.05
RNF31-223	ENST00000560754	L1TD1	Q5T7N2	865 aa	Known RBP	14.71	□□□□□ -0.05
RNF31-223	ENST00000560754	LAIR1	Q6GTX8	287 aa		14.71	□□□□□ -0.05
RNF31-223	ENST00000560754	ZSWIM2	Q8NEG5	633 aa		14.71	□□□□□ -0.05
RNF31-223	ENST00000560754	FAM200A	Q8TCP9	573 aa		14.71	□□□□□ -0.05
RNF31-223	ENST00000560754	GIPC2	Q8TF65	315 aa		14.71	□□□□□ -0.05
RNF31-223	ENST00000560754	CACTIN	Q8WUQ7	758 aa	Known RBP	14.71	□□□□□ -0.05
RNF31-223	ENST00000560754	CLIC6	Q96NY7	704 aa		14.71	□□□□□ -0.05
RNF31-223	ENST00000560754	ACBD6	Q9BR61	282 aa		14.71	□□□□□ -0.05
RNF31-223	ENST00000560754	PARD6A	Q9NPB6	346 aa		14.71	□□□□□ -0.05
RNF31-223	ENST00000560754	GKN1	Q9NS71	199 aa		14.71	□□□□□ -0.05
RNF31-223	ENST00000560754	RBM12	Q9NTZ6	932 aa	Known RBP	14.71	□□□□□ -0.05
RNF31-223	ENST00000560754	TMLHE	Q9NVH6	421 aa		14.71	□□□□□ -0.05
RNF31-223	ENST00000560754	THG1L	Q9NWX6	298 aa	Known RBP	14.71	□□□□□ -0.05
RNF31-223	ENST00000560754	GDAP2	Q9NXN4	497 aa		14.71	□□□□□ -0.05
RNF31-223	ENST00000560754	EXOC7	Q9UPT5	735 aa		14.71	□□□□□ -0.05
RNF31-223	ENST00000560754	PCDHB5	Q9Y5E4	795 aa		14.71	□□□□□ -0.05
RNF31-223	ENST00000560754	ACACB	O00763	2458 aa		14.7	□□□□□ -0.06
RNF31-223	ENST00000560754	LRP3	O75074	770 aa		14.7	□□□□□ -0.06
RNF31-223	ENST00000560754	RET	P07949	1114 aa		14.7	□□□□□ -0.06
RNF31-223	ENST00000560754	SYT1	P21579	422 aa		14.7	□□□□□ -0.06
RNF31-223	ENST00000560754	CDR1	P51861	262 aa		14.7	□□□□□ -0.06
RNF31-223	ENST00000560754	ATXN1	P54253	815 aa	Known RBP	14.7	□□□□□ -0.06
RNF31-223	ENST00000560754	CYP4F8	P98187	520 aa		14.7	□□□□□ -0.06
RNF31-223	ENST00000560754	LMNB2	Q03252	620 aa		14.7	□□□□□ -0.06
RNF31-223	ENST00000560754	TNK2	Q07912	1038 aa		14.7	□□□□□ -0.06
RNF31-223	ENST00000560754	REST	Q13127	1097 aa		14.7	□□□□□ -0.06
RNF31-223	ENST00000560754	SLC39A14	Q15043	492 aa		14.7	□□□□□ -0.06
RNF31-223	ENST00000560754	NFE2	Q16621	373 aa	Predicted RBP	14.7	□□□□□ -0.06
RNF31-223	ENST00000560754	ITPRIPL2	Q3MIP1	535 aa		14.7	□□□□□ -0.06
RNF31-223	ENST00000560754	SCARA3	Q6AZY7	606 aa		14.7	□□□□□ -0.06
RNF31-223	ENST00000560754	C1orf127	Q8N9H9	656 aa		14.7	□□□□□ -0.06
RNF31-223	ENST00000560754	LEO1	Q8WVC0	666 aa	Predicted RBP	14.7	□□□□□ -0.06
RNF31-223	ENST00000560754	MYRFL	Q96LU7	910 aa		14.7	□□□□□ -0.06
RNF31-223	ENST00000560754	PKMYT1	Q99640	499 aa		14.7	□□□□□ -0.06
RNF31-223	ENST00000560754	FAM213A	Q9BRX8	229 aa		14.7	□□□□□ -0.06
RNF31-223	ENST00000560754	AGAP1	Q9UPQ3	857 aa		14.7	□□□□□ -0.06
RNF31-223	ENST00000560754	VPS37C	A5D8V6	355 aa	Predicted RBP	14.69	□□□□□ -0.06
RNF31-223	ENST00000560754	CENPB	P07199	599 aa	Predicted RBP	14.69	□□□□□ -0.06
RNF31-223	ENST00000560754	DDX6	P26196	483 aa	Known RBP eCLIP	14.69	□□□□□ -0.06
RNF31-223	ENST00000560754	CASP5	P51878	434 aa		14.69	□□□□□ -0.06

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