RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560163.1

RABGGTA-214, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 4

Gene RABGGTA, Length 877 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-214ENST00000560163 TIPINQ9BVW5 301 aa21.45■■□□□ 1.02
RABGGTA-214ENST00000560163 EBF1Q9UH73 591 aa21.45■■□□□ 1.02
RABGGTA-214ENST00000560163 ZMYM5Q9UJ78 669 aa21.45■■□□□ 1.02
RABGGTA-214ENST00000560163 TSC2P49815 1807 aa21.45■■□□□ 1.02
RABGGTA-214ENST00000560163 ANK1P16157 1881 aa21.44■■□□□ 1.02
RABGGTA-214ENST00000560163 PP2D1A8MPX8 630 aa21.44■■□□□ 1.02
RABGGTA-214ENST00000560163 DCLK1O15075 740 aa21.44■■□□□ 1.02
RABGGTA-214ENST00000560163 CAVIN2O95810 425 aa21.44■■□□□ 1.02
RABGGTA-214ENST00000560163 CYP11A1P05108 521 aa21.44■■□□□ 1.02
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RABGGTA-214ENST00000560163 TRAPPC10P48553 1259 aa21.44■■□□□ 1.02
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RABGGTA-214ENST00000560163 RIN3Q8TB24 985 aa21.44■■□□□ 1.02
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RABGGTA-214ENST00000560163 TSPAN18Q96SJ8 248 aa21.44■■□□□ 1.02
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RABGGTA-214ENST00000560163 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa21.44■■□□□ 1.02
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RABGGTA-214ENST00000560163 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
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RABGGTA-214ENST00000560163 PIRO00625 290 aa21.42■■□□□ 1.02
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RABGGTA-214ENST00000560163 SPINK2P20155 84 aa21.42■■□□□ 1.02
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RABGGTA-214ENST00000560163 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa21.42■■□□□ 1.02
RABGGTA-214ENST00000560163 VEPH1Q14D04 833 aa21.42■■□□□ 1.02
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RABGGTA-214ENST00000560163 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa21.42■■□□□ 1.02
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RABGGTA-214ENST00000560163 MAB21L3Q8N8X9 362 aa21.41■■□□□ 1.02
RABGGTA-214ENST00000560163 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa21.41■■□□□ 1.02
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RABGGTA-214ENST00000560163 C8orf76Q96K31 380 aa21.41■■□□□ 1.02
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RABGGTA-214ENST00000560163 P2RY13Q9BPV8 354 aa21.41■■□□□ 1.02
RABGGTA-214ENST00000560163 ADAM33Q9BZ11 813 aa21.41■■□□□ 1.02
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RABGGTA-214ENST00000560163 ITPR1Q14643 2758 aa21.4■■□□□ 1.02
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RABGGTA-214ENST00000560163 TMEM8BA6NDV4 472 aa21.4■■□□□ 1.02
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RABGGTA-214ENST00000560163 C9orf57Q5W0N0 161 aa21.4■■□□□ 1.02
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RABGGTA-214ENST00000560163 KIF9Q9HAQ2 790 aa21.4■■□□□ 1.02
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RABGGTA-214ENST00000560163 OBSL1O75147 1896 aa21.4■■□□□ 1.02
RABGGTA-214ENST00000560163 MYO16Q9Y6X6 1858 aa21.4■■□□□ 1.02
RABGGTA-214ENST00000560163 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP21.39■■□□□ 1.01
RABGGTA-214ENST00000560163 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP21.39■■□□□ 1.01
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