RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552331.1

CS-232, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 526 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-232ENST00000552331 COL20A1Q9P218 1284 aa3.85□□□□□ -1.79
CS-232ENST00000552331 PI4KBQ9UBF8 816 aa3.85□□□□□ -1.79
CS-232ENST00000552331 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP3.85□□□□□ -1.79
CS-232ENST00000552331 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP3.85□□□□□ -1.79
CS-232ENST00000552331 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa3.85□□□□□ -1.79
CS-232ENST00000552331 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa3.85□□□□□ -1.79
CS-232ENST00000552331 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa3.84□□□□□ -1.79
CS-232ENST00000552331 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa3.84□□□□□ -1.79
CS-232ENST00000552331 PRSS38A1L453 326 aa3.84□□□□□ -1.79
CS-232ENST00000552331 CLCA1A8K7I4 914 aa3.84□□□□□ -1.79
CS-232ENST00000552331 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP3.84□□□□□ -1.79
CS-232ENST00000552331 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP3.84□□□□□ -1.79
CS-232ENST00000552331 KCNK3O14649 394 aa3.84□□□□□ -1.79
CS-232ENST00000552331 PRRG2O14669 202 aa3.84□□□□□ -1.79
CS-232ENST00000552331 VILLO15195 856 aa3.84□□□□□ -1.79
CS-232ENST00000552331 ASNA1O43681 348 aa3.84□□□□□ -1.79
CS-232ENST00000552331 ZBTB14O43829 449 aa3.84□□□□□ -1.79
CS-232ENST00000552331 KERAO60938 352 aa3.84□□□□□ -1.79
CS-232ENST00000552331 LRRN2O75325 713 aa3.84□□□□□ -1.79
CS-232ENST00000552331 USP2O75604 605 aaPredicted RBP3.84□□□□□ -1.79
CS-232ENST00000552331 ACTL6BO94805 426 aa3.84□□□□□ -1.79
CS-232ENST00000552331 KIAA0754O94854 1291 aa3.84□□□□□ -1.79
CS-232ENST00000552331 PGM3O95394 542 aa3.84□□□□□ -1.79
CS-232ENST00000552331 APBB3O95704 486 aa3.84□□□□□ -1.79
CS-232ENST00000552331 TGFB1P01137 390 aa3.84□□□□□ -1.79
CS-232ENST00000552331 MT-ND5P03915 603 aa3.84□□□□□ -1.79
CS-232ENST00000552331 AMY2AP04746 511 aa3.84□□□□□ -1.79
CS-232ENST00000552331 PRKCBP05771 671 aa3.84□□□□□ -1.79
CS-232ENST00000552331 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP3.84□□□□□ -1.79
CS-232ENST00000552331 TMEM253P0C7T8 217 aa3.84□□□□□ -1.79
CS-232ENST00000552331 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP3.84□□□□□ -1.79
CS-232ENST00000552331 GNAT1P11488 350 aa3.84□□□□□ -1.79
CS-232ENST00000552331 SFTPCP11686 197 aa3.84□□□□□ -1.79
CS-232ENST00000552331 LAMP2P13473 410 aa3.84□□□□□ -1.79
CS-232ENST00000552331 NPR1P16066 1061 aa3.84□□□□□ -1.79
CS-232ENST00000552331 AMY2BP19961 511 aa3.84□□□□□ -1.79
CS-232ENST00000552331 TGM1P22735 817 aa3.84□□□□□ -1.79
CS-232ENST00000552331 ABCD3P28288 659 aa3.84□□□□□ -1.79
CS-232ENST00000552331 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP3.84□□□□□ -1.79
CS-232ENST00000552331 THPOP40225 353 aa3.84□□□□□ -1.79
CS-232ENST00000552331 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP3.84□□□□□ -1.79
CS-232ENST00000552331 DPP6P42658 865 aa3.84□□□□□ -1.79
CS-232ENST00000552331 PAFAH1B1P43034 410 aa3.84□□□□□ -1.79
CS-232ENST00000552331 PSMC4P43686 418 aa3.84□□□□□ -1.79
CS-232ENST00000552331 KCNC1P48547 511 aa3.84□□□□□ -1.79
CS-232ENST00000552331 TRPC1P48995 793 aa3.84□□□□□ -1.79
CS-232ENST00000552331 FNTBP49356 437 aa3.84□□□□□ -1.79
CS-232ENST00000552331 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP3.84□□□□□ -1.79
CS-232ENST00000552331 SEC24CP53992 1094 aa3.84□□□□□ -1.79
CS-232ENST00000552331 RARSP54136 660 aaKnown RBP3.84□□□□□ -1.79
CS-232ENST00000552331 RAD23AP54725 363 aa3.84□□□□□ -1.79
CS-232ENST00000552331 AP2B1P63010 937 aa3.84□□□□□ -1.79
CS-232ENST00000552331 CCT2P78371 535 aaKnown RBP3.84□□□□□ -1.79
CS-232ENST00000552331 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP3.84□□□□□ -1.79
CS-232ENST00000552331 SPIRE1Q08AE8 756 aa3.84□□□□□ -1.79
CS-232ENST00000552331 CDK5R2Q13319 367 aa3.84□□□□□ -1.79
CS-232ENST00000552331 TMEM132BQ14DG7 1078 aa3.84□□□□□ -1.79
CS-232ENST00000552331 NR0B2Q15466 257 aa3.84□□□□□ -1.79
CS-232ENST00000552331 KYNUQ16719 465 aa3.84□□□□□ -1.79
CS-232ENST00000552331 WSCD2Q2TBF2 565 aa3.84□□□□□ -1.79
CS-232ENST00000552331 C3orf38Q5JPI3 329 aa3.84□□□□□ -1.79
CS-232ENST00000552331 NAA35Q5VZE5 725 aa3.84□□□□□ -1.79
CS-232ENST00000552331 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa3.84□□□□□ -1.79
CS-232ENST00000552331 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa3.84□□□□□ -1.79
CS-232ENST00000552331 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa3.84□□□□□ -1.79
CS-232ENST00000552331 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa3.84□□□□□ -1.79
CS-232ENST00000552331 ZNF804AQ7Z570 1209 aa3.84□□□□□ -1.79
CS-232ENST00000552331 PXKQ7Z7A4 578 aa3.84□□□□□ -1.79
CS-232ENST00000552331 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP3.84□□□□□ -1.79
CS-232ENST00000552331 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP3.84□□□□□ -1.79
CS-232ENST00000552331 SH2D3CQ8N5H7 860 aa3.84□□□□□ -1.79
CS-232ENST00000552331 TSPEARQ8WU66 669 aa3.84□□□□□ -1.79
CS-232ENST00000552331 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa3.84□□□□□ -1.79
CS-232ENST00000552331 RNF141Q8WVD5 230 aa3.84□□□□□ -1.79
CS-232ENST00000552331 GIMAP1Q8WWP7 306 aa3.84□□□□□ -1.79
CS-232ENST00000552331 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP3.84□□□□□ -1.79
CS-232ENST00000552331 DLG3Q92796 817 aa3.84□□□□□ -1.79
CS-232ENST00000552331 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP3.84□□□□□ -1.79
CS-232ENST00000552331 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP3.84□□□□□ -1.79
CS-232ENST00000552331 VPS39Q96JC1 886 aa3.84□□□□□ -1.79
CS-232ENST00000552331 CABS1Q96KC9 395 aa3.84□□□□□ -1.79
CS-232ENST00000552331 C16orf92Q96LL3 132 aa3.84□□□□□ -1.79
CS-232ENST00000552331 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP3.84□□□□□ -1.79
CS-232ENST00000552331 MMP19Q99542 508 aa3.84□□□□□ -1.79
CS-232ENST00000552331 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP3.84□□□□□ -1.79
CS-232ENST00000552331 MCMBPQ9BTE3 642 aa3.84□□□□□ -1.79
CS-232ENST00000552331 MAGEB5Q9BZ81 275 aa3.84□□□□□ -1.79
CS-232ENST00000552331 SEMA6CQ9H3T2 930 aa3.84□□□□□ -1.79
CS-232ENST00000552331 RNPEPQ9H4A4 650 aa3.84□□□□□ -1.79
CS-232ENST00000552331 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP3.84□□□□□ -1.79
CS-232ENST00000552331 FANCFQ9NPI8 374 aa3.84□□□□□ -1.79
CS-232ENST00000552331 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa3.84□□□□□ -1.79
CS-232ENST00000552331 CHST7Q9NS84 486 aa3.84□□□□□ -1.79
CS-232ENST00000552331 TBC1D14Q9P2M4 693 aa3.84□□□□□ -1.79
CS-232ENST00000552331 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP3.84□□□□□ -1.79
CS-232ENST00000552331 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP3.84□□□□□ -1.79
CS-232ENST00000552331 PCSK1NQ9UHG2 260 aa3.84□□□□□ -1.79
CS-232ENST00000552331 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP3.84□□□□□ -1.79
CS-232ENST00000552331 TRIM17Q9Y577 477 aa3.84□□□□□ -1.79
CS-232ENST00000552331 NUMBLQ9Y6R0 609 aa3.84□□□□□ -1.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.7 ms