RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548849.5

CS-214, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 1,028 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-214ENST00000548849 CCINQ13939 588 aa18.37■□□□□ 0.53
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CS-214ENST00000548849 PPM1JQ5JR12 505 aa18.37■□□□□ 0.53
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CS-214ENST00000548849 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP18.35■□□□□ 0.53
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CS-214ENST00000548849 TMX3Q96JJ7 454 aa18.34■□□□□ 0.53
CS-214ENST00000548849 ZMYM5Q9UJ78 669 aa18.34■□□□□ 0.53
CS-214ENST00000548849 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa18.34■□□□□ 0.53
CS-214ENST00000548849 TCHHQ07283 1943 aa18.33■□□□□ 0.53
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CS-214ENST00000548849 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP18.33■□□□□ 0.52
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CS-214ENST00000548849 EBF3Q9H4W6 596 aa18.33■□□□□ 0.52
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CS-214ENST00000548849 CCL26Q9Y258 94 aa18.33■□□□□ 0.52
CS-214ENST00000548849 STYXL1Q9Y6J8 313 aa18.33■□□□□ 0.52
CS-214ENST00000548849 TPRP12270 2363 aaKnown RBP18.32■□□□□ 0.52
CS-214ENST00000548849 ATG13O75143 517 aa18.32■□□□□ 0.52
CS-214ENST00000548849 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP18.32■□□□□ 0.52
CS-214ENST00000548849 F11P03951 625 aa18.32■□□□□ 0.52
CS-214ENST00000548849 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP18.32■□□□□ 0.525e-8■■■■■ 43.3
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CS-214ENST00000548849 C8orf34Q49A92 452 aa18.32■□□□□ 0.52
CS-214ENST00000548849 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP18.32■□□□□ 0.52
CS-214ENST00000548849 TXNDC8Q6A555 127 aa18.32■□□□□ 0.52
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CS-214ENST00000548849 FSTL4Q6MZW2 842 aa18.32■□□□□ 0.52
CS-214ENST00000548849 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP18.32■□□□□ 0.52
CS-214ENST00000548849 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP18.32■□□□□ 0.52
CS-214ENST00000548849 DYMQ7RTS9 669 aa18.32■□□□□ 0.52
CS-214ENST00000548849 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa18.32■□□□□ 0.52
CS-214ENST00000548849 TMEM150AQ86TG1 271 aa18.32■□□□□ 0.52
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CS-214ENST00000548849 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP18.32■□□□□ 0.52
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CS-214ENST00000548849 CCSER1Q9C0I3 900 aa18.32■□□□□ 0.52
CS-214ENST00000548849 IKZF4Q9H2S9 585 aa18.32■□□□□ 0.52
CS-214ENST00000548849 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa18.32■□□□□ 0.52
CS-214ENST00000548849 HPS4Q9NQG7 708 aa18.32■□□□□ 0.52
CS-214ENST00000548849 TDP1Q9NUW8 608 aa18.32■□□□□ 0.52
CS-214ENST00000548849 TMLHEQ9NVH6 421 aa18.32■□□□□ 0.52
CS-214ENST00000548849 SMC3Q9UQE7 1217 aa18.32■□□□□ 0.52
CS-214ENST00000548849 CACNA1BQ00975 2339 aa18.32■□□□□ 0.52
CS-214ENST00000548849 RPP40O75818 363 aaKnown RBP18.31■□□□□ 0.52
CS-214ENST00000548849 IL18RAPO95256 599 aa18.31■□□□□ 0.52
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