RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548092.5

TRAFD1-204, Transcript of TRAF-type zinc finger domain containing 1, humanhuman

TSL 3

Gene TRAFD1, Length 584 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAFD1-204ENST00000548092 NRN1LQ496H8 165 aa4.9□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 C2orf27AQ580R0 203 aa4.9□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 GRAMD4Q6IC98 578 aa4.9□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 WDR63Q8IWG1 891 aa4.9□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 KIAA2013Q8IYS2 634 aa4.9□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 OR14K1Q8NGZ2 314 aa4.9□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 NEK9Q8TD19 979 aa4.9□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 FERMT2Q96AC1 680 aa4.9□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 FAM89AQ96GI7 184 aa4.9□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 MRIQ9BWK5 157 aa4.9□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 PCED1AQ9H1Q7 454 aa4.9□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 OR10A2Q9H208 303 aa4.9□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 KANSL2Q9H9L4 492 aa4.9□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 CERS4Q9HA82 394 aa4.9□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 LMBRD1Q9NUN5 540 aa4.9□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 SPTLC3Q9NUV7 552 aa4.9□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 HECAQ9UBI9 543 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 ZNF112Q9UJU3 913 aa4.9□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa4.9□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 NPIPB8E9PQR5 432 aa4.89□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 APAF1O14727 1248 aa4.89□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 CA3P07451 260 aa4.89□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 CSF2RAP15509 400 aa4.89□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 RGS2P41220 211 aa4.89□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 CCT4P50991 539 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 ANTXR2P58335 489 aa4.89□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 ADAM15Q13444 863 aa4.89□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 SYCP1Q15431 976 aa4.89□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa4.89□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 BMP2KLQ5H9B9 411 aa4.89□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 MIIPQ5JXC2 388 aa4.89□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 RNF207Q6ZRF8 634 aa4.89□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 POLNQ7Z5Q5 900 aa4.89□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 TRPV1Q8NER1 839 aa4.89□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 ARNTL2Q8WYA1 636 aa4.89□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 ANKRD7Q92527 254 aa4.89□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 HOOK2Q96ED9 719 aa4.89□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 PLA2G3Q9NZ20 509 aa4.89□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 MORF4L1Q9UBU8 362 aa4.89□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 KNSTRNQ9Y448 316 aa4.89□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 NOTCH2Q04721 2471 aa4.88□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 DNHD1Q96M86 4753 aa4.88□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 H3BQ06 376 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 M0R2C6 588 aa4.88□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 CYR61O00622 381 aa4.88□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 PLD2O14939 933 aa4.88□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 NPTXRO95502 500 aa4.88□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 CNGA1P29973 690 aa4.88□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 STAT3P40763 770 aa4.88□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 MEOX1P50221 254 aa4.88□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 HMGA2P52926 109 aa4.88□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 FAM193AP78312 1265 aa4.88□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 NUCB2P80303 420 aa4.88□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 DMWDQ09019 674 aa4.88□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 SQSTM1Q13501 440 aa4.88□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 LRRC41Q15345 812 aa4.88□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 PROSER3Q2NL68 480 aa4.88□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 TAF7LQ5H9L4 462 aa4.88□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 TREML2Q5T2D2 321 aa4.88□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 MFSD14CQ5VZR4 134 aa4.88□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa4.88□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 IL17DQ8TAD2 202 aa4.88□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 WDR48Q8TAF3 677 aa4.88□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 PIBF1Q8WXW3 757 aa4.88□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 FEZ1Q99689 392 aa4.88□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 CD209Q9NNX6 404 aa4.88□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 IL23AQ9NPF7 189 aa4.88□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 FLRT1Q9NZU1 646 aa4.88□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 SAMD15Q9P1V8 674 aa4.88□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 FAM184BQ9ULE4 1060 aa4.88□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 FAM50BQ9Y247 325 aa4.88□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa4.88□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 COL4A3Q01955 1670 aa4.88□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 COL12A1Q99715 3063 aa4.87□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 MYO7AQ13402 2215 aa4.87□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 LOC285556D6RIA3 1793 aa4.87□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 C2orf78A6NCI8 922 aa4.87□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 CTIFO43310 598 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 HIP1RO75146 1068 aa4.87□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 C1SP09871 688 aa4.87□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 CYBAP13498 195 aa4.87□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 SDSP20132 328 aa4.87□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 APEX1P27695 318 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
TRAFD1-204ENST00000548092 RPS19P39019 145 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.3 ms