RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546891.5

CS-205, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 911 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-205ENST00000546891 LRRC37A2A6NM11 1700 aa10.33□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa10.32□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa10.32□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa10.32□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 SIGLEC16A6NMB1 481 aa10.32□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 STAU1O95793 577 aaKnown RBP10.32□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 EDN1P05305 212 aa10.32□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa10.32□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 DESP17661 470 aa10.32□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 CD58P19256 250 aa10.32□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 BRD2P25440 801 aaKnown RBP10.32□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 CHKAP35790 457 aa10.32□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 GJC1P36383 396 aa10.32□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 MAGEA4P43358 317 aa10.32□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 ASPAP45381 313 aa10.32□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 SLCO1A2P46721 670 aa10.32□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 SLC18A1P54219 525 aa10.32□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP10.32□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP10.32□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 STILQ15468 1287 aa10.32□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 LONRF1Q17RB8 773 aa10.32□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa10.32□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 CENPUQ71F23 418 aa10.32□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 PIGWQ7Z7B1 504 aa10.32□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 EXOC3L1Q86VI1 746 aa10.32□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 RHPN2Q8IUC4 686 aa10.32□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP10.32□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 MDM1Q8TC05 714 aa10.32□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 GRAMD1AQ96CP6 724 aa10.32□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 FAM212AQ96EL1 285 aa10.32□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 SGSM3Q96HU1 749 aa10.32□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 BCO2Q9BYV7 579 aa10.32□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 ERAP1Q9NZ08 941 aa10.32□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 KIAA1257Q9ULG3 409 aa10.32□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP10.32□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 TMEM120BA0PK00 339 aa10.31□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 CCT8L1PA6NM43 557 aa10.31□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 ANKRD65E5RJM6 399 aa10.31□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa10.31□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 O00370 1275 aa10.31□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 TP73O15350 636 aa10.31□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 CAPN15O75808 1086 aa10.31□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 CNMDO75829 334 aa10.31□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP10.31□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 SUN1O94901 812 aa10.31□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 CST3P01034 146 aaPredicted RBP10.31□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 CALCAP01258 141 aa10.31□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 VIMP08670 466 aaKnown RBP10.31□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 KRT3P12035 628 aa10.31□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 CD19P15391 556 aa10.31□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP10.31□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 PSMA2P25787 234 aa10.31□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 MARK3P27448 753 aa10.31□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 PHBP35232 272 aa10.31□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 TNFSF9P41273 254 aa10.31□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 CDKN2BP42772 138 aa10.31□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP10.31□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 SNX16P57768 344 aa10.31□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 CCNA1P78396 465 aa10.31□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 MBTD1Q05BQ5 628 aa10.31□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 FSTL1Q12841 308 aa10.31□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 LAMC2Q13753 1193 aa10.31□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 OASLQ15646 514 aaKnown RBP10.31□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 QPCTQ16769 361 aa10.31□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 LY6KQ17RY6 165 aa10.31□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 P3H1Q32P28 736 aa10.31□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 CCDC62Q6P9F0 684 aa10.31□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 MFSD7Q6UXD7 560 aa10.31□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa10.31□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 PACS2Q86VP3 889 aa10.31□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 ELMO3Q96BJ8 720 aa10.31□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP10.31□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP10.31□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP10.31□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP10.31□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 DNAI2Q9GZS0 605 aa10.31□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 XYLT2Q9H1B5 865 aa10.31□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 CDT1Q9H211 546 aa10.31□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 SYNCQ9H7C4 482 aa10.31□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 SLC24A2Q9UI40 661 aa10.31□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 PNMA3Q9UL41 463 aa10.31□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 FZD1Q9UP38 647 aa10.31□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP10.31□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP10.31□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa10.3□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 LRRD1A4D1F6 860 aa10.3□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 CFAP73A6NFT4 308 aa10.3□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 ZBTB42B2RXF5 422 aa10.3□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 RNF8O76064 485 aa10.3□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 HMGCRP04035 888 aa10.3□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 CFHP08603 1231 aa10.3□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 VDRP11473 427 aa10.3□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 BRAFP15056 766 aa10.3□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 STX2P32856 288 aa10.3□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 VPS41P49754 854 aa10.3□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 ARSEP51690 589 aa10.3□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP10.3□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP10.3□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP10.3□□□□□ -0.76
CS-205ENST00000546891 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP10.3□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 97.9 ms