RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546480.1

VENTXP3-201, Transcript of VENT homeobox pseudogene 3, humanhuman

BASIC

Gene VENTXP3, Length 773 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VENTXP3-201ENST00000546480 PTPN2P17706 415 aa14.75□□□□□ -0.05
VENTXP3-201ENST00000546480 RAP1GAPP47736 663 aa14.75□□□□□ -0.05
VENTXP3-201ENST00000546480 EPHB3P54753 998 aa14.75□□□□□ -0.05
VENTXP3-201ENST00000546480 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
VENTXP3-201ENST00000546480 TAF12Q16514 161 aa14.75□□□□□ -0.05
VENTXP3-201ENST00000546480 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
VENTXP3-201ENST00000546480 CLEC17AQ6ZS10 378 aa14.75□□□□□ -0.05
VENTXP3-201ENST00000546480 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
VENTXP3-201ENST00000546480 SV2AQ7L0J3 742 aa14.75□□□□□ -0.05
VENTXP3-201ENST00000546480 RTL10Q7L3V2 364 aa14.75□□□□□ -0.05
VENTXP3-201ENST00000546480 DPH6Q7L8W6 267 aa14.75□□□□□ -0.05
VENTXP3-201ENST00000546480 CREBRFQ8IUR6 639 aa14.75□□□□□ -0.05
VENTXP3-201ENST00000546480 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
VENTXP3-201ENST00000546480 TTC9BQ8N6N2 239 aa14.75□□□□□ -0.05
VENTXP3-201ENST00000546480 SPPL2BQ8TCT7 592 aa14.75□□□□□ -0.05
VENTXP3-201ENST00000546480 ING5Q8WYH8 240 aa14.75□□□□□ -0.05
VENTXP3-201ENST00000546480 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP14.75□□□□□ -0.05
VENTXP3-201ENST00000546480 SYT15Q9BQS2 421 aa14.75□□□□□ -0.05
VENTXP3-201ENST00000546480 ACBD6Q9BR61 282 aa14.75□□□□□ -0.05
VENTXP3-201ENST00000546480 PI4K2AQ9BTU6 479 aa14.75□□□□□ -0.05
VENTXP3-201ENST00000546480 MKNK1Q9BUB5 465 aa14.75□□□□□ -0.05
VENTXP3-201ENST00000546480 CRISPLD1Q9H336 500 aa14.75□□□□□ -0.05
VENTXP3-201ENST00000546480 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
VENTXP3-201ENST00000546480 LIMD1Q9UGP4 676 aa14.75□□□□□ -0.05
VENTXP3-201ENST00000546480 GTF3C4Q9UKN8 822 aa14.75□□□□□ -0.05
VENTXP3-201ENST00000546480 MAFFQ9ULX9 164 aa14.75□□□□□ -0.05
VENTXP3-201ENST00000546480 USTQ9Y2C2 406 aa14.75□□□□□ -0.05
VENTXP3-201ENST00000546480 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
VENTXP3-201ENST00000546480 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa14.75□□□□□ -0.05
VENTXP3-201ENST00000546480 A8MXQ7 604 aa14.74□□□□□ -0.05
VENTXP3-201ENST00000546480 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa14.74□□□□□ -0.05
VENTXP3-201ENST00000546480 DCXO43602 365 aa14.74□□□□□ -0.05
VENTXP3-201ENST00000546480 VNN1O95497 513 aa14.74□□□□□ -0.05
VENTXP3-201ENST00000546480 HLA-DRAP01903 254 aa14.74□□□□□ -0.05
VENTXP3-201ENST00000546480 RHOP08100 348 aa14.74□□□□□ -0.05
VENTXP3-201ENST00000546480 MYL4P12829 197 aa14.74□□□□□ -0.05
VENTXP3-201ENST00000546480 ALADP13716 330 aa14.74□□□□□ -0.05
VENTXP3-201ENST00000546480 BMP6P22004 513 aa14.74□□□□□ -0.05
VENTXP3-201ENST00000546480 MXI1P50539 228 aa14.74□□□□□ -0.05
VENTXP3-201ENST00000546480 CLDN10P78369 228 aa14.74□□□□□ -0.05
VENTXP3-201ENST00000546480 CYP27A1Q02318 531 aa14.74□□□□□ -0.05
VENTXP3-201ENST00000546480 PPP3CAQ08209 521 aa14.74□□□□□ -0.05
VENTXP3-201ENST00000546480 VEPH1Q14D04 833 aa14.74□□□□□ -0.05
VENTXP3-201ENST00000546480 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
VENTXP3-201ENST00000546480 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa14.74□□□□□ -0.05
VENTXP3-201ENST00000546480 ZACNQ401N2 412 aa14.74□□□□□ -0.05
VENTXP3-201ENST00000546480 CYP4A22Q5TCH4 519 aa14.74□□□□□ -0.05
VENTXP3-201ENST00000546480 KRT39Q6A163 491 aa14.74□□□□□ -0.05
VENTXP3-201ENST00000546480 SPOPLQ6IQ16 392 aa14.74□□□□□ -0.05
VENTXP3-201ENST00000546480 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
VENTXP3-201ENST00000546480 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa14.74□□□□□ -0.05
VENTXP3-201ENST00000546480 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
VENTXP3-201ENST00000546480 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa14.74□□□□□ -0.05
VENTXP3-201ENST00000546480 SMYD3Q9H7B4 428 aa14.74□□□□□ -0.05
VENTXP3-201ENST00000546480 TMEM8AQ9HCN3 771 aa14.74□□□□□ -0.05
VENTXP3-201ENST00000546480 ASAH2Q9NR71 780 aa14.74□□□□□ -0.05
VENTXP3-201ENST00000546480 TMLHEQ9NVH6 421 aa14.74□□□□□ -0.05
VENTXP3-201ENST00000546480 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
VENTXP3-201ENST00000546480 VNN2O95498 520 aa14.73□□□□□ -0.05
VENTXP3-201ENST00000546480 STAU1O95793 577 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
VENTXP3-201ENST00000546480 ASGR2P07307 311 aa14.73□□□□□ -0.05
VENTXP3-201ENST00000546480 WARSP23381 471 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
VENTXP3-201ENST00000546480 LMO2P25791 158 aa14.73□□□□□ -0.05
VENTXP3-201ENST00000546480 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
VENTXP3-201ENST00000546480 TUFMP49411 452 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
VENTXP3-201ENST00000546480 CDH8P55286 799 aa14.73□□□□□ -0.05
VENTXP3-201ENST00000546480 SMARCB1Q12824 385 aa14.73□□□□□ -0.05
VENTXP3-201ENST00000546480 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
VENTXP3-201ENST00000546480 C1orf220Q5T0J3 134 aa14.73□□□□□ -0.05
VENTXP3-201ENST00000546480 LRRTM3Q86VH5 581 aa14.73□□□□□ -0.05
VENTXP3-201ENST00000546480 HS6ST3Q8IZP7 471 aa14.73□□□□□ -0.05
VENTXP3-201ENST00000546480 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
VENTXP3-201ENST00000546480 ITFG1Q8TB96 612 aa14.73□□□□□ -0.05
VENTXP3-201ENST00000546480 SPATA18Q8TC71 538 aa14.73□□□□□ -0.05
VENTXP3-201ENST00000546480 TAS1R2Q8TE23 839 aa14.73□□□□□ -0.05
VENTXP3-201ENST00000546480 GIPC2Q8TF65 315 aa14.73□□□□□ -0.05
VENTXP3-201ENST00000546480 MYADMQ96S97 322 aa14.73□□□□□ -0.05
VENTXP3-201ENST00000546480 LPIN3Q9BQK8 851 aa14.73□□□□□ -0.05
VENTXP3-201ENST00000546480 EPHX3Q9H6B9 360 aa14.73□□□□□ -0.05
VENTXP3-201ENST00000546480 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP14.73□□□□□ -0.05
VENTXP3-201ENST00000546480 CEP72Q9P209 647 aa14.73□□□□□ -0.05
VENTXP3-201ENST00000546480 CDH9Q9ULB4 789 aa14.73□□□□□ -0.05
VENTXP3-201ENST00000546480 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
VENTXP3-201ENST00000546480 ATP2C2O75185 946 aa14.72□□□□□ -0.05
VENTXP3-201ENST00000546480 POU2F2P09086 479 aa14.72□□□□□ -0.05
VENTXP3-201ENST00000546480 CCDC142Q17RM4 750 aa14.72□□□□□ -0.05
VENTXP3-201ENST00000546480 MDH1BQ5I0G3 518 aa14.72□□□□□ -0.05
VENTXP3-201ENST00000546480 C4orf50Q6ZRC1 276 aa14.72□□□□□ -0.05
VENTXP3-201ENST00000546480 ITIH5Q86UX2 942 aa14.72□□□□□ -0.05
VENTXP3-201ENST00000546480 SCN4BQ8IWT1 228 aa14.72□□□□□ -0.05
VENTXP3-201ENST00000546480 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa14.72□□□□□ -0.05
VENTXP3-201ENST00000546480 GPR152Q8TDT2 470 aa14.72□□□□□ -0.05
VENTXP3-201ENST00000546480 TAF4BQ92750 862 aa14.72□□□□□ -0.05
VENTXP3-201ENST00000546480 MYLPFQ96A32 169 aa14.72□□□□□ -0.05
VENTXP3-201ENST00000546480 MCRS1Q96EZ8 462 aa14.72□□□□□ -0.05
VENTXP3-201ENST00000546480 CEP63Q96MT8 703 aa14.72□□□□□ -0.05
VENTXP3-201ENST00000546480 XYLT2Q9H1B5 865 aa14.72□□□□□ -0.05
VENTXP3-201ENST00000546480 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa14.72□□□□□ -0.05
VENTXP3-201ENST00000546480 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
VENTXP3-201ENST00000546480 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.2 ms