RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543190.5

LTBR-211, Transcript of lymphotoxin beta receptor, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene LTBR, Length 785 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBR-211ENST00000543190 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
LTBR-211ENST00000543190 ABCB6Q9NP58 842 aa20.13■□□□□ 0.81
LTBR-211ENST00000543190 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa20.13■□□□□ 0.81
LTBR-211ENST00000543190 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
LTBR-211ENST00000543190 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP20.12■□□□□ 0.81
LTBR-211ENST00000543190 GABRR2P28476 465 aa20.12■□□□□ 0.81
LTBR-211ENST00000543190 NASPP49321 788 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
LTBR-211ENST00000543190 KCNA1Q09470 495 aa20.12■□□□□ 0.81
LTBR-211ENST00000543190 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
LTBR-211ENST00000543190 SLC39A12Q504Y0 691 aa20.12■□□□□ 0.81
LTBR-211ENST00000543190 DYMQ7RTS9 669 aa20.12■□□□□ 0.81
LTBR-211ENST00000543190 LRRTM3Q86VH5 581 aa20.12■□□□□ 0.81
LTBR-211ENST00000543190 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
LTBR-211ENST00000543190 TMEM86AQ8N2M4 240 aa20.12■□□□□ 0.81
LTBR-211ENST00000543190 SYNPOQ8N3V7 929 aa20.12■□□□□ 0.81
LTBR-211ENST00000543190 SPEM1Q8N4L4 309 aa20.12■□□□□ 0.81
LTBR-211ENST00000543190 LRRC3BQ96PB8 259 aa20.12■□□□□ 0.81
LTBR-211ENST00000543190 GDAP2Q9NXN4 497 aa20.12■□□□□ 0.81
LTBR-211ENST00000543190 SPTBN2O15020 2390 aa20.12■□□□□ 0.81
LTBR-211ENST00000543190 LRRC32Q14392 662 aa20.11■□□□□ 0.81
LTBR-211ENST00000543190 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP20.11■□□□□ 0.81
LTBR-211ENST00000543190 DGKKQ5KSL6 1271 aa20.11■□□□□ 0.81
LTBR-211ENST00000543190 STXBP5Q5T5C0 1151 aa20.11■□□□□ 0.81
LTBR-211ENST00000543190 WSCD1Q658N2 575 aa20.11■□□□□ 0.81
LTBR-211ENST00000543190 CNNM4Q6P4Q7 775 aa20.11■□□□□ 0.81
LTBR-211ENST00000543190 LIMS2Q7Z4I7 341 aa20.11■□□□□ 0.81
LTBR-211ENST00000543190 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa20.11■□□□□ 0.81
LTBR-211ENST00000543190 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
LTBR-211ENST00000543190 RMDN1Q96DB5 314 aa20.11■□□□□ 0.81
LTBR-211ENST00000543190 ACBD6Q9BR61 282 aa20.11■□□□□ 0.81
LTBR-211ENST00000543190 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
LTBR-211ENST00000543190 ATXN3LQ9H3M9 355 aa20.11■□□□□ 0.81
LTBR-211ENST00000543190 LMAN1LQ9HAT1 526 aa20.11■□□□□ 0.81
LTBR-211ENST00000543190 ITGA11Q9UKX5 1188 aa20.11■□□□□ 0.81
LTBR-211ENST00000543190 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
LTBR-211ENST00000543190 CTHP32929 405 aa20.1■□□□□ 0.81
LTBR-211ENST00000543190 TMEM150AQ86TG1 271 aa20.1■□□□□ 0.81
LTBR-211ENST00000543190 YAF2Q8IY57 180 aa20.1■□□□□ 0.81
LTBR-211ENST00000543190 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
LTBR-211ENST00000543190 C1orf127Q8N9H9 656 aa20.1■□□□□ 0.81
LTBR-211ENST00000543190 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
LTBR-211ENST00000543190 MYRFLQ96LU7 910 aa20.1■□□□□ 0.81
LTBR-211ENST00000543190 CLIC6Q96NY7 704 aa20.1■□□□□ 0.81
LTBR-211ENST00000543190 PKMYT1Q99640 499 aa20.1■□□□□ 0.81
LTBR-211ENST00000543190 TMEM206Q9H813 350 aa20.1■□□□□ 0.81
LTBR-211ENST00000543190 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
LTBR-211ENST00000543190 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
LTBR-211ENST00000543190 MTMR6Q9Y217 621 aa20.1■□□□□ 0.81
LTBR-211ENST00000543190 TPRP12270 2363 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
LTBR-211ENST00000543190 GABRDO14764 452 aa20.09■□□□□ 0.81
LTBR-211ENST00000543190 EXTL3O43909 919 aa20.09■□□□□ 0.81
LTBR-211ENST00000543190 SDHBP21912 280 aa20.09■□□□□ 0.81
LTBR-211ENST00000543190 CCNE1P24864 410 aa20.09■□□□□ 0.81
LTBR-211ENST00000543190 CNR2P34972 360 aa20.09■□□□□ 0.81
LTBR-211ENST00000543190 CASP5P51878 434 aa20.09■□□□□ 0.81
LTBR-211ENST00000543190 CCINQ13939 588 aa20.09■□□□□ 0.81
LTBR-211ENST00000543190 GPR158Q5T848 1215 aa20.09■□□□□ 0.81
LTBR-211ENST00000543190 DPH6Q7L8W6 267 aa20.09■□□□□ 0.81
LTBR-211ENST00000543190 KIAA2013Q8IYS2 634 aa20.09■□□□□ 0.81
LTBR-211ENST00000543190 CMTM8Q8IZV2 173 aa20.09■□□□□ 0.81
LTBR-211ENST00000543190 BPIFB1Q8TDL5 484 aa20.09■□□□□ 0.81
LTBR-211ENST00000543190 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
LTBR-211ENST00000543190 CEP295NLQ96MC4 621 aa20.09■□□□□ 0.81
LTBR-211ENST00000543190 USP28Q96RU2 1077 aa20.09■□□□□ 0.81
LTBR-211ENST00000543190 IKZF4Q9H2S9 585 aa20.09■□□□□ 0.81
LTBR-211ENST00000543190 CUEDC2Q9H467 287 aa20.09■□□□□ 0.81
LTBR-211ENST00000543190 KIF9Q9HAQ2 790 aa20.09■□□□□ 0.81
LTBR-211ENST00000543190 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa20.09■□□□□ 0.81
LTBR-211ENST00000543190 HELZP42694 1942 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
LTBR-211ENST00000543190 A0A087X0B3 334 aa20.08■□□□□ 0.81
LTBR-211ENST00000543190 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa20.08■□□□□ 0.81
LTBR-211ENST00000543190 LRP3O75074 770 aa20.08■□□□□ 0.81
LTBR-211ENST00000543190 PRAMEF12O95522 483 aa20.08■□□□□ 0.81
LTBR-211ENST00000543190 F11P03951 625 aa20.08■□□□□ 0.81
LTBR-211ENST00000543190 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
LTBR-211ENST00000543190 TGM1P22735 817 aa20.08■□□□□ 0.81
LTBR-211ENST00000543190 CXCL12P48061 93 aa20.08■□□□□ 0.81
LTBR-211ENST00000543190 WNT7BP56706 349 aa20.08■□□□□ 0.81
LTBR-211ENST00000543190 NLRP12P59046 1061 aa20.08■□□□□ 0.81
LTBR-211ENST00000543190 TSPY1Q01534 308 aa20.08■□□□□ 0.81
LTBR-211ENST00000543190 GAS6Q14393 721 aa20.08■□□□□ 0.81
LTBR-211ENST00000543190 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
LTBR-211ENST00000543190 MGAT5BQ3V5L5 792 aa20.08■□□□□ 0.81
LTBR-211ENST00000543190 CFAP221Q4G0U5 840 aa20.08■□□□□ 0.81
LTBR-211ENST00000543190 WDR44Q5JSH3 913 aa20.08■□□□□ 0.81
LTBR-211ENST00000543190 PDCL2Q8N4E4 241 aa20.08■□□□□ 0.81
LTBR-211ENST00000543190 TOP6BLQ8N6T0 577 aa20.08■□□□□ 0.81
LTBR-211ENST00000543190 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP20.08■□□□□ 0.81
LTBR-211ENST00000543190 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
LTBR-211ENST00000543190 LPIN3Q9BQK8 851 aa20.08■□□□□ 0.81
LTBR-211ENST00000543190 FAM83CQ9BQN1 747 aa20.08■□□□□ 0.81
LTBR-211ENST00000543190 FAM213AQ9BRX8 229 aa20.08■□□□□ 0.81
LTBR-211ENST00000543190 SLC46A2Q9BY10 475 aa20.08■□□□□ 0.81
LTBR-211ENST00000543190 LRRC27Q9C0I9 530 aa20.08■□□□□ 0.81
LTBR-211ENST00000543190 TNMDQ9H2S6 317 aa20.08■□□□□ 0.81
LTBR-211ENST00000543190 KBTBD4Q9NVX7 518 aa20.08■□□□□ 0.81
LTBR-211ENST00000543190 DPYSL4O14531 572 aa20.07■□□□□ 0.8
LTBR-211ENST00000543190 PPP6R2O75170 966 aa20.07■□□□□ 0.8
LTBR-211ENST00000543190 SOAT2O75908 522 aa20.07■□□□□ 0.8
LTBR-211ENST00000543190 GCNT3O95395 438 aa20.07■□□□□ 0.8
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