RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540240.1

C16orf62-212, Transcript of UPF0505 protein C16orf62, humanhuman

TSL 3

Gene C16orf62, Length 633 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf62-212ENST00000540240 TBC1D17Q9HA65 648 aa8.52□□□□□ -1.05
C16orf62-212ENST00000540240 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa8.52□□□□□ -1.05
C16orf62-212ENST00000540240 CHST7Q9NS84 486 aa8.52□□□□□ -1.05
C16orf62-212ENST00000540240 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
C16orf62-212ENST00000540240 IPPQ9Y573 584 aa8.52□□□□□ -1.05
C16orf62-212ENST00000540240 SNX14Q9Y5W7 946 aa8.52□□□□□ -1.05
C16orf62-212ENST00000540240 C5orf42Q9H799 3197 aa8.51□□□□□ -1.05
C16orf62-212ENST00000540240 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa8.51□□□□□ -1.05
C16orf62-212ENST00000540240 A0A096LPE4 126 aa8.51□□□□□ -1.05
C16orf62-212ENST00000540240 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa8.51□□□□□ -1.05
C16orf62-212ENST00000540240 A0A1W2PPZ6 126 aa8.51□□□□□ -1.05
C16orf62-212ENST00000540240 ARL5CA6NH57 179 aa8.51□□□□□ -1.05
C16orf62-212ENST00000540240 ANHXE9PGG2 379 aa8.51□□□□□ -1.05
C16orf62-212ENST00000540240 CPLX1O14810 134 aa8.51□□□□□ -1.05
C16orf62-212ENST00000540240 B4GALT3O60512 393 aa8.51□□□□□ -1.05
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C16orf62-212ENST00000540240 BAG4O95429 457 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
C16orf62-212ENST00000540240 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP8.51□□□□□ -1.05
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C16orf62-212ENST00000540240 MAGEA9P43362 315 aa8.51□□□□□ -1.05
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C16orf62-212ENST00000540240 STARD6P59095 220 aa8.51□□□□□ -1.05
C16orf62-212ENST00000540240 PTENP60484 403 aa8.51□□□□□ -1.05
C16orf62-212ENST00000540240 CCT2P78371 535 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
C16orf62-212ENST00000540240 XKR9Q5GH70 373 aa8.51□□□□□ -1.05
C16orf62-212ENST00000540240 PPP4R3AQ6IN85 833 aa8.51□□□□□ -1.05
C16orf62-212ENST00000540240 LILRA6Q6PI73 481 aa8.51□□□□□ -1.05
C16orf62-212ENST00000540240 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
C16orf62-212ENST00000540240 DYMQ7RTS9 669 aa8.51□□□□□ -1.05
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C16orf62-212ENST00000540240 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa8.51□□□□□ -1.05
C16orf62-212ENST00000540240 FERMT3Q86UX7 667 aa8.51□□□□□ -1.05
C16orf62-212ENST00000540240 PALB2Q86YC2 1186 aa8.51□□□□□ -1.05
C16orf62-212ENST00000540240 C1orf210Q8IVY1 113 aa8.51□□□□□ -1.05
C16orf62-212ENST00000540240 RSAD2Q8WXG1 361 aa8.51□□□□□ -1.05
C16orf62-212ENST00000540240 TMEM143Q96AN5 459 aa8.51□□□□□ -1.05
C16orf62-212ENST00000540240 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
C16orf62-212ENST00000540240 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
C16orf62-212ENST00000540240 MYADMQ96S97 322 aa8.51□□□□□ -1.05
C16orf62-212ENST00000540240 GAD1Q99259 594 aa8.51□□□□□ -1.05
C16orf62-212ENST00000540240 YIPF2Q9BWQ6 316 aa8.51□□□□□ -1.05
C16orf62-212ENST00000540240 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
C16orf62-212ENST00000540240 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa8.51□□□□□ -1.05
C16orf62-212ENST00000540240 MINDY3Q9H8M7 445 aa8.51□□□□□ -1.05
C16orf62-212ENST00000540240 ARHGEF3Q9NR81 526 aa8.51□□□□□ -1.05
C16orf62-212ENST00000540240 MARCH5Q9NX47 278 aa8.51□□□□□ -1.05
C16orf62-212ENST00000540240 CA14Q9ULX7 337 aa8.51□□□□□ -1.05
C16orf62-212ENST00000540240 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
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C16orf62-212ENST00000540240 TADA2AO75478 443 aa8.5□□□□□ -1.05
C16orf62-212ENST00000540240 RFPL2O75678 378 aa8.5□□□□□ -1.05
C16orf62-212ENST00000540240 REC8O95072 547 aa8.5□□□□□ -1.05
C16orf62-212ENST00000540240 SP9P0CG40 484 aa8.5□□□□□ -1.05
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C16orf62-212ENST00000540240 PRKCQQ04759 706 aa8.5□□□□□ -1.05
C16orf62-212ENST00000540240 HTR4Q13639 388 aa8.5□□□□□ -1.05
C16orf62-212ENST00000540240 EMC2Q15006 297 aa8.5□□□□□ -1.05
C16orf62-212ENST00000540240 ZNF528Q3MIS6 628 aa8.5□□□□□ -1.05
C16orf62-212ENST00000540240 FUT10Q6P4F1 479 aa8.5□□□□□ -1.05
C16orf62-212ENST00000540240 PDXDC1Q6P996 788 aa8.5□□□□□ -1.05
C16orf62-212ENST00000540240 MTSS1LQ765P7 747 aa8.5□□□□□ -1.05
C16orf62-212ENST00000540240 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
C16orf62-212ENST00000540240 RTL10Q7L3V2 364 aa8.5□□□□□ -1.05
C16orf62-212ENST00000540240 NEK8Q86SG6 692 aa8.5□□□□□ -1.05
C16orf62-212ENST00000540240 SLFN12Q8IYM2 578 aa8.5□□□□□ -1.05
C16orf62-212ENST00000540240 KIAA2013Q8IYS2 634 aa8.5□□□□□ -1.05
C16orf62-212ENST00000540240 POU5F2Q8N7G0 328 aa8.5□□□□□ -1.05
C16orf62-212ENST00000540240 FEZF2Q8TBJ5 459 aa8.5□□□□□ -1.05
C16orf62-212ENST00000540240 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
C16orf62-212ENST00000540240 NELL2Q99435 816 aa8.5□□□□□ -1.05
C16orf62-212ENST00000540240 NFKBIZQ9BYH8 718 aa8.5□□□□□ -1.05
C16orf62-212ENST00000540240 OSBPL6Q9BZF3 934 aa8.5□□□□□ -1.05
C16orf62-212ENST00000540240 KCNMB3Q9NPA1 279 aa8.5□□□□□ -1.05
C16orf62-212ENST00000540240 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa8.5□□□□□ -1.05
C16orf62-212ENST00000540240 ADAM28Q9UKQ2 775 aa8.5□□□□□ -1.05
C16orf62-212ENST00000540240 FBXO4Q9UKT5 387 aa8.5□□□□□ -1.05
C16orf62-212ENST00000540240 VAV3Q9UKW4 847 aa8.5□□□□□ -1.05
C16orf62-212ENST00000540240 R4GN57 208 aa8.5□□□□□ -1.05
C16orf62-212ENST00000540240 A0A1W2PP55 124 aa8.49□□□□□ -1.05
C16orf62-212ENST00000540240 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa8.49□□□□□ -1.05
C16orf62-212ENST00000540240 NCAM2O15394 837 aa8.49□□□□□ -1.05
C16orf62-212ENST00000540240 TSPAN1O60635 241 aa8.49□□□□□ -1.05
C16orf62-212ENST00000540240 KINO60870 393 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
C16orf62-212ENST00000540240 CDKL5O76039 1030 aa8.49□□□□□ -1.05
C16orf62-212ENST00000540240 DCNP07585 359 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
C16orf62-212ENST00000540240 SPATA31D3P0C874 917 aa8.49□□□□□ -1.05
C16orf62-212ENST00000540240 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP8.49□□□□□ -1.05
C16orf62-212ENST00000540240 HOXA9P31269 272 aa8.49□□□□□ -1.05
C16orf62-212ENST00000540240 SCNN1GP51170 649 aa8.49□□□□□ -1.05
C16orf62-212ENST00000540240 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
C16orf62-212ENST00000540240 PFKPQ01813 784 aa8.49□□□□□ -1.05
C16orf62-212ENST00000540240 EHHADHQ08426 723 aa8.49□□□□□ -1.05
C16orf62-212ENST00000540240 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
C16orf62-212ENST00000540240 GRIK3Q13003 919 aa8.49□□□□□ -1.05
C16orf62-212ENST00000540240 POU4F3Q15319 338 aa8.49□□□□□ -1.05
C16orf62-212ENST00000540240 INF2Q27J81 1249 aa8.49□□□□□ -1.05
C16orf62-212ENST00000540240 SPECC1Q5M775 1068 aa8.49□□□□□ -1.05
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