RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540101.2

C16orf62-211, Transcript of UPF0505 protein C16orf62, humanhuman

TSL 3

Gene C16orf62, Length 461 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf62-211ENST00000540101 HUS1O60921 280 aa8.35□□□□□ -1.07
C16orf62-211ENST00000540101 LILRB3O75022 631 aa8.35□□□□□ -1.07
C16orf62-211ENST00000540101 TADA2AO75478 443 aa8.35□□□□□ -1.07
C16orf62-211ENST00000540101 FGF18O76093 207 aa8.35□□□□□ -1.07
C16orf62-211ENST00000540101 SOD2P04179 222 aa8.35□□□□□ -1.07
C16orf62-211ENST00000540101 ODC1P11926 461 aa8.35□□□□□ -1.07
C16orf62-211ENST00000540101 CD58P19256 250 aa8.35□□□□□ -1.07
C16orf62-211ENST00000540101 COL9A1P20849 921 aa8.35□□□□□ -1.07
C16orf62-211ENST00000540101 LMO2P25791 158 aa8.35□□□□□ -1.07
C16orf62-211ENST00000540101 KRT9P35527 623 aa8.35□□□□□ -1.07
C16orf62-211ENST00000540101 NDST1P52848 882 aa8.35□□□□□ -1.07
C16orf62-211ENST00000540101 RAD23BP54727 409 aa8.35□□□□□ -1.07
C16orf62-211ENST00000540101 ADKP55263 362 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
C16orf62-211ENST00000540101 ERVK-21P61565 698 aa8.35□□□□□ -1.07
C16orf62-211ENST00000540101 CDK17Q00537 523 aa8.35□□□□□ -1.07
C16orf62-211ENST00000540101 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
C16orf62-211ENST00000540101 CAMK1Q14012 370 aa8.35□□□□□ -1.07
C16orf62-211ENST00000540101 ARHGAP44Q17R89 818 aa8.35□□□□□ -1.07
C16orf62-211ENST00000540101 CCDC142Q17RM4 750 aa8.35□□□□□ -1.07
C16orf62-211ENST00000540101 TMEM270Q6UE05 265 aa8.35□□□□□ -1.07
C16orf62-211ENST00000540101 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
C16orf62-211ENST00000540101 DSTYKQ6XUX3 929 aa8.35□□□□□ -1.07
C16orf62-211ENST00000540101 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa8.35□□□□□ -1.07
C16orf62-211ENST00000540101 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
C16orf62-211ENST00000540101 PPFIBP1Q86W92 1011 aa8.35□□□□□ -1.07
C16orf62-211ENST00000540101 CNGA4Q8IV77 575 aa8.35□□□□□ -1.07
C16orf62-211ENST00000540101 GPR65Q8IYL9 337 aa8.35□□□□□ -1.07
C16orf62-211ENST00000540101 CRYBG2Q8N1P7 616 aa8.35□□□□□ -1.07
C16orf62-211ENST00000540101 TTC39CQ8N584 583 aa8.35□□□□□ -1.07
C16orf62-211ENST00000540101 KLHL23Q8NBE8 558 aa8.35□□□□□ -1.07
C16orf62-211ENST00000540101 SLC4A11Q8NBS3 891 aa8.35□□□□□ -1.07
C16orf62-211ENST00000540101 SPC24Q8NBT2 197 aa8.35□□□□□ -1.07
C16orf62-211ENST00000540101 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
C16orf62-211ENST00000540101 OR8K1Q8NGG5 319 aa8.35□□□□□ -1.07
C16orf62-211ENST00000540101 EPS8L1Q8TE68 723 aa8.35□□□□□ -1.07
C16orf62-211ENST00000540101 GDPD5Q8WTR4 605 aa8.35□□□□□ -1.07
C16orf62-211ENST00000540101 CPLX3Q8WVH0 158 aa8.35□□□□□ -1.07
C16orf62-211ENST00000540101 PIK3R5Q8WYR1 880 aa8.35□□□□□ -1.07
C16orf62-211ENST00000540101 TFAP2BQ92481 460 aa8.35□□□□□ -1.07
C16orf62-211ENST00000540101 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
C16orf62-211ENST00000540101 B3GALT6Q96L58 329 aa8.35□□□□□ -1.07
C16orf62-211ENST00000540101 SPAG5Q96R06 1193 aa8.35□□□□□ -1.07
C16orf62-211ENST00000540101 PANX2Q96RD6 677 aa8.35□□□□□ -1.07
C16orf62-211ENST00000540101 MMS19Q96T76 1030 aa8.35□□□□□ -1.07
C16orf62-211ENST00000540101 C17orf80Q9BSJ5 609 aa8.35□□□□□ -1.07
C16orf62-211ENST00000540101 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa8.35□□□□□ -1.07
C16orf62-211ENST00000540101 PLVAPQ9BX97 442 aa8.35□□□□□ -1.07
C16orf62-211ENST00000540101 DPEP3Q9H4B8 488 aa8.35□□□□□ -1.07
C16orf62-211ENST00000540101 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa8.35□□□□□ -1.07
C16orf62-211ENST00000540101 DSEQ9UL01 958 aa8.35□□□□□ -1.07
C16orf62-211ENST00000540101 MTUS1Q9ULD2 1270 aa8.35□□□□□ -1.07
C16orf62-211ENST00000540101 NENFQ9UMX5 172 aa8.35□□□□□ -1.07
C16orf62-211ENST00000540101 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
C16orf62-211ENST00000540101 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
C16orf62-211ENST00000540101 O00370 1275 aa8.34□□□□□ -1.07
C16orf62-211ENST00000540101 CYP26A1O43174 497 aa8.34□□□□□ -1.07
C16orf62-211ENST00000540101 GFPT2O94808 682 aa8.34□□□□□ -1.07
C16orf62-211ENST00000540101 CALCAP01258 141 aa8.34□□□□□ -1.07
C16orf62-211ENST00000540101 PAEPP09466 180 aa8.34□□□□□ -1.07
C16orf62-211ENST00000540101 CYP11B1P15538 503 aa8.34□□□□□ -1.07
C16orf62-211ENST00000540101 CHRNB2P17787 502 aa8.34□□□□□ -1.07
C16orf62-211ENST00000540101 DNAJB1P25685 340 aa8.34□□□□□ -1.07
C16orf62-211ENST00000540101 STAT1P42224 750 aa8.34□□□□□ -1.07
C16orf62-211ENST00000540101 DSG1Q02413 1049 aa8.34□□□□□ -1.07
C16orf62-211ENST00000540101 PTK2Q05397 1052 aa8.34□□□□□ -1.07
C16orf62-211ENST00000540101 CCDC173Q0VFZ6 552 aa8.34□□□□□ -1.07
C16orf62-211ENST00000540101 ORC1Q13415 861 aa8.34□□□□□ -1.07
C16orf62-211ENST00000540101 AAK1Q2M2I8 961 aa8.34□□□□□ -1.07
C16orf62-211ENST00000540101 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
C16orf62-211ENST00000540101 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
C16orf62-211ENST00000540101 FAM171A1Q5VUB5 890 aa8.34□□□□□ -1.07
C16orf62-211ENST00000540101 SFMBT2Q5VUG0 894 aa8.34□□□□□ -1.07
C16orf62-211ENST00000540101 OVOS1Q6IE37 1185 aa8.34□□□□□ -1.07
C16orf62-211ENST00000540101 SLC8B1Q6J4K2 584 aa8.34□□□□□ -1.07
C16orf62-211ENST00000540101 CCDC186Q7Z3E2 898 aa8.34□□□□□ -1.07
C16orf62-211ENST00000540101 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
C16orf62-211ENST00000540101 SLC47A2Q86VL8 602 aa8.34□□□□□ -1.07
C16orf62-211ENST00000540101 GPIHBP1Q8IV16 184 aa8.34□□□□□ -1.07
C16orf62-211ENST00000540101 DRC7Q8IY82 874 aa8.34□□□□□ -1.07
C16orf62-211ENST00000540101 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
C16orf62-211ENST00000540101 SPPL3Q8TCT6 385 aa8.34□□□□□ -1.07
C16orf62-211ENST00000540101 TMEM176AQ96HP8 235 aa8.34□□□□□ -1.07
C16orf62-211ENST00000540101 LPIN3Q9BQK8 851 aa8.34□□□□□ -1.07
C16orf62-211ENST00000540101 ACBD6Q9BR61 282 aa8.34□□□□□ -1.07
C16orf62-211ENST00000540101 TTPALQ9BTX7 342 aa8.34□□□□□ -1.07
C16orf62-211ENST00000540101 ZBP1Q9H171 429 aa8.34□□□□□ -1.07
C16orf62-211ENST00000540101 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
C16orf62-211ENST00000540101 CRTAC1Q9NQ79 661 aa8.34□□□□□ -1.07
C16orf62-211ENST00000540101 AAASQ9NRG9 546 aa8.34□□□□□ -1.07
C16orf62-211ENST00000540101 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa8.34□□□□□ -1.07
C16orf62-211ENST00000540101 MTRRQ9UBK8 725 aa8.34□□□□□ -1.07
C16orf62-211ENST00000540101 LZTS1Q9Y250 596 aa8.34□□□□□ -1.07
C16orf62-211ENST00000540101 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
C16orf62-211ENST00000540101 RWDD3Q9Y3V2 267 aa8.34□□□□□ -1.07
C16orf62-211ENST00000540101 BACE2Q9Y5Z0 518 aa8.34□□□□□ -1.07
C16orf62-211ENST00000540101 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.08
C16orf62-211ENST00000540101 ARHGEF37A1IGU5 675 aa8.33□□□□□ -1.08
C16orf62-211ENST00000540101 A8MXQ7 604 aa8.33□□□□□ -1.08
C16orf62-211ENST00000540101 FSCN2O14926 492 aa8.33□□□□□ -1.08
C16orf62-211ENST00000540101 ATP2C2O75185 946 aa8.33□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.5 ms