RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530727.5

PTPRC-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 1,962 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-214ENST00000530727 TNS2Q63HR2 1409 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 LAMB4A4D0S4 1761 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 PTPRCP08575 1304 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 MATN3O15232 486 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 MT-CO1P00395 513 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 LPLP06858 475 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 MGAT5Q09328 741 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 PDCD1Q15116 288 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 CCDC30Q5VVM6 783 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 FAM111BQ6SJ93 734 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 MAATS1Q7Z4T9 603 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 CREBRFQ8IUR6 639 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 GLB1L2Q8IW92 636 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 PIK3C3Q8NEB9 887 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 OR14C36Q8NHC7 312 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 RSAD2Q8WXG1 361 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 SAGE1Q9NXZ1 904 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-214ENST00000530727 ERC2O15083 957 aa4.84□□□□□ -1.64
PTPRC-214ENST00000530727 MTSS1O43312 755 aa4.84□□□□□ -1.64
PTPRC-214ENST00000530727 ALDH1A2O94788 518 aa4.84□□□□□ -1.64
PTPRC-214ENST00000530727 LY86O95711 162 aa4.84□□□□□ -1.64
PTPRC-214ENST00000530727 IGHDP01880 384 aa4.84□□□□□ -1.64
PTPRC-214ENST00000530727 TNFRSF1AP19438 455 aa4.84□□□□□ -1.64
PTPRC-214ENST00000530727 TNFAIP3P21580 790 aa4.84□□□□□ -1.64
PTPRC-214ENST00000530727 HSPA1LP34931 641 aa4.84□□□□□ -1.64
PTPRC-214ENST00000530727 NPEPPSP55786 919 aa4.84□□□□□ -1.64
PTPRC-214ENST00000530727 SLC39A6Q13433 755 aa4.84□□□□□ -1.64
PTPRC-214ENST00000530727 TRIM14Q14142 442 aa4.84□□□□□ -1.64
PTPRC-214ENST00000530727 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.64
PTPRC-214ENST00000530727 KRT72Q14CN4 511 aa4.84□□□□□ -1.64
PTPRC-214ENST00000530727 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP4.84□□□□□ -1.64
PTPRC-214ENST00000530727 NRN1LQ496H8 165 aa4.84□□□□□ -1.64
PTPRC-214ENST00000530727 PITRM1Q5JRX3 1037 aa4.84□□□□□ -1.64
PTPRC-214ENST00000530727 UNC5CLQ8IV45 518 aa4.84□□□□□ -1.64
PTPRC-214ENST00000530727 CMTM4Q8IZR5 234 aa4.84□□□□□ -1.64
PTPRC-214ENST00000530727 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa4.84□□□□□ -1.64
PTPRC-214ENST00000530727 POF1BQ8WVV4 589 aa4.84□□□□□ -1.64
PTPRC-214ENST00000530727 ACAP3Q96P50 834 aa4.84□□□□□ -1.64
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PTPRC-214ENST00000530727 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.64
PTPRC-214ENST00000530727 MENTQ9BUN1 341 aa4.84□□□□□ -1.64
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PTPRC-214ENST00000530727 KCTD10Q9H3F6 313 aa4.84□□□□□ -1.64
PTPRC-214ENST00000530727 VTA1Q9NP79 307 aa4.84□□□□□ -1.64
PTPRC-214ENST00000530727 ING3Q9NXR8 418 aa4.84□□□□□ -1.64
PTPRC-214ENST00000530727 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa4.84□□□□□ -1.64
PTPRC-214ENST00000530727 ASAP1Q9ULH1 1129 aa4.84□□□□□ -1.64
PTPRC-214ENST00000530727 DDX19BQ9UMR2 479 aa4.84□□□□□ -1.64
PTPRC-214ENST00000530727 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRC-214ENST00000530727 RHOBTB3O94955 611 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRC-214ENST00000530727 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
PTPRC-214ENST00000530727 AK2P54819 239 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRC-214ENST00000530727 LGALS4P56470 323 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRC-214ENST00000530727 ODF1Q14990 250 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRC-214ENST00000530727 UGT8Q16880 541 aa4.83□□□□□ -1.64
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PTPRC-214ENST00000530727 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
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PTPRC-214ENST00000530727 TTC30BQ8N4P2 665 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRC-214ENST00000530727 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
PTPRC-214ENST00000530727 DOT1LQ8TEK3 1739 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRC-214ENST00000530727 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
PTPRC-214ENST00000530727 MYD88Q99836 296 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRC-214ENST00000530727 SLC13A1Q9BZW2 595 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRC-214ENST00000530727 GIT1Q9Y2X7 761 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRC-214ENST00000530727 PXDNLA1KZ92 1463 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRC-214ENST00000530727 BCL9O00512 1426 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-214ENST00000530727 NRP1O14786 923 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-214ENST00000530727 VDRP11473 427 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-214ENST00000530727 USP14P54578 494 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-214ENST00000530727 CRHR2Q13324 411 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-214ENST00000530727 SPIDRQ14159 915 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-214ENST00000530727 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
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PTPRC-214ENST00000530727 TUBB8Q3ZCM7 444 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-214ENST00000530727 FKBP15Q5T1M5 1219 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-214ENST00000530727 CFAP161Q6P656 301 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-214ENST00000530727 LYSMD2Q8IV50 215 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-214ENST00000530727 ANKRD35Q8N283 1001 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-214ENST00000530727 PRDM12Q9H4Q4 367 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-214ENST00000530727 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-214ENST00000530727 GOLGA8AA7E2F4 631 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-214ENST00000530727 FZD9O00144 591 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-214ENST00000530727 FIBPO43427 364 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-214ENST00000530727 SNX2O60749 519 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-214ENST00000530727 ENPP1P22413 925 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-214ENST00000530727 ACRV1P26436 265 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-214ENST00000530727 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-214ENST00000530727 ERVK-21P61565 698 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRC-214ENST00000530727 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP4.82□□□□□ -1.64
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