RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524393.5

RBBP4-215, Transcript of RB binding protein 4, chromatin remodeling factor, human

TSL 3

Gene RBBP4, Length 583 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBBP4-215	ENST00000524393	ACTN4	O43707	911 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
RBBP4-215	ENST00000524393	EXOC3	O60645	756 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBBP4-215	ENST00000524393	KIF20A	O95235	890 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBBP4-215	ENST00000524393	DLAT	P10515	647 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
RBBP4-215	ENST00000524393	GJA1	P17302	382 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBBP4-215	ENST00000524393	PCSK1	P29120	753 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBBP4-215	ENST00000524393	SYK	P43405	635 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBBP4-215	ENST00000524393	LHX1	P48742	406 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBBP4-215	ENST00000524393	MRE11	P49959	708 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBBP4-215	ENST00000524393	STARD6	P59095	220 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBBP4-215	ENST00000524393	SNW1	Q13573	536 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
RBBP4-215	ENST00000524393	TEAD2	Q15562	447 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBBP4-215	ENST00000524393	SLC44A4	Q53GD3	710 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBBP4-215	ENST00000524393	LMBRD2	Q68DH5	695 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
RBBP4-215	ENST00000524393	TANGO2	Q6ICL3	276 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBBP4-215	ENST00000524393	DPH6	Q7L8W6	267 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBBP4-215	ENST00000524393	DNAJB7	Q7Z6W7	309 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
RBBP4-215	ENST00000524393	ADGRF2	Q8IZF7	708 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBBP4-215	ENST00000524393	TTC9B	Q8N6N2	239 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBBP4-215	ENST00000524393	TOP6BL	Q8N6T0	577 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBBP4-215	ENST00000524393	DTWD2	Q8NBA8	298 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBBP4-215	ENST00000524393	SHKBP1	Q8TBC3	707 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBBP4-215	ENST00000524393	DEPDC1B	Q8WUY9	529 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBBP4-215	ENST00000524393	DNASE1L2	Q92874	299 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBBP4-215	ENST00000524393	HPDL	Q96IR7	371 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBBP4-215	ENST00000524393	ACBD6	Q9BR61	282 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBBP4-215	ENST00000524393	TRMT61B	Q9BVS5	477 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
RBBP4-215	ENST00000524393	DNAJC25	Q9H1X3	360 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBBP4-215	ENST00000524393	ATXN3L	Q9H3M9	355 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBBP4-215	ENST00000524393	BRD9	Q9H8M2	597 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBBP4-215	ENST00000524393	L1RE1	Q9UN81	338 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBBP4-215	ENST00000524393	KANSL1L	A0AUZ9	987 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RBBP4-215	ENST00000524393	SOAT2	O75908	522 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RBBP4-215	ENST00000524393	CLSTN1	O94985	981 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RBBP4-215	ENST00000524393	HAPLN1	P10915	354 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
RBBP4-215	ENST00000524393	PSMC3	P17980	439 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RBBP4-215	ENST00000524393	GABRR2	P28476	465 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RBBP4-215	ENST00000524393	CDC25C	P30307	473 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RBBP4-215	ENST00000524393	CYP24A1	Q07973	514 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RBBP4-215	ENST00000524393	PSMD6	Q15008	389 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RBBP4-215	ENST00000524393	TMC8	Q8IU68	726 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RBBP4-215	ENST00000524393	C12orf56	Q8IXR9	622 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RBBP4-215	ENST00000524393	YAF2	Q8IY57	180 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RBBP4-215	ENST00000524393	PJA1	Q8NG27	643 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RBBP4-215	ENST00000524393	OR5B17	Q8NGF7	314 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RBBP4-215	ENST00000524393	IRF7	Q92985	503 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RBBP4-215	ENST00000524393	CCDC127	Q96BQ5	260 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RBBP4-215	ENST00000524393	CGRRF1	Q99675	332 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RBBP4-215	ENST00000524393	FAM86C1	Q9NVL1	165 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RBBP4-215	ENST00000524393	SIX4	Q9UIU6	781 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RBBP4-215	ENST00000524393	HPSE	Q9Y251	543 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RBBP4-215	ENST00000524393	ZDHHC9	Q9Y397	364 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RBBP4-215	ENST00000524393	PTPRJ	Q12913	1337 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RBBP4-215	ENST00000524393	DPYSL4	O14531	572 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RBBP4-215	ENST00000524393	PHACTR2	O75167	634 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RBBP4-215	ENST00000524393	MOSPD3	O75425	235 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RBBP4-215	ENST00000524393	ATF6	P18850	670 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RBBP4-215	ENST00000524393	FCAR	P24071	287 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RBBP4-215	ENST00000524393	RPL10A	P62906	217 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
RBBP4-215	ENST00000524393	TRPC3	Q13507	836 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RBBP4-215	ENST00000524393	GRM2	Q14416	872 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RBBP4-215	ENST00000524393	UBXN2B	Q14CS0	331 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RBBP4-215	ENST00000524393	KMT5B	Q4FZB7	885 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RBBP4-215	ENST00000524393	INTS6L	Q5JSJ4	861 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
RBBP4-215	ENST00000524393	TPRG1	Q6ZUI0	275 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RBBP4-215	ENST00000524393	TRAPPC11	Q7Z392	1133 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RBBP4-215	ENST00000524393	LRRTM3	Q86VH5	581 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RBBP4-215	ENST00000524393	SPATA2L	Q8IUW3	424 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
RBBP4-215	ENST00000524393	CXorf38	Q8TB03	319 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RBBP4-215	ENST00000524393	GIPC2	Q8TF65	315 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RBBP4-215	ENST00000524393	ZSWIM3	Q96MP5	696 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RBBP4-215	ENST00000524393	MMS19	Q96T76	1030 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RBBP4-215	ENST00000524393	LPIN3	Q9BQK8	851 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RBBP4-215	ENST00000524393	PI4K2A	Q9BTU6	479 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RBBP4-215	ENST00000524393	LRRC3	Q9BY71	257 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RBBP4-215	ENST00000524393	PLA2G2F	Q9BZM2	168 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RBBP4-215	ENST00000524393	TRPV4	Q9HBA0	871 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RBBP4-215	ENST00000524393	ABCB6	Q9NP58	842 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RBBP4-215	ENST00000524393	ZMYM5	Q9UJ78	669 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RBBP4-215	ENST00000524393	MRPS17	Q9Y2R5	130 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
RBBP4-215	ENST00000524393	TRIO	O75962	3097 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RBBP4-215	ENST00000524393	MUC6	Q6W4X9	2439 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RBBP4-215	ENST00000524393		A0A1W2PQ27	194 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RBBP4-215	ENST00000524393		A0A1W2PQ64	194 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RBBP4-215	ENST00000524393		A0A1W2PQD8	194 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RBBP4-215	ENST00000524393	ZNF263	O14978	683 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RBBP4-215	ENST00000524393	NCAM2	O15394	837 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RBBP4-215	ENST00000524393	KLRC4	O43908	158 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RBBP4-215	ENST00000524393	RPN1	P04843	607 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
RBBP4-215	ENST00000524393	DCN	P07585	359 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
RBBP4-215	ENST00000524393	CSH1	P0DML2	217 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RBBP4-215	ENST00000524393	CSH2	P0DML3	217 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RBBP4-215	ENST00000524393	ACAT1	P24752	427 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
RBBP4-215	ENST00000524393	GDI1	P31150	447 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RBBP4-215	ENST00000524393	CDR1	P51861	262 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RBBP4-215	ENST00000524393	NDUFA8	P51970	172 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RBBP4-215	ENST00000524393	AP3M2	P53677	418 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RBBP4-215	ENST00000524393	TNNC1	P63316	161 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RBBP4-215	ENST00000524393	ANGPT1	Q15389	498 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RBBP4-215	ENST00000524393	MAPRE1	Q15691	268 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25

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