RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000521017.5

CCNC-211, Transcript of cyclin C, humanhuman

TSL 4

Gene CCNC, Length 579 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNC-211ENST00000521017 GIPC2Q8TF65 315 aa11.33□□□□□ -0.6
CCNC-211ENST00000521017 SLC39A7Q92504 469 aa11.33□□□□□ -0.6
CCNC-211ENST00000521017 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
CCNC-211ENST00000521017 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
CCNC-211ENST00000521017 LINC00597Q9H2U6 94 aa11.33□□□□□ -0.6
CCNC-211ENST00000521017 ECT2Q9H8V3 914 aa11.33□□□□□ -0.6
CCNC-211ENST00000521017 CAPN10Q9HC96 672 aa11.33□□□□□ -0.6
CCNC-211ENST00000521017 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa11.33□□□□□ -0.6
CCNC-211ENST00000521017 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
CCNC-211ENST00000521017 TPCN1Q9ULQ1 816 aa11.33□□□□□ -0.6
CCNC-211ENST00000521017 MGAQ8IWI9 3026 aa11.33□□□□□ -0.6
CCNC-211ENST00000521017 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa11.32□□□□□ -0.6
CCNC-211ENST00000521017 MED24O75448 989 aa11.32□□□□□ -0.6
CCNC-211ENST00000521017 GJB3O75712 270 aa11.32□□□□□ -0.6
CCNC-211ENST00000521017 CFIP05156 583 aa11.32□□□□□ -0.6
CCNC-211ENST00000521017 ATP2B1P20020 1258 aa11.32□□□□□ -0.6
CCNC-211ENST00000521017 RPL9P32969 192 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
CCNC-211ENST00000521017 ALDH1A3P47895 512 aa11.32□□□□□ -0.6
CCNC-211ENST00000521017 CYP4F3Q08477 520 aa11.32□□□□□ -0.6
CCNC-211ENST00000521017 PLD1Q13393 1074 aa11.32□□□□□ -0.6
CCNC-211ENST00000521017 SLC10A6Q3KNW5 377 aa11.32□□□□□ -0.6
CCNC-211ENST00000521017 FBXO43Q4G163 708 aa11.32□□□□□ -0.6
CCNC-211ENST00000521017 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
CCNC-211ENST00000521017 KRT25Q7Z3Z0 450 aa11.32□□□□□ -0.6
CCNC-211ENST00000521017 ZNF843Q8N446 348 aa11.32□□□□□ -0.6
CCNC-211ENST00000521017 MINDY1Q8N5J2 469 aa11.32□□□□□ -0.6
CCNC-211ENST00000521017 MAB21L3Q8N8X9 362 aa11.32□□□□□ -0.6
CCNC-211ENST00000521017 APPL2Q8NEU8 664 aa11.32□□□□□ -0.6
CCNC-211ENST00000521017 OR10T2Q8NGX3 314 aa11.32□□□□□ -0.6
CCNC-211ENST00000521017 CD101Q93033 1021 aa11.32□□□□□ -0.6
CCNC-211ENST00000521017 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
CCNC-211ENST00000521017 SLC22A12Q96S37 553 aa11.32□□□□□ -0.6
CCNC-211ENST00000521017 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
CCNC-211ENST00000521017 AGXT2Q9BYV1 514 aa11.32□□□□□ -0.6
CCNC-211ENST00000521017 CNTN3Q9P232 1028 aa11.32□□□□□ -0.6
CCNC-211ENST00000521017 TNFSF13BQ9Y275 285 aa11.32□□□□□ -0.6
CCNC-211ENST00000521017 WNT6Q9Y6F9 365 aa11.32□□□□□ -0.6
CCNC-211ENST00000521017 COL12A1Q99715 3063 aa11.32□□□□□ -0.6
CCNC-211ENST00000521017 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
CCNC-211ENST00000521017 THADAQ6YHU6 1953 aa11.31□□□□□ -0.6
CCNC-211ENST00000521017 F11P03951 625 aa11.31□□□□□ -0.6
CCNC-211ENST00000521017 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
CCNC-211ENST00000521017 ITPKBP27987 946 aa11.31□□□□□ -0.6
CCNC-211ENST00000521017 GPR15P49685 360 aa11.31□□□□□ -0.6
CCNC-211ENST00000521017 VASPP50552 380 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
CCNC-211ENST00000521017 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
CCNC-211ENST00000521017 PTPAQ15257 358 aa11.31□□□□□ -0.6
CCNC-211ENST00000521017 CRY1Q16526 586 aa11.31□□□□□ -0.6
CCNC-211ENST00000521017 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa11.31□□□□□ -0.6
CCNC-211ENST00000521017 EMC10Q5UCC4 262 aa11.31□□□□□ -0.6
CCNC-211ENST00000521017 PCSK4Q6UW60 755 aa11.31□□□□□ -0.6
CCNC-211ENST00000521017 LPCAT2Q7L5N7 544 aa11.31□□□□□ -0.6
CCNC-211ENST00000521017 LRRTM3Q86VH5 581 aa11.31□□□□□ -0.6
CCNC-211ENST00000521017 CATSPER3Q86XQ3 398 aa11.31□□□□□ -0.6
CCNC-211ENST00000521017 DEPTORQ8TB45 409 aa11.31□□□□□ -0.6
CCNC-211ENST00000521017 CYP2S1Q96SQ9 504 aa11.31□□□□□ -0.6
CCNC-211ENST00000521017 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
CCNC-211ENST00000521017 C2orf40Q9H1Z8 148 aa11.31□□□□□ -0.6
CCNC-211ENST00000521017 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
CCNC-211ENST00000521017 RAI2Q9Y5P3 530 aa11.31□□□□□ -0.6
CCNC-211ENST00000521017 A0A087WV48 116 aa11.3□□□□□ -0.6
CCNC-211ENST00000521017 SGK1O00141 431 aa11.3□□□□□ -0.6
CCNC-211ENST00000521017 MARCH6O60337 910 aa11.3□□□□□ -0.6
CCNC-211ENST00000521017 OPHN1O60890 802 aa11.3□□□□□ -0.6
CCNC-211ENST00000521017 CBFA2T3O75081 653 aa11.3□□□□□ -0.6
CCNC-211ENST00000521017 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
CCNC-211ENST00000521017 CYP11B2P19099 503 aa11.3□□□□□ -0.6
CCNC-211ENST00000521017 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
CCNC-211ENST00000521017 HSPA4P34932 840 aa11.3□□□□□ -0.6
CCNC-211ENST00000521017 OPRD1P41143 372 aa11.3□□□□□ -0.6
CCNC-211ENST00000521017 NAMPTP43490 491 aa11.3□□□□□ -0.6
CCNC-211ENST00000521017 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP11.3□□□□□ -0.6
CCNC-211ENST00000521017 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
CCNC-211ENST00000521017 AAMPQ13685 434 aa11.3□□□□□ -0.6
CCNC-211ENST00000521017 NBR1Q14596 966 aa11.3□□□□□ -0.6
CCNC-211ENST00000521017 EML3Q32P44 896 aa11.3□□□□□ -0.6
CCNC-211ENST00000521017 RNF20Q5VTR2 975 aa11.3□□□□□ -0.6
CCNC-211ENST00000521017 SDHAF4Q5VUM1 108 aa11.3□□□□□ -0.6
CCNC-211ENST00000521017 LYSMD4Q5XG99 296 aa11.3□□□□□ -0.6
CCNC-211ENST00000521017 PADI6Q6TGC4 694 aa11.3□□□□□ -0.6
CCNC-211ENST00000521017 HDDC3Q8N4P3 179 aa11.3□□□□□ -0.6
CCNC-211ENST00000521017 LRRC15Q8TF66 581 aa11.3□□□□□ -0.6
CCNC-211ENST00000521017 KCNB2Q92953 911 aa11.3□□□□□ -0.6
CCNC-211ENST00000521017 ACDQ96AP0 544 aa11.3□□□□□ -0.6
CCNC-211ENST00000521017 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
CCNC-211ENST00000521017 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
CCNC-211ENST00000521017 TDP1Q9NUW8 608 aa11.3□□□□□ -0.6
CCNC-211ENST00000521017 SLC38A7Q9NVC3 462 aa11.3□□□□□ -0.6
CCNC-211ENST00000521017 TOR4AQ9NXH8 423 aa11.3□□□□□ -0.6
CCNC-211ENST00000521017 SLC6A14Q9UN76 642 aa11.3□□□□□ -0.6
CCNC-211ENST00000521017 ASB3Q9Y575 518 aa11.3□□□□□ -0.6
CCNC-211ENST00000521017 PI4KAP42356 2102 aa11.3□□□□□ -0.6
CCNC-211ENST00000521017 ATMQ13315 3056 aa11.29□□□□□ -0.6
CCNC-211ENST00000521017 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
CCNC-211ENST00000521017 TRIP11Q15643 1979 aa11.29□□□□□ -0.6
CCNC-211ENST00000521017 FAM149AA5PLN7 773 aa11.29□□□□□ -0.6
CCNC-211ENST00000521017 TRABD2BA6NFA1 517 aa11.29□□□□□ -0.6
CCNC-211ENST00000521017 ADAM23O75077 832 aa11.29□□□□□ -0.6
CCNC-211ENST00000521017 TADA3O75528 432 aa11.29□□□□□ -0.6
CCNC-211ENST00000521017 SERPINF2P08697 491 aa11.29□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.4 ms