RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519076.5

TRPS1-208, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TRPS1, Length 3,329 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-208ENST00000519076 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa8.29□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 FAM228AQ86W67 206 aa8.29□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 LRRC49Q8IUZ0 686 aa8.29□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 MMGT1Q8N4V1 131 aa8.29□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 C7orf31Q8N865 590 aa8.29□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 VPS37AQ8NEZ2 397 aa8.29□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 SHC3Q92529 594 aa8.29□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 PPP1R14BQ96C90 147 aa8.29□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 RNF19AQ9NV58 838 aa8.29□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 SETD4Q9NVD3 440 aa8.29□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 PARP2Q9UGN5 583 aa8.29□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 DYTNA2CJ06 578 aa8.28□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 CCDC188H7C350 402 aa8.28□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 TLR3O15455 904 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 MAGEB2O15479 319 aa8.28□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 GAS2O43903 313 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 KDM1AO60341 852 aa8.28□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 GLI1P08151 1106 aa8.28□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 GTF2H1P32780 548 aa8.28□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 SLC26A2P50443 739 aa8.28□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 DR1Q01658 176 aa8.28□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 TNFAIP2Q03169 654 aa8.28□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 KIF22Q14807 665 aa8.28□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 ZACNQ401N2 412 aa8.28□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 SGO2Q562F6 1265 aa8.28□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 DNAJC24Q6P3W2 148 aa8.28□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 CCDC121Q6ZUS5 278 aa8.28□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 PLEKHH3Q7Z736 793 aa8.28□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 NT5DC3Q86UY8 548 aa8.28□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 FAM71AQ8IYT1 594 aa8.28□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP8.28□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 ANKK1Q8NFD2 765 aa8.28□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 CLIP3Q96DZ5 547 aa8.28□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 MFSD14AQ96MC6 490 aa8.28□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 ZFATQ9P243 1243 aa8.28□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa8.28□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 A0A0B4J269 797 aa8.28□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 DAPK3O43293 454 aa8.28□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 STRNO43815 780 aa8.28□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 IFNB1P01574 187 aa8.28□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP8.28□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 GGCXP38435 758 aa8.28□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 DGKDQ16760 1214 aa8.28□□□□□ -1.08
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TRPS1-208ENST00000519076 EEF1DP3Q658K8 133 aa8.28□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 WDR93Q6P2C0 686 aa8.28□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 MPZL3Q6UWV2 235 aa8.28□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 ZPBP2Q6X784 338 aa8.28□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF365Q70YC5 407 aa8.28□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 ERICH1Q86X53 443 aa8.28□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 CCDC13Q8IYE1 715 aa8.28□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 TMEM35BQ8NCS4 154 aa8.28□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 LRRC45Q96CN5 670 aa8.28□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 KIF12Q96FN5 646 aa8.28□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 PCYT2Q99447 389 aa8.28□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 CGRRF1Q99675 332 aa8.28□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 CENPOQ9BU64 300 aa8.28□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 WDR35Q9P2L0 1181 aa8.28□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 RAB21Q9UL25 225 aa8.28□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 KCNH4Q9UQ05 1017 aa8.28□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 NOD1Q9Y239 953 aa8.28□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 SNX24Q9Y343 169 aa8.28□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 PIK3R2O00459 728 aa8.28□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 MAPK13O15264 365 aa8.28□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 ASAP2O43150 1006 aa8.28□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 ATP9BO43861 1147 aa8.28□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 ITGB3P05106 788 aa8.28□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 GZMAP12544 262 aa8.28□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 BDNFP23560 247 aa8.28□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 ARL2P36404 184 aa8.28□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 APLP1P51693 650 aa8.28□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 OXCT1P55809 520 aa8.28□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 GCNT1Q02742 428 aa8.28□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 DMPKQ09013 629 aa8.28□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa8.28□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 ACAD10Q6JQN1 1059 aa8.28□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 AADACL2Q6P093 401 aa8.28□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 LLGL2Q6P1M3 1020 aa8.28□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 EMBQ6PCB8 327 aa8.28□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 GPR142Q7Z601 462 aa8.28□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 MAIP1Q8WWC4 291 aa8.28□□□□□ -1.08
TRPS1-208ENST00000519076 PPP2R3CQ969Q6 453 aa8.28□□□□□ -1.08
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