RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513165.1

HOXC-AS3-202, HOXC cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene HOXC-AS3, Length 533 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS3-202ENST00000513165 HPSEQ9Y251 543 aa18.1■□□□□ 0.49
HOXC-AS3-202ENST00000513165 A0A1W2PRU2 124 aa18.09■□□□□ 0.49
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KANSL1LA0AUZ9 987 aa18.09■□□□□ 0.49
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP18.09■□□□□ 0.49
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KLRC4O43908 158 aa18.09■□□□□ 0.49
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP18.09■□□□□ 0.49
HOXC-AS3-202ENST00000513165 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP18.09■□□□□ 0.49
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GJA1P17302 382 aa18.09■□□□□ 0.49
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PSMC3P17980 439 aa18.09■□□□□ 0.49
HOXC-AS3-202ENST00000513165 LHX1P48742 406 aa18.09■□□□□ 0.49
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MYL7Q01449 175 aa18.09■□□□□ 0.49
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TSPY1Q01534 308 aa18.09■□□□□ 0.49
HOXC-AS3-202ENST00000513165 BFSP1Q12934 665 aa18.09■□□□□ 0.49
HOXC-AS3-202ENST00000513165 VEPH1Q14D04 833 aa18.09■□□□□ 0.49
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MGAT5BQ3V5L5 792 aa18.09■□□□□ 0.49
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SCARA3Q6AZY7 606 aa18.09■□□□□ 0.49
HOXC-AS3-202ENST00000513165 LIMS2Q7Z4I7 341 aa18.09■□□□□ 0.49
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NELFCDQ8IXH7 590 aa18.09■□□□□ 0.49
HOXC-AS3-202ENST00000513165 OR5B17Q8NGF7 314 aa18.09■□□□□ 0.49
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GOLGA5Q8TBA6 731 aa18.09■□□□□ 0.49
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP18.09■□□□□ 0.49
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa18.09■□□□□ 0.49
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DNASE1L2Q92874 299 aa18.09■□□□□ 0.49
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NELL2Q99435 816 aa18.09■□□□□ 0.49
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP18.09■□□□□ 0.49
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP18.09■□□□□ 0.49
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TRPV5Q9NQA5 729 aa18.09■□□□□ 0.49
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa18.09■□□□□ 0.49
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa18.09■□□□□ 0.49
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SNX9Q9Y5X1 595 aa18.09■□□□□ 0.49
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TCHHQ07283 1943 aa18.09■□□□□ 0.49
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TSC2P49815 1807 aa18.09■□□□□ 0.49
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa18.08■□□□□ 0.48
HOXC-AS3-202ENST00000513165 A0A1B0GVL5 298 aa18.08■□□□□ 0.48
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PROB1E7EW31 1015 aa18.08■□□□□ 0.48
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GABRDO14764 452 aa18.08■□□□□ 0.48
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CLIC2O15247 247 aa18.08■□□□□ 0.48
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SOAT2O75908 522 aa18.08■□□□□ 0.48
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PFKFB1P16118 471 aa18.08■□□□□ 0.48
HOXC-AS3-202ENST00000513165 WEE1P30291 646 aa18.08■□□□□ 0.48
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PSMD6Q15008 389 aa18.08■□□□□ 0.48
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GAREM2Q75VX8 874 aa18.08■□□□□ 0.48
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MFSD6LQ8IWD5 586 aa18.08■□□□□ 0.48
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RDH13Q8NBN7 331 aa18.08■□□□□ 0.48
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PJA1Q8NG27 643 aa18.08■□□□□ 0.48
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TMEM174Q8WUU8 243 aa18.08■□□□□ 0.48
HOXC-AS3-202ENST00000513165 IRF7Q92985 503 aa18.08■□□□□ 0.48
HOXC-AS3-202ENST00000513165 HPDLQ96IR7 371 aa18.08■□□□□ 0.48
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ABCB6Q9NP58 842 aa18.08■□□□□ 0.48
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PTPRJQ12913 1337 aa18.07■□□□□ 0.48
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP18.07■□□□□ 0.48
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FAM163BP0C2L3 166 aa18.07■□□□□ 0.48
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ATF6P18850 670 aa18.07■□□□□ 0.48
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NBL1P41271 181 aa18.07■□□□□ 0.48
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CYP24A1Q07973 514 aa18.07■□□□□ 0.48
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ANGPT1Q15389 498 aa18.07■□□□□ 0.48
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SOWAHAQ2M3V2 549 aa18.07■□□□□ 0.48
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa18.07■□□□□ 0.48
HOXC-AS3-202ENST00000513165 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP18.07■□□□□ 0.48
HOXC-AS3-202ENST00000513165 VITQ6UXI7 678 aa18.07■□□□□ 0.48
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa18.07■□□□□ 0.48
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa18.07■□□□□ 0.48
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FAM200AQ8TCP9 573 aa18.07■□□□□ 0.48
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FNBP1Q96RU3 617 aa18.07■□□□□ 0.48
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ATXN3LQ9H3M9 355 aa18.07■□□□□ 0.48
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa18.07■□□□□ 0.48
HOXC-AS3-202ENST00000513165 BRD9Q9H8M2 597 aa18.07■□□□□ 0.48
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP18.07■□□□□ 0.48
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TMLHEQ9NVH6 421 aa18.07■□□□□ 0.48
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FAM86C1Q9NVL1 165 aa18.07■□□□□ 0.48
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP18.07■□□□□ 0.48
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZMYM5Q9UJ78 669 aa18.07■□□□□ 0.48
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DCNP07585 359 aaKnown RBP18.06■□□□□ 0.48
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TNNI1P19237 187 aa18.06■□□□□ 0.48
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GABRR2P28476 465 aa18.06■□□□□ 0.48
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PCSK1P29120 753 aa18.06■□□□□ 0.48
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CDC25CP30307 473 aa18.06■□□□□ 0.48
HOXC-AS3-202ENST00000513165 VIPR2P41587 438 aa18.06■□□□□ 0.48
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CYP2J2P51589 502 aa18.06■□□□□ 0.48
HOXC-AS3-202ENST00000513165 STK4Q13043 487 aa18.06■□□□□ 0.48
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TAF12Q16514 161 aa18.06■□□□□ 0.48
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KMT5BQ4FZB7 885 aa18.06■□□□□ 0.48
HOXC-AS3-202ENST00000513165 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP18.06■□□□□ 0.48
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZNF852Q6ZMS4 543 aa18.06■□□□□ 0.48
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ADGRF2Q8IZF7 708 aa18.06■□□□□ 0.48
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FAM84AQ96KN4 292 aa18.06■□□□□ 0.48
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PKMYT1Q99640 499 aa18.06■□□□□ 0.48
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CGRRF1Q99675 332 aa18.06■□□□□ 0.48
HOXC-AS3-202ENST00000513165 LPIN3Q9BQK8 851 aa18.06■□□□□ 0.48
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FOXQ1Q9C009 403 aa18.06■□□□□ 0.48
HOXC-AS3-202ENST00000513165 EXOC1Q9NV70 894 aa18.06■□□□□ 0.48
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP18.06■□□□□ 0.48
HOXC-AS3-202ENST00000513165 A0A1W2PQ27 194 aa18.05■□□□□ 0.48
HOXC-AS3-202ENST00000513165 A0A1W2PQ64 194 aa18.05■□□□□ 0.48
HOXC-AS3-202ENST00000513165 A0A1W2PQD8 194 aa18.05■□□□□ 0.48
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FAM170BA6NMN3 283 aa18.05■□□□□ 0.48
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SOBPA7XYQ1 873 aa18.05■□□□□ 0.48
HOXC-AS3-202ENST00000513165 HEPACAM2A8MVW5 462 aa18.05■□□□□ 0.48
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MAN2B1O00754 1011 aa18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17 ms