RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511439.5

TOPBP1-208, Transcript of DNA topoisomerase II binding protein 1, human

TSL 5

Gene TOPBP1, Length 1,142 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TOPBP1-208	ENST00000511439	RNF186	Q9NXI6	227 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TOPBP1-208	ENST00000511439	NCDN	Q9UBB6	729 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TOPBP1-208	ENST00000511439	INTU	Q9ULD6	942 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TOPBP1-208	ENST00000511439	LIMCH1	Q9UPQ0	1083 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TOPBP1-208	ENST00000511439	IPP	Q9Y573	584 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TOPBP1-208	ENST00000511439	LAMA3	Q16787	3333 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TOPBP1-208	ENST00000511439	FAM171A2	A8MVW0	826 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TOPBP1-208	ENST00000511439	HTRA2	O43464	458 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
TOPBP1-208	ENST00000511439	FAM20B	O75063	409 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TOPBP1-208	ENST00000511439	ITGA10	O75578	1167 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TOPBP1-208	ENST00000511439	IL33	O95760	270 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TOPBP1-208	ENST00000511439	ITGB1	P05556	798 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TOPBP1-208	ENST00000511439	GYPE	P15421	78 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TOPBP1-208	ENST00000511439	VCAM1	P19320	739 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TOPBP1-208	ENST00000511439	ECHS1	P30084	290 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TOPBP1-208	ENST00000511439	CRHR1	P34998	444 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TOPBP1-208	ENST00000511439	CASR	P41180	1078 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TOPBP1-208	ENST00000511439	DUSP2	Q05923	314 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TOPBP1-208	ENST00000511439	PPP2R5A	Q15172	486 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TOPBP1-208	ENST00000511439	LRRC41	Q15345	812 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TOPBP1-208	ENST00000511439	DPY19L2P1	Q6NXN4	242 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TOPBP1-208	ENST00000511439	RHOU	Q7L0Q8	258 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TOPBP1-208	ENST00000511439	ARHGEF25	Q86VW2	580 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TOPBP1-208	ENST00000511439	ZNF480	Q8WV37	535 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TOPBP1-208	ENST00000511439	DPF2	Q92785	391 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TOPBP1-208	ENST00000511439	PDCD2L	Q9BRP1	358 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TOPBP1-208	ENST00000511439	TAOK3	Q9H2K8	898 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TOPBP1-208	ENST00000511439	PRO3102	Q9H379	93 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TOPBP1-208	ENST00000511439	BCO1	Q9HAY6	547 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TOPBP1-208	ENST00000511439	MTMR10	Q9NXD2	777 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TOPBP1-208	ENST00000511439	GPRC5D	Q9NZD1	345 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TOPBP1-208	ENST00000511439	SAP30BP	Q9UHR5	308 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
TOPBP1-208	ENST00000511439	PNMA8B	Q9ULN7	279 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
TOPBP1-208	ENST00000511439	SIK3	Q9Y2K2	1263 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TOPBP1-208	ENST00000511439	DICER1	Q9UPY3	1922 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
TOPBP1-208	ENST00000511439	TRPM7	Q96QT4	1865 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TOPBP1-208	ENST00000511439	SMG6	Q86US8	1419 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
TOPBP1-208	ENST00000511439	PAPPA2	Q9BXP8	1791 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TOPBP1-208	ENST00000511439	RNF123	Q5XPI4	1314 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TOPBP1-208	ENST00000511439	TRIM24	O15164	1050 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TOPBP1-208	ENST00000511439	ADCY6	O43306	1168 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TOPBP1-208	ENST00000511439	TSPAN6	O43657	245 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TOPBP1-208	ENST00000511439	ENDOD1	O94919	500 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TOPBP1-208	ENST00000511439	CELF2	O95319	508 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
TOPBP1-208	ENST00000511439	ABHD16A	O95870	558 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TOPBP1-208	ENST00000511439	SCGB1D2	O95969	90 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TOPBP1-208	ENST00000511439	CT47B1	P0C2W7	299 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
TOPBP1-208	ENST00000511439	EN2	P19622	333 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
TOPBP1-208	ENST00000511439	BMP5	P22003	454 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TOPBP1-208	ENST00000511439	AKAP5	P24588	427 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TOPBP1-208	ENST00000511439	SREBF1	P36956	1147 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TOPBP1-208	ENST00000511439	SLC6A9	P48067	706 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TOPBP1-208	ENST00000511439	RRP12	Q5JTH9	1297 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
TOPBP1-208	ENST00000511439	KCNV1	Q6PIU1	500 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TOPBP1-208	ENST00000511439	LRRC55	Q6ZSA7	311 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TOPBP1-208	ENST00000511439		Q7L0L9	218 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TOPBP1-208	ENST00000511439	FMNL3	Q8IVF7	1028 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TOPBP1-208	ENST00000511439	CHPF	Q8IZ52	775 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TOPBP1-208	ENST00000511439	KCNH5	Q8NCM2	988 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TOPBP1-208	ENST00000511439	OR7D4	Q8NG98	312 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TOPBP1-208	ENST00000511439	OR5M3	Q8NGP4	307 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TOPBP1-208	ENST00000511439	PROKR1	Q8TCW9	393 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TOPBP1-208	ENST00000511439	PGBD4	Q96DM1	585 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TOPBP1-208	ENST00000511439	FAM193B	Q96PV7	902 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
TOPBP1-208	ENST00000511439	C7orf25	Q9BPX7	421 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TOPBP1-208	ENST00000511439	CHPF2	Q9P2E5	772 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TOPBP1-208	ENST00000511439	PACSIN3	Q9UKS6	424 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TOPBP1-208	ENST00000511439	CCDC88A	Q3V6T2	1871 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TOPBP1-208	ENST00000511439	SCN11A	Q9UI33	1791 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TOPBP1-208	ENST00000511439	PKD1L2	Q7Z442	2459 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TOPBP1-208	ENST00000511439	CCDC154	A6NI56	674 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TOPBP1-208	ENST00000511439	MARCH6	O60337	910 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TOPBP1-208	ENST00000511439	POU2F2	P09086	479 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TOPBP1-208	ENST00000511439	GYS1	P13807	737 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TOPBP1-208	ENST00000511439	PDC	P20941	246 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TOPBP1-208	ENST00000511439	TGM1	P22735	817 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TOPBP1-208	ENST00000511439	CYP2C19	P33261	490 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TOPBP1-208	ENST00000511439	ADRA1B	P35368	520 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TOPBP1-208	ENST00000511439	GZMK	P49863	264 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TOPBP1-208	ENST00000511439	TAP1	Q03518	808 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TOPBP1-208	ENST00000511439	COL10A1	Q03692	680 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TOPBP1-208	ENST00000511439	UAP1L1	Q3KQV9	507 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TOPBP1-208	ENST00000511439	FAM102B	Q5T8I3	360 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TOPBP1-208	ENST00000511439	C1QL3	Q5VWW1	255 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TOPBP1-208	ENST00000511439	NXN	Q6DKJ4	435 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TOPBP1-208	ENST00000511439	MIGA2	Q7L4E1	593 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TOPBP1-208	ENST00000511439	TPH2	Q8IWU9	490 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TOPBP1-208	ENST00000511439	PRR18	Q8N4B5	295 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TOPBP1-208	ENST00000511439	TSR2	Q969E8	191 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
TOPBP1-208	ENST00000511439	HDAC10	Q969S8	669 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TOPBP1-208	ENST00000511439	CYFIP2	Q96F07	1278 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TOPBP1-208	ENST00000511439	IL17RA	Q96F46	866 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TOPBP1-208	ENST00000511439	AIFM3	Q96NN9	605 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TOPBP1-208	ENST00000511439	CDC5L	Q99459	802 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
TOPBP1-208	ENST00000511439	EPC1	Q9H2F5	836 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TOPBP1-208	ENST00000511439	CLCA2	Q9UQC9	943 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TOPBP1-208	ENST00000511439	RGPD5	Q99666	1765 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TOPBP1-208	ENST00000511439	DLEC1	Q9Y238	1755 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TOPBP1-208	ENST00000511439	GRXCR1	A8MXD5	290 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TOPBP1-208	ENST00000511439	HOXA3	O43365	443 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68

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