RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497511.5

SKAP2-209, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, human

TSL 4

Gene SKAP2, Length 585 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKAP2-209	ENST00000497511	MTCL1	Q9Y4B5	1905 aa	Known RBP	11.9	□□□□□ -0.5
SKAP2-209	ENST00000497511	CHURC1-FNTB	B4DL54	471 aa		11.9	□□□□□ -0.5
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF263	O14978	683 aa		11.9	□□□□□ -0.5
SKAP2-209	ENST00000497511	PSMC3	P17980	439 aa		11.9	□□□□□ -0.5
SKAP2-209	ENST00000497511	TKT	P29401	623 aa	Known RBP	11.9	□□□□□ -0.5
SKAP2-209	ENST00000497511	HSPA4	P34932	840 aa		11.9	□□□□□ -0.5
SKAP2-209	ENST00000497511	FNTB	P49356	437 aa		11.9	□□□□□ -0.5
SKAP2-209	ENST00000497511	RARRES1	P49788	294 aa		11.9	□□□□□ -0.5
SKAP2-209	ENST00000497511	SATB1	Q01826	763 aa		11.9	□□□□□ -0.5
SKAP2-209	ENST00000497511	SPIRE1	Q08AE8	756 aa		11.9	□□□□□ -0.5
SKAP2-209	ENST00000497511	FZD5	Q13467	585 aa		11.9	□□□□□ -0.5
SKAP2-209	ENST00000497511	LRRC32	Q14392	662 aa		11.9	□□□□□ -0.5
SKAP2-209	ENST00000497511	NPY5R	Q15761	445 aa		11.9	□□□□□ -0.5
SKAP2-209	ENST00000497511	MAPK6	Q16659	721 aa		11.9	□□□□□ -0.5
SKAP2-209	ENST00000497511	GLRA4	Q5JXX5	417 aa		11.9	□□□□□ -0.5
SKAP2-209	ENST00000497511	BEND7	Q8N7W2	519 aa	Predicted RBP	11.9	□□□□□ -0.5
SKAP2-209	ENST00000497511	C12orf50	Q8NA57	414 aa	Predicted RBP	11.9	□□□□□ -0.5
SKAP2-209	ENST00000497511	PIGO	Q8TEQ8	1089 aa		11.9	□□□□□ -0.5
SKAP2-209	ENST00000497511	C2orf40	Q9H1Z8	148 aa		11.9	□□□□□ -0.5
SKAP2-209	ENST00000497511	PDZD7	Q9H5P4	517 aa		11.9	□□□□□ -0.5
SKAP2-209	ENST00000497511	SLITRK6	Q9H5Y7	841 aa		11.9	□□□□□ -0.5
SKAP2-209	ENST00000497511	GPRC5C	Q9NQ84	441 aa		11.9	□□□□□ -0.5
SKAP2-209	ENST00000497511	PCDHA12	Q9UN75	941 aa		11.9	□□□□□ -0.5
SKAP2-209	ENST00000497511	BACE2	Q9Y5Z0	518 aa		11.9	□□□□□ -0.5
SKAP2-209	ENST00000497511	PATJ	Q8NI35	1801 aa		11.9	□□□□□ -0.5
SKAP2-209	ENST00000497511		I3L4J1	428 aa		11.89	□□□□□ -0.51
SKAP2-209	ENST00000497511	SIN3B	O75182	1162 aa		11.89	□□□□□ -0.51
SKAP2-209	ENST00000497511	CDKL5	O76039	1030 aa		11.89	□□□□□ -0.51
SKAP2-209	ENST00000497511	LYPLA2	O95372	231 aa		11.89	□□□□□ -0.51
SKAP2-209	ENST00000497511	PRKCB	P05771	671 aa		11.89	□□□□□ -0.51
SKAP2-209	ENST00000497511	TDGF1	P13385	188 aa		11.89	□□□□□ -0.51
SKAP2-209	ENST00000497511	ATP2B1	P20020	1258 aa		11.89	□□□□□ -0.51
SKAP2-209	ENST00000497511	CCNE1	P24864	410 aa		11.89	□□□□□ -0.51
SKAP2-209	ENST00000497511	CNR2	P34972	360 aa		11.89	□□□□□ -0.51
SKAP2-209	ENST00000497511	CLCNKB	P51801	687 aa		11.89	□□□□□ -0.51
SKAP2-209	ENST00000497511	KPNA1	P52294	538 aa	Predicted RBP	11.89	□□□□□ -0.51
SKAP2-209	ENST00000497511	ROR1	Q01973	937 aa		11.89	□□□□□ -0.51
SKAP2-209	ENST00000497511	KCNMA1	Q12791	1236 aa		11.89	□□□□□ -0.51
SKAP2-209	ENST00000497511	SRSF5	Q13243	272 aa	Known RBP	11.89	□□□□□ -0.51
SKAP2-209	ENST00000497511	CALCRL	Q16602	461 aa		11.89	□□□□□ -0.51
SKAP2-209	ENST00000497511	APBB1IP	Q7Z5R6	666 aa	Predicted RBP	11.89	□□□□□ -0.51
SKAP2-209	ENST00000497511	MCPH1	Q8NEM0	835 aa		11.89	□□□□□ -0.51
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF461	Q8TAF7	563 aa		11.89	□□□□□ -0.51
SKAP2-209	ENST00000497511	DEPTOR	Q8TB45	409 aa		11.89	□□□□□ -0.51
SKAP2-209	ENST00000497511	DEPDC1B	Q8WUY9	529 aa		11.89	□□□□□ -0.51
SKAP2-209	ENST00000497511	SMARCD2	Q92925	531 aa		11.89	□□□□□ -0.51
SKAP2-209	ENST00000497511	KCNB2	Q92953	911 aa		11.89	□□□□□ -0.51
SKAP2-209	ENST00000497511	TCEAL4	Q96EI5	215 aa		11.89	□□□□□ -0.51
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF512	Q96ME7	567 aa	Predicted RBP	11.89	□□□□□ -0.51
SKAP2-209	ENST00000497511	UROC1	Q96N76	676 aa		11.89	□□□□□ -0.51
SKAP2-209	ENST00000497511	BRMS1	Q9HCU9	246 aa		11.89	□□□□□ -0.51
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF334	Q9HCZ1	680 aa	Predicted RBP	11.89	□□□□□ -0.51
SKAP2-209	ENST00000497511	DMGDH	Q9UI17	866 aa	Known RBP	11.89	□□□□□ -0.51
SKAP2-209	ENST00000497511	ZFHX4	Q86UP3	3567 aa		11.89	□□□□□ -0.51
SKAP2-209	ENST00000497511		A0A087WWV3	80 aa		11.88	□□□□□ -0.51
SKAP2-209	ENST00000497511	ARHGEF37	A1IGU5	675 aa		11.88	□□□□□ -0.51
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM189-UBE2V1	I3L0A0	370 aa		11.88	□□□□□ -0.51
SKAP2-209	ENST00000497511	MYL4	P12829	197 aa		11.88	□□□□□ -0.51
SKAP2-209	ENST00000497511	FCAR	P24071	287 aa		11.88	□□□□□ -0.51
SKAP2-209	ENST00000497511	VIPR2	P41587	438 aa		11.88	□□□□□ -0.51
SKAP2-209	ENST00000497511	BRCC3	P46736	316 aa		11.88	□□□□□ -0.51
SKAP2-209	ENST00000497511	YARS	P54577	528 aa	Known RBP	11.88	□□□□□ -0.51
SKAP2-209	ENST00000497511	EVC	P57679	992 aa		11.88	□□□□□ -0.51
SKAP2-209	ENST00000497511	PCBP4	P57723	403 aa	Known RBP	11.88	□□□□□ -0.51
SKAP2-209	ENST00000497511	DCAF4L1	Q3SXM0	396 aa		11.88	□□□□□ -0.51
SKAP2-209	ENST00000497511	C16orf46	Q6P387	395 aa		11.88	□□□□□ -0.51
SKAP2-209	ENST00000497511	VIT	Q6UXI7	678 aa		11.88	□□□□□ -0.51
SKAP2-209	ENST00000497511	C1orf229	Q6ZS94	237 aa	Predicted RBP	11.88	□□□□□ -0.51
SKAP2-209	ENST00000497511	RUFY3	Q7L099	469 aa		11.88	□□□□□ -0.51
SKAP2-209	ENST00000497511	SYT9	Q86SS6	491 aa		11.88	□□□□□ -0.51
SKAP2-209	ENST00000497511	LONP2	Q86WA8	852 aa		11.88	□□□□□ -0.51
SKAP2-209	ENST00000497511	SKAP1	Q86WV1	359 aa		11.88	□□□□□ -0.51
SKAP2-209	ENST00000497511	SPEM1	Q8N4L4	309 aa		11.88	□□□□□ -0.51
SKAP2-209	ENST00000497511	IFT43	Q96FT9	208 aa		11.88	□□□□□ -0.51
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF274	Q96GC6	653 aa	Predicted RBP	11.88	□□□□□ -0.51
SKAP2-209	ENST00000497511	ASB16	Q96NS5	453 aa		11.88	□□□□□ -0.51
SKAP2-209	ENST00000497511	CXCL16	Q9H2A7	254 aa		11.88	□□□□□ -0.51
SKAP2-209	ENST00000497511	FZD8	Q9H461	694 aa		11.88	□□□□□ -0.51
SKAP2-209	ENST00000497511	TTC12	Q9H892	705 aa	Predicted RBP	11.88	□□□□□ -0.51
SKAP2-209	ENST00000497511	GOLGA2P5	Q9HBQ8	144 aa		11.88	□□□□□ -0.51
SKAP2-209	ENST00000497511	USP20	Q9Y2K6	914 aa		11.88	□□□□□ -0.51
SKAP2-209	ENST00000497511	NUB1	Q9Y5A7	615 aa		11.88	□□□□□ -0.51
SKAP2-209	ENST00000497511	CYP46A1	Q9Y6A2	500 aa		11.88	□□□□□ -0.51
SKAP2-209	ENST00000497511	WDR27	A2RRH5	827 aa		11.87	□□□□□ -0.51
SKAP2-209	ENST00000497511	SHISA7	A6NL88	538 aa		11.87	□□□□□ -0.51
SKAP2-209	ENST00000497511	SHISA8	B8ZZ34	492 aa		11.87	□□□□□ -0.51
SKAP2-209	ENST00000497511		H7C4K7	107 aa		11.87	□□□□□ -0.51
SKAP2-209	ENST00000497511	ACKR2	O00590	384 aa		11.87	□□□□□ -0.51
SKAP2-209	ENST00000497511	CHRNB1	P11230	501 aa		11.87	□□□□□ -0.51
SKAP2-209	ENST00000497511	AMPD1	P23109	780 aa		11.87	□□□□□ -0.51
SKAP2-209	ENST00000497511	TXK	P42681	527 aa		11.87	□□□□□ -0.51
SKAP2-209	ENST00000497511	RBM25	P49756	843 aa	Known RBP	11.87	□□□□□ -0.51
SKAP2-209	ENST00000497511	TOB2	Q14106	344 aa	Predicted RBP	11.87	□□□□□ -0.51
SKAP2-209	ENST00000497511	NAB2	Q15742	525 aa		11.87	□□□□□ -0.51
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM187B	Q17R55	369 aa		11.87	□□□□□ -0.51
SKAP2-209	ENST00000497511	CDCA2	Q69YH5	1023 aa	Predicted RBP	11.87	□□□□□ -0.51
SKAP2-209	ENST00000497511	C1orf228	Q6PIY5	440 aa		11.87	□□□□□ -0.51
SKAP2-209	ENST00000497511	ZSCAN18	Q8TBC5	510 aa	Predicted RBP	11.87	□□□□□ -0.51
SKAP2-209	ENST00000497511	HSD17B14	Q9BPX1	270 aa		11.87	□□□□□ -0.51
SKAP2-209	ENST00000497511	TRPV5	Q9NQA5	729 aa		11.87	□□□□□ -0.51

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