RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495787.1

ECHDC3-204, Transcript of enoyl-CoA hydratase domain containing 3, humanhuman

TSL 3

Gene ECHDC3, Length 505 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC3-204ENST00000495787 RGS18Q9NS28 235 aa11.43□□□□□ -0.58
ECHDC3-204ENST00000495787 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP11.43□□□□□ -0.58
ECHDC3-204ENST00000495787 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP11.43□□□□□ -0.58
ECHDC3-204ENST00000495787 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa11.43□□□□□ -0.58
ECHDC3-204ENST00000495787 JRKLQ9Y4A0 524 aa11.43□□□□□ -0.58
ECHDC3-204ENST00000495787 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa11.43□□□□□ -0.58
ECHDC3-204ENST00000495787 CHD7Q9P2D1 2997 aa11.42□□□□□ -0.58
ECHDC3-204ENST00000495787 MEIS3P2A8K0S8 358 aa11.42□□□□□ -0.58
ECHDC3-204ENST00000495787 PITPNM1O00562 1244 aa11.42□□□□□ -0.58
ECHDC3-204ENST00000495787 MED7O43513 233 aa11.42□□□□□ -0.58
ECHDC3-204ENST00000495787 LSM8O95777 96 aaKnown RBP11.42□□□□□ -0.58
ECHDC3-204ENST00000495787 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP11.42□□□□□ -0.58
ECHDC3-204ENST00000495787 CYP1A2P05177 515 aa11.42□□□□□ -0.58
ECHDC3-204ENST00000495787 THP07101 528 aa11.42□□□□□ -0.58
ECHDC3-204ENST00000495787 ABCB4P21439 1286 aa11.42□□□□□ -0.58
ECHDC3-204ENST00000495787 TAF6P49848 677 aa11.42□□□□□ -0.58
ECHDC3-204ENST00000495787 RAD23BP54727 409 aa11.42□□□□□ -0.58
ECHDC3-204ENST00000495787 HADHBP55084 474 aaKnown RBP11.42□□□□□ -0.58
ECHDC3-204ENST00000495787 AMPD2Q01433 879 aa11.42□□□□□ -0.58
ECHDC3-204ENST00000495787 CENPCQ03188 943 aa11.42□□□□□ -0.58
ECHDC3-204ENST00000495787 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP11.42□□□□□ -0.58
ECHDC3-204ENST00000495787 SV2CQ496J9 727 aa11.42□□□□□ -0.58
ECHDC3-204ENST00000495787 ZNF394Q53GI3 561 aa11.42□□□□□ -0.58
ECHDC3-204ENST00000495787 ECHDC2Q86YB7 292 aa11.42□□□□□ -0.58
ECHDC3-204ENST00000495787 SLC4A11Q8NBS3 891 aa11.42□□□□□ -0.58
ECHDC3-204ENST00000495787 GSTCDQ8NEC7 633 aa11.42□□□□□ -0.58
ECHDC3-204ENST00000495787 TPCN2Q8NHX9 752 aa11.42□□□□□ -0.58
ECHDC3-204ENST00000495787 SLC35G2Q8TBE7 412 aa11.42□□□□□ -0.58
ECHDC3-204ENST00000495787 WHAMMQ8TF30 809 aa11.42□□□□□ -0.58
ECHDC3-204ENST00000495787 LPPQ93052 612 aa11.42□□□□□ -0.58
ECHDC3-204ENST00000495787 CYFIP2Q96F07 1278 aa11.42□□□□□ -0.58
ECHDC3-204ENST00000495787 TRIM11Q96F44 468 aa11.42□□□□□ -0.58
ECHDC3-204ENST00000495787 TMEM176AQ96HP8 235 aa11.42□□□□□ -0.58
ECHDC3-204ENST00000495787 ZFP42Q96MM3 310 aa11.42□□□□□ -0.58
ECHDC3-204ENST00000495787 MMS19Q96T76 1030 aa11.42□□□□□ -0.58
ECHDC3-204ENST00000495787 FTHL17Q9BXU8 183 aa11.42□□□□□ -0.58
ECHDC3-204ENST00000495787 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa11.42□□□□□ -0.58
ECHDC3-204ENST00000495787 RSAD1Q9HA92 442 aa11.42□□□□□ -0.58
ECHDC3-204ENST00000495787 RNF19AQ9NV58 838 aa11.42□□□□□ -0.58
ECHDC3-204ENST00000495787 MIOSQ9NXC5 875 aa11.42□□□□□ -0.58
ECHDC3-204ENST00000495787 GDAP2Q9NXN4 497 aa11.42□□□□□ -0.58
ECHDC3-204ENST00000495787 CDC23Q9UJX2 597 aa11.42□□□□□ -0.58
ECHDC3-204ENST00000495787 GTF3C4Q9UKN8 822 aa11.42□□□□□ -0.58
ECHDC3-204ENST00000495787 KIAA1257Q9ULG3 409 aa11.42□□□□□ -0.58
ECHDC3-204ENST00000495787 PCDHGC3Q9UN70 934 aa11.42□□□□□ -0.58
ECHDC3-204ENST00000495787 SNX9Q9Y5X1 595 aa11.42□□□□□ -0.58
ECHDC3-204ENST00000495787 MRFAP1Q9Y605 127 aa11.42□□□□□ -0.58
ECHDC3-204ENST00000495787 XIRP2A4UGR9 3374 aa11.41□□□□□ -0.58
ECHDC3-204ENST00000495787 TANC1Q9C0D5 1861 aa11.41□□□□□ -0.58
ECHDC3-204ENST00000495787 GRID2IPA4D2P6 1211 aa11.41□□□□□ -0.58
ECHDC3-204ENST00000495787 ARL5CA6NH57 179 aa11.41□□□□□ -0.58
ECHDC3-204ENST00000495787 KPNA7A9QM74 516 aa11.41□□□□□ -0.58
ECHDC3-204ENST00000495787 C9IYK1 514 aa11.41□□□□□ -0.58
ECHDC3-204ENST00000495787 INPPL1O15357 1258 aa11.41□□□□□ -0.58
ECHDC3-204ENST00000495787 PALMO75781 387 aa11.41□□□□□ -0.58
ECHDC3-204ENST00000495787 MTA2O94776 668 aa11.41□□□□□ -0.58
ECHDC3-204ENST00000495787 SLU7O95391 586 aaKnown RBP11.41□□□□□ -0.58
ECHDC3-204ENST00000495787 EOMESO95936 686 aa11.41□□□□□ -0.58
ECHDC3-204ENST00000495787 FGBP02675 491 aa11.41□□□□□ -0.58
ECHDC3-204ENST00000495787 FAM163BP0C2L3 166 aa11.41□□□□□ -0.58
ECHDC3-204ENST00000495787 MYBL1P10243 752 aa11.41□□□□□ -0.58
ECHDC3-204ENST00000495787 VDRP11473 427 aa11.41□□□□□ -0.58
ECHDC3-204ENST00000495787 CD19P15391 556 aa11.41□□□□□ -0.58
ECHDC3-204ENST00000495787 PRLRP16471 622 aa11.41□□□□□ -0.58
ECHDC3-204ENST00000495787 BRD2P25440 801 aaKnown RBP11.41□□□□□ -0.58
ECHDC3-204ENST00000495787 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP11.41□□□□□ -0.58
ECHDC3-204ENST00000495787 CYP2C18P33260 490 aa11.41□□□□□ -0.58
ECHDC3-204ENST00000495787 MLH1P40692 756 aa11.41□□□□□ -0.58
ECHDC3-204ENST00000495787 NSFP46459 744 aaKnown RBP11.41□□□□□ -0.58
ECHDC3-204ENST00000495787 NOMO3P69849 1222 aa11.41□□□□□ -0.58
ECHDC3-204ENST00000495787 FAM189BP81408 668 aa11.41□□□□□ -0.58
ECHDC3-204ENST00000495787 NAA35Q5VZE5 725 aa11.41□□□□□ -0.58
ECHDC3-204ENST00000495787 PPP2R2DQ66LE6 453 aa11.41□□□□□ -0.58
ECHDC3-204ENST00000495787 SLC24A5Q71RS6 500 aa11.41□□□□□ -0.58
ECHDC3-204ENST00000495787 LIMS2Q7Z4I7 341 aa11.41□□□□□ -0.58
ECHDC3-204ENST00000495787 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP11.41□□□□□ -0.58
ECHDC3-204ENST00000495787 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP11.41□□□□□ -0.58
ECHDC3-204ENST00000495787 UNC93AQ86WB7 457 aa11.41□□□□□ -0.58
ECHDC3-204ENST00000495787 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP11.41□□□□□ -0.58
ECHDC3-204ENST00000495787 MCOLN2Q8IZK6 566 aa11.41□□□□□ -0.58
ECHDC3-204ENST00000495787 SYCE1Q8N0S2 351 aa11.41□□□□□ -0.58
ECHDC3-204ENST00000495787 ARHGEF26Q96DR7 871 aa11.41□□□□□ -0.58
ECHDC3-204ENST00000495787 VCPIP1Q96JH7 1222 aa11.41□□□□□ -0.58
ECHDC3-204ENST00000495787 ELOVL4Q9GZR5 314 aa11.41□□□□□ -0.58
ECHDC3-204ENST00000495787 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP11.41□□□□□ -0.58
ECHDC3-204ENST00000495787 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP11.41□□□□□ -0.58
ECHDC3-204ENST00000495787 ENC1O14682 589 aa11.4□□□□□ -0.58
ECHDC3-204ENST00000495787 PARNO95453 639 aaKnown RBP11.4□□□□□ -0.58
ECHDC3-204ENST00000495787 CFHP08603 1231 aa11.4□□□□□ -0.58
ECHDC3-204ENST00000495787 RPL9P32969 192 aaKnown RBP11.4□□□□□ -0.58
ECHDC3-204ENST00000495787 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP11.4□□□□□ -0.58
ECHDC3-204ENST00000495787 SCNN1GP51170 649 aa11.4□□□□□ -0.58
ECHDC3-204ENST00000495787 NDST1P52848 882 aa11.4□□□□□ -0.58
ECHDC3-204ENST00000495787 TFF2Q03403 129 aa11.4□□□□□ -0.58
ECHDC3-204ENST00000495787 GRIK3Q13003 919 aa11.4□□□□□ -0.58
ECHDC3-204ENST00000495787 STILQ15468 1287 aa11.4□□□□□ -0.58
ECHDC3-204ENST00000495787 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa11.4□□□□□ -0.58
ECHDC3-204ENST00000495787 MEI1Q5TIA1 1274 aa11.4□□□□□ -0.58
ECHDC3-204ENST00000495787 LIN9Q5TKA1 542 aa11.4□□□□□ -0.58
ECHDC3-204ENST00000495787 MON1BQ7L1V2 547 aa11.4□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 76.8 ms