RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495123.5

PKP4-216, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 5

Gene PKP4, Length 580 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-216ENST00000495123 CLSTN1O94985 981 aa9.27□□□□□ -0.93
PKP4-216ENST00000495123 PAPLNO95428 1278 aa9.27□□□□□ -0.93
PKP4-216ENST00000495123 ASS1P00966 412 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
PKP4-216ENST00000495123 LMO2P25791 158 aa9.27□□□□□ -0.93
PKP4-216ENST00000495123 RAP1GAPP47736 663 aa9.27□□□□□ -0.93
PKP4-216ENST00000495123 MXI1P50539 228 aa9.27□□□□□ -0.93
PKP4-216ENST00000495123 CDH8P55286 799 aa9.27□□□□□ -0.93
PKP4-216ENST00000495123 TNNC1P63316 161 aa9.27□□□□□ -0.93
PKP4-216ENST00000495123 ITIH3Q06033 890 aa9.27□□□□□ -0.93
PKP4-216ENST00000495123 GPR17Q13304 367 aa9.27□□□□□ -0.93
PKP4-216ENST00000495123 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa9.27□□□□□ -0.93
PKP4-216ENST00000495123 SLC39A12Q504Y0 691 aa9.27□□□□□ -0.93
PKP4-216ENST00000495123 ZNF667Q5HYK9 610 aa9.27□□□□□ -0.93
PKP4-216ENST00000495123 PPM1LQ5SGD2 360 aa9.27□□□□□ -0.93
PKP4-216ENST00000495123 LIN9Q5TKA1 542 aa9.27□□□□□ -0.93
PKP4-216ENST00000495123 TPGS2Q68CL5 300 aa9.27□□□□□ -0.93
PKP4-216ENST00000495123 KRT39Q6A163 491 aa9.27□□□□□ -0.93
PKP4-216ENST00000495123 CES5AQ6NT32 575 aa9.27□□□□□ -0.93
PKP4-216ENST00000495123 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa9.27□□□□□ -0.93
PKP4-216ENST00000495123 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
PKP4-216ENST00000495123 DPH6Q7L8W6 267 aa9.27□□□□□ -0.93
PKP4-216ENST00000495123 GPR149Q86SP6 731 aa9.27□□□□□ -0.93
PKP4-216ENST00000495123 THEM5Q8N1Q8 247 aa9.27□□□□□ -0.93
PKP4-216ENST00000495123 TMEM86AQ8N2M4 240 aa9.27□□□□□ -0.93
PKP4-216ENST00000495123 TTC9BQ8N6N2 239 aa9.27□□□□□ -0.93
PKP4-216ENST00000495123 ATAD1Q8NBU5 361 aa9.27□□□□□ -0.93
PKP4-216ENST00000495123 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
PKP4-216ENST00000495123 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
PKP4-216ENST00000495123 PKMYT1Q99640 499 aa9.27□□□□□ -0.93
PKP4-216ENST00000495123 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
PKP4-216ENST00000495123 PRKD2Q9BZL6 878 aa9.27□□□□□ -0.93
PKP4-216ENST00000495123 POMKQ9H5K3 350 aa9.27□□□□□ -0.93
PKP4-216ENST00000495123 SMYD3Q9H7B4 428 aa9.27□□□□□ -0.93
PKP4-216ENST00000495123 CYP4F11Q9HBI6 524 aa9.27□□□□□ -0.93
PKP4-216ENST00000495123 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
PKP4-216ENST00000495123 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa9.27□□□□□ -0.93
PKP4-216ENST00000495123 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
PKP4-216ENST00000495123 DPP7Q9UHL4 492 aa9.27□□□□□ -0.93
PKP4-216ENST00000495123 COL6A3P12111 3177 aa9.27□□□□□ -0.93
PKP4-216ENST00000495123 MYBPHLA2RUH7 354 aa9.26□□□□□ -0.93
PKP4-216ENST00000495123 STX10O60499 249 aa9.26□□□□□ -0.93
PKP4-216ENST00000495123 ATP2C2O75185 946 aa9.26□□□□□ -0.93
PKP4-216ENST00000495123 TACC1O75410 805 aa9.26□□□□□ -0.93
PKP4-216ENST00000495123 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
PKP4-216ENST00000495123 GNA14O95837 355 aa9.26□□□□□ -0.93
PKP4-216ENST00000495123 WARSP23381 471 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
PKP4-216ENST00000495123 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
PKP4-216ENST00000495123 ELF1P32519 619 aa9.26□□□□□ -0.93
PKP4-216ENST00000495123 LHX1P48742 406 aa9.26□□□□□ -0.93
PKP4-216ENST00000495123 FMO5P49326 533 aa9.26□□□□□ -0.93
PKP4-216ENST00000495123 MARSP56192 900 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
PKP4-216ENST00000495123 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
PKP4-216ENST00000495123 NOP14P78316 857 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
PKP4-216ENST00000495123 MYL7Q01449 175 aa9.26□□□□□ -0.93
PKP4-216ENST00000495123 DUSP4Q13115 394 aa9.26□□□□□ -0.93
PKP4-216ENST00000495123 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
PKP4-216ENST00000495123 UVSSAQ2YD98 709 aa9.26□□□□□ -0.93
PKP4-216ENST00000495123 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
PKP4-216ENST00000495123 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa9.26□□□□□ -0.93
PKP4-216ENST00000495123 SASS6Q6UVJ0 657 aa9.26□□□□□ -0.93
PKP4-216ENST00000495123 CCDC149Q6ZUS6 474 aa9.26□□□□□ -0.93
PKP4-216ENST00000495123 IRF2BP1Q8IU81 584 aa9.26□□□□□ -0.93
PKP4-216ENST00000495123 CREBRFQ8IUR6 639 aa9.26□□□□□ -0.93
PKP4-216ENST00000495123 TRIM59Q8IWR1 403 aa9.26□□□□□ -0.93
PKP4-216ENST00000495123 TCEAL8Q8IYN2 117 aa9.26□□□□□ -0.93
PKP4-216ENST00000495123 OR6B3Q8NGW1 331 aa9.26□□□□□ -0.93
PKP4-216ENST00000495123 SPATA18Q8TC71 538 aa9.26□□□□□ -0.93
PKP4-216ENST00000495123 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa9.26□□□□□ -0.93
PKP4-216ENST00000495123 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
PKP4-216ENST00000495123 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
PKP4-216ENST00000495123 ACBD6Q9BR61 282 aa9.26□□□□□ -0.93
PKP4-216ENST00000495123 RAB20Q9NX57 234 aa9.26□□□□□ -0.93
PKP4-216ENST00000495123 DACH1Q9UI36 760 aa9.26□□□□□ -0.93
PKP4-216ENST00000495123 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa9.26□□□□□ -0.93
PKP4-216ENST00000495123 YIPF1Q9Y548 306 aa9.26□□□□□ -0.93
PKP4-216ENST00000495123 INSL5Q9Y5Q6 135 aa9.26□□□□□ -0.93
PKP4-216ENST00000495123 PRRG1O14668 218 aa9.25□□□□□ -0.93
PKP4-216ENST00000495123 SOAT2O75908 522 aa9.25□□□□□ -0.93
PKP4-216ENST00000495123 PDGFRBP09619 1106 aa9.25□□□□□ -0.93
PKP4-216ENST00000495123 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP9.25□□□□□ -0.93
PKP4-216ENST00000495123 CCDC192P0DO97 292 aa9.25□□□□□ -0.93
PKP4-216ENST00000495123 SP100P23497 879 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
PKP4-216ENST00000495123 HOXA9P31269 272 aa9.25□□□□□ -0.93
PKP4-216ENST00000495123 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
PKP4-216ENST00000495123 MTHFRP42898 656 aa9.25□□□□□ -0.93
PKP4-216ENST00000495123 ASPAP45381 313 aa9.25□□□□□ -0.93
PKP4-216ENST00000495123 NTHL1P78549 312 aa9.25□□□□□ -0.93
PKP4-216ENST00000495123 TSPY1Q01534 308 aa9.25□□□□□ -0.93
PKP4-216ENST00000495123 ZP2Q05996 745 aa9.25□□□□□ -0.93
PKP4-216ENST00000495123 TYRO3Q06418 890 aa9.25□□□□□ -0.93
PKP4-216ENST00000495123 TWF1Q12792 350 aa9.25□□□□□ -0.93
PKP4-216ENST00000495123 KCNH2Q12809 1159 aa9.25□□□□□ -0.93
PKP4-216ENST00000495123 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
PKP4-216ENST00000495123 KLHL40Q2TBA0 621 aa9.25□□□□□ -0.93
PKP4-216ENST00000495123 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa9.25□□□□□ -0.93
PKP4-216ENST00000495123 ATAT1Q5SQI0 421 aa9.25□□□□□ -0.93
PKP4-216ENST00000495123 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
PKP4-216ENST00000495123 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
PKP4-216ENST00000495123 FBXL13Q8NEE6 735 aa9.25□□□□□ -0.93
PKP4-216ENST00000495123 TAF4BQ92750 862 aa9.25□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18 ms