RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493967.1

PATJ-211, Transcript of PATJ, crumbs cell polarity complex component, humanhuman

TSL 2

Gene PATJ, Length 574 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATJ-211ENST00000493967 KINO60870 393 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
PATJ-211ENST00000493967 AKAP3O75969 853 aa8.05□□□□□ -1.12
PATJ-211ENST00000493967 SMC2O95347 1197 aa8.05□□□□□ -1.12
PATJ-211ENST00000493967 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
PATJ-211ENST00000493967 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
PATJ-211ENST00000493967 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
PATJ-211ENST00000493967 MYL4P12829 197 aa8.05□□□□□ -1.12
PATJ-211ENST00000493967 PRCPP42785 496 aa8.05□□□□□ -1.12
PATJ-211ENST00000493967 ALDH1A3P47895 512 aa8.05□□□□□ -1.12
PATJ-211ENST00000493967 EPHB3P54753 998 aa8.05□□□□□ -1.12
PATJ-211ENST00000493967 CLDN10P78369 228 aa8.05□□□□□ -1.12
PATJ-211ENST00000493967 MYL7Q01449 175 aa8.05□□□□□ -1.12
PATJ-211ENST00000493967 TSPY1Q01534 308 aa8.05□□□□□ -1.12
PATJ-211ENST00000493967 ADAM9Q13443 819 aa8.05□□□□□ -1.12
PATJ-211ENST00000493967 BIRC3Q13489 604 aa8.05□□□□□ -1.12
PATJ-211ENST00000493967 TRPC3Q13507 836 aa8.05□□□□□ -1.12
PATJ-211ENST00000493967 HTR4Q13639 388 aa8.05□□□□□ -1.12
PATJ-211ENST00000493967 WDR72Q3MJ13 1102 aa8.05□□□□□ -1.12
PATJ-211ENST00000493967 MGAT5BQ3V5L5 792 aa8.05□□□□□ -1.12
PATJ-211ENST00000493967 ZCWPW2Q504Y3 356 aa8.05□□□□□ -1.12
PATJ-211ENST00000493967 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
PATJ-211ENST00000493967 PRSS36Q5K4E3 855 aa8.05□□□□□ -1.12
PATJ-211ENST00000493967 C1orf220Q5T0J3 134 aa8.05□□□□□ -1.12
PATJ-211ENST00000493967 CYP4A22Q5TCH4 519 aa8.05□□□□□ -1.12
PATJ-211ENST00000493967 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
PATJ-211ENST00000493967 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
PATJ-211ENST00000493967 PARM1Q6UWI2 310 aa8.05□□□□□ -1.12
PATJ-211ENST00000493967 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
PATJ-211ENST00000493967 LIMS2Q7Z4I7 341 aa8.05□□□□□ -1.12
PATJ-211ENST00000493967 UBALD2Q8IYN6 164 aa8.05□□□□□ -1.12
PATJ-211ENST00000493967 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
PATJ-211ENST00000493967 TMEM86AQ8N2M4 240 aa8.05□□□□□ -1.12
PATJ-211ENST00000493967 SLC44A3Q8N4M1 653 aa8.05□□□□□ -1.12
PATJ-211ENST00000493967 SPATA20Q8TB22 786 aa8.05□□□□□ -1.12
PATJ-211ENST00000493967 GPR152Q8TDT2 470 aa8.05□□□□□ -1.12
PATJ-211ENST00000493967 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa8.05□□□□□ -1.12
PATJ-211ENST00000493967 FGF14Q92915 247 aa8.05□□□□□ -1.12
PATJ-211ENST00000493967 PBXIP1Q96AQ6 731 aa8.05□□□□□ -1.12
PATJ-211ENST00000493967 EEF2KMTQ96G04 330 aa8.05□□□□□ -1.12
PATJ-211ENST00000493967 GSDMAQ96QA5 445 aa8.05□□□□□ -1.12
PATJ-211ENST00000493967 MMS19Q96T76 1030 aa8.05□□□□□ -1.12
PATJ-211ENST00000493967 LPIN3Q9BQK8 851 aa8.05□□□□□ -1.12
PATJ-211ENST00000493967 ACBD6Q9BR61 282 aa8.05□□□□□ -1.12
PATJ-211ENST00000493967 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
PATJ-211ENST00000493967 PI4K2AQ9BTU6 479 aa8.05□□□□□ -1.12
PATJ-211ENST00000493967 XYLT2Q9H1B5 865 aa8.05□□□□□ -1.12
PATJ-211ENST00000493967 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
PATJ-211ENST00000493967 ASAH2Q9NR71 780 aa8.05□□□□□ -1.12
PATJ-211ENST00000493967 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
PATJ-211ENST00000493967 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
PATJ-211ENST00000493967 GTF3C4Q9UKN8 822 aa8.05□□□□□ -1.12
PATJ-211ENST00000493967 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
PATJ-211ENST00000493967 PTPRDP23468 1912 aa8.05□□□□□ -1.12
PATJ-211ENST00000493967 KMT2EQ8IZD2 1858 aa8.04□□□□□ -1.12
PATJ-211ENST00000493967 DENND4CQ5VZ89 1909 aa8.04□□□□□ -1.12
PATJ-211ENST00000493967 MYBPHLA2RUH7 354 aa8.04□□□□□ -1.12
PATJ-211ENST00000493967 ZNF197O14709 1029 aa8.04□□□□□ -1.12
PATJ-211ENST00000493967 GABRDO14764 452 aa8.04□□□□□ -1.12
PATJ-211ENST00000493967 ATP2C2O75185 946 aa8.04□□□□□ -1.12
PATJ-211ENST00000493967 MOSPD3O75425 235 aa8.04□□□□□ -1.12
PATJ-211ENST00000493967 CLSTN1O94985 981 aa8.04□□□□□ -1.12
PATJ-211ENST00000493967 VNN1O95497 513 aa8.04□□□□□ -1.12
PATJ-211ENST00000493967 CFHP08603 1231 aa8.04□□□□□ -1.12
PATJ-211ENST00000493967 PDGFRBP09619 1106 aa8.04□□□□□ -1.12
PATJ-211ENST00000493967 TRIM49P0CI25 452 aa8.04□□□□□ -1.12
PATJ-211ENST00000493967 TRIM49CP0CI26 452 aa8.04□□□□□ -1.12
PATJ-211ENST00000493967 ATF6P18850 670 aa8.04□□□□□ -1.12
PATJ-211ENST00000493967 LMO2P25791 158 aa8.04□□□□□ -1.12
PATJ-211ENST00000493967 RPL13P26373 211 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
PATJ-211ENST00000493967 LHX1P48742 406 aa8.04□□□□□ -1.12
PATJ-211ENST00000493967 TUFMP49411 452 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
PATJ-211ENST00000493967 GPR15P49685 360 aa8.04□□□□□ -1.12
PATJ-211ENST00000493967 VAMP7P51809 220 aa8.04□□□□□ -1.12
PATJ-211ENST00000493967 AP3M2P53677 418 aa8.04□□□□□ -1.12
PATJ-211ENST00000493967 PMS1P54277 932 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
PATJ-211ENST00000493967 EPHA5P54756 1037 aa8.04□□□□□ -1.12
PATJ-211ENST00000493967 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
PATJ-211ENST00000493967 TNNC1P63316 161 aa8.04□□□□□ -1.12
PATJ-211ENST00000493967 SMARCB1Q12824 385 aa8.04□□□□□ -1.12
PATJ-211ENST00000493967 PLD1Q13393 1074 aa8.04□□□□□ -1.12
PATJ-211ENST00000493967 NCOA4Q13772 614 aa8.04□□□□□ -1.12
PATJ-211ENST00000493967 NFIL3Q16649 462 aa8.04□□□□□ -1.12
PATJ-211ENST00000493967 ZACNQ401N2 412 aa8.04□□□□□ -1.12
PATJ-211ENST00000493967 SDHAF4Q5VUM1 108 aa8.04□□□□□ -1.12
PATJ-211ENST00000493967 DPH6Q7L8W6 267 aa8.04□□□□□ -1.12
PATJ-211ENST00000493967 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
PATJ-211ENST00000493967 TMC8Q8IU68 726 aa8.04□□□□□ -1.12
PATJ-211ENST00000493967 FAM186BQ8IYM0 893 aa8.04□□□□□ -1.12
PATJ-211ENST00000493967 STKLD1Q8NE28 680 aa8.04□□□□□ -1.12
PATJ-211ENST00000493967 SHKBP1Q8TBC3 707 aa8.04□□□□□ -1.12
PATJ-211ENST00000493967 FAM200AQ8TCP9 573 aa8.04□□□□□ -1.12
PATJ-211ENST00000493967 SPPL2BQ8TCT7 592 aa8.04□□□□□ -1.12
PATJ-211ENST00000493967 TMC2Q8TDI7 906 aa8.04□□□□□ -1.12
PATJ-211ENST00000493967 GIPC2Q8TF65 315 aa8.04□□□□□ -1.12
PATJ-211ENST00000493967 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
PATJ-211ENST00000493967 PSMG2Q969U7 264 aa8.04□□□□□ -1.12
PATJ-211ENST00000493967 PKMYT1Q99640 499 aa8.04□□□□□ -1.12
PATJ-211ENST00000493967 KXD1Q9BQD3 176 aa8.04□□□□□ -1.12
PATJ-211ENST00000493967 SYT15Q9BQS2 421 aa8.04□□□□□ -1.12
PATJ-211ENST00000493967 LRRC3Q9BY71 257 aa8.04□□□□□ -1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.2 ms