RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490812.5

PTPN18-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 18, humanhuman

TSL 5

Gene PTPN18, Length 833 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN18-215ENST00000490812 GJA1P17302 382 aa22.9■■□□□ 1.26
PTPN18-215ENST00000490812 MYO1EQ12965 1108 aa22.9■■□□□ 1.26
PTPN18-215ENST00000490812 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
PTPN18-215ENST00000490812 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
PTPN18-215ENST00000490812 C12orf56Q8IXR9 622 aa22.9■■□□□ 1.26
PTPN18-215ENST00000490812 TOP6BLQ8N6T0 577 aa22.9■■□□□ 1.26
PTPN18-215ENST00000490812 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa22.9■■□□□ 1.26
PTPN18-215ENST00000490812 SPATA32Q96LK8 384 aa22.9■■□□□ 1.26
PTPN18-215ENST00000490812 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa22.9■■□□□ 1.26
PTPN18-215ENST00000490812 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa22.9■■□□□ 1.26
PTPN18-215ENST00000490812 SERTAD1Q9UHV2 236 aa22.9■■□□□ 1.26
PTPN18-215ENST00000490812 ZDHHC9Q9Y397 364 aa22.9■■□□□ 1.26
PTPN18-215ENST00000490812 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa22.9■■□□□ 1.26
PTPN18-215ENST00000490812 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
PTPN18-215ENST00000490812 MYL1P05976 194 aa22.89■■□□□ 1.25
PTPN18-215ENST00000490812 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
PTPN18-215ENST00000490812 PSMC3P17980 439 aa22.89■■□□□ 1.25
PTPN18-215ENST00000490812 ATF6P18850 670 aa22.89■■□□□ 1.25
PTPN18-215ENST00000490812 MYL7Q01449 175 aa22.89■■□□□ 1.25
PTPN18-215ENST00000490812 ANGPT1Q15389 498 aa22.89■■□□□ 1.25
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PTPN18-215ENST00000490812 NELFCDQ8IXH7 590 aa22.89■■□□□ 1.25
PTPN18-215ENST00000490812 XXYLT1Q8NBI6 393 aa22.89■■□□□ 1.25
PTPN18-215ENST00000490812 OR5B17Q8NGF7 314 aa22.89■■□□□ 1.25
PTPN18-215ENST00000490812 FAM200AQ8TCP9 573 aa22.89■■□□□ 1.25
PTPN18-215ENST00000490812 FAM84AQ96KN4 292 aa22.89■■□□□ 1.25
PTPN18-215ENST00000490812 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
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PTPN18-215ENST00000490812 FOXQ1Q9C009 403 aa22.89■■□□□ 1.25
PTPN18-215ENST00000490812 SLC39A2Q9NP94 309 aa22.89■■□□□ 1.25
PTPN18-215ENST00000490812 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
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PTPN18-215ENST00000490812 SNX9Q9Y5X1 595 aa22.89■■□□□ 1.25
PTPN18-215ENST00000490812 MYO15AQ9UKN7 3530 aa22.88■■□□□ 1.25
PTPN18-215ENST00000490812 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
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PTPN18-215ENST00000490812 PFKFB1P16118 471 aa22.88■■□□□ 1.25
PTPN18-215ENST00000490812 NBL1P41271 181 aa22.88■■□□□ 1.25
PTPN18-215ENST00000490812 LHX1P48742 406 aa22.88■■□□□ 1.25
PTPN18-215ENST00000490812 PSMD6Q15008 389 aa22.88■■□□□ 1.25
PTPN18-215ENST00000490812 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
PTPN18-215ENST00000490812 VITQ6UXI7 678 aa22.88■■□□□ 1.25
PTPN18-215ENST00000490812 GAREM2Q75VX8 874 aa22.88■■□□□ 1.25
PTPN18-215ENST00000490812 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa22.88■■□□□ 1.25
PTPN18-215ENST00000490812 GOLGA5Q8TBA6 731 aa22.88■■□□□ 1.25
PTPN18-215ENST00000490812 IRF7Q92985 503 aa22.88■■□□□ 1.25
PTPN18-215ENST00000490812 PAGE5Q96GU1 130 aa22.88■■□□□ 1.25
PTPN18-215ENST00000490812 HPDLQ96IR7 371 aa22.88■■□□□ 1.25
PTPN18-215ENST00000490812 LPIN3Q9BQK8 851 aa22.88■■□□□ 1.25
PTPN18-215ENST00000490812 BRD9Q9H8M2 597 aa22.88■■□□□ 1.25
PTPN18-215ENST00000490812 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
PTPN18-215ENST00000490812 TRPV5Q9NQA5 729 aa22.88■■□□□ 1.25
PTPN18-215ENST00000490812 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
PTPN18-215ENST00000490812 HPSEQ9Y251 543 aa22.88■■□□□ 1.25
PTPN18-215ENST00000490812 USP34Q70CQ2 3546 aa22.87■■□□□ 1.25
PTPN18-215ENST00000490812 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
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PTPN18-215ENST00000490812 GABRR2P28476 465 aa22.87■■□□□ 1.25
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PTPN18-215ENST00000490812 CYP24A1Q07973 514 aa22.87■■□□□ 1.25
PTPN18-215ENST00000490812 PSMD2Q13200 908 aa22.87■■□□□ 1.25
PTPN18-215ENST00000490812 GRM2Q14416 872 aa22.87■■□□□ 1.25
PTPN18-215ENST00000490812 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
PTPN18-215ENST00000490812 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa22.87■■□□□ 1.25
PTPN18-215ENST00000490812 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
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PTPN18-215ENST00000490812 MFSD6LQ8IWD5 586 aa22.87■■□□□ 1.25
PTPN18-215ENST00000490812 ADGRF2Q8IZF7 708 aa22.87■■□□□ 1.25
PTPN18-215ENST00000490812 FNBP1Q96RU3 617 aa22.87■■□□□ 1.25
PTPN18-215ENST00000490812 NELL2Q99435 816 aa22.87■■□□□ 1.25
PTPN18-215ENST00000490812 ATXN3LQ9H3M9 355 aa22.87■■□□□ 1.25
PTPN18-215ENST00000490812 ABCB6Q9NP58 842 aa22.87■■□□□ 1.25
PTPN18-215ENST00000490812 EXOC1Q9NV70 894 aa22.87■■□□□ 1.25
PTPN18-215ENST00000490812 F5P12259 2224 aa22.87■■□□□ 1.25
PTPN18-215ENST00000490812 COL4A2P08572 1712 aa22.86■■□□□ 1.25
PTPN18-215ENST00000490812 CLIC2O15247 247 aa22.86■■□□□ 1.25
PTPN18-215ENST00000490812 PCSK1P29120 753 aa22.86■■□□□ 1.25
PTPN18-215ENST00000490812 VIPR2P41587 438 aa22.86■■□□□ 1.25
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PTPN18-215ENST00000490812 TPRG1Q6ZUI0 275 aa22.86■■□□□ 1.25
PTPN18-215ENST00000490812 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa22.86■■□□□ 1.25
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PTPN18-215ENST00000490812 RDH13Q8NBN7 331 aa22.86■■□□□ 1.25
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PTPN18-215ENST00000490812 PKMYT1Q99640 499 aa22.86■■□□□ 1.25
PTPN18-215ENST00000490812 CGRRF1Q99675 332 aa22.86■■□□□ 1.25
PTPN18-215ENST00000490812 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
PTPN18-215ENST00000490812 LTB4R2Q9NPC1 389 aa22.86■■□□□ 1.25
PTPN18-215ENST00000490812 TMLHEQ9NVH6 421 aa22.86■■□□□ 1.25
PTPN18-215ENST00000490812 ZMYM5Q9UJ78 669 aa22.86■■□□□ 1.25
PTPN18-215ENST00000490812 COL4A3Q01955 1670 aa22.86■■□□□ 1.25
PTPN18-215ENST00000490812 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa22.85■■□□□ 1.25
PTPN18-215ENST00000490812 DLATP10515 647 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
PTPN18-215ENST00000490812 TNNI1P19237 187 aa22.85■■□□□ 1.25
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