RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490812.5

PTPN18-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 18, humanhuman

TSL 5

Gene PTPN18, Length 833 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN18-215ENST00000490812 NISCHQ9Y2I1 1504 aa52.73■■■■■ 6.03
PTPN18-215ENST00000490812 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa47.19■■■■■ 5.14
PTPN18-215ENST00000490812 ABCC9O60706 1549 aa46.57■■■■■ 5.05
PTPN18-215ENST00000490812 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa44.65■■■■■ 4.74
PTPN18-215ENST00000490812 NACADO15069 1562 aa44.47■■■■■ 4.71
PTPN18-215ENST00000490812 DCAF8L2P0C7V8 631 aa44.14■■■■■ 4.66
PTPN18-215ENST00000490812 MYO15BQ96JP2 1530 aa44.07■■■■■ 4.65
PTPN18-215ENST00000490812 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP43.82■■■■■ 4.6
PTPN18-215ENST00000490812 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa43.66■■■■■ 4.58
PTPN18-215ENST00000490812 UNC13AQ9UPW8 1703 aa43.62■■■■■ 4.57
PTPN18-215ENST00000490812 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP43.38■■■■■ 4.53
PTPN18-215ENST00000490812 BICRAQ9NZM4 1560 aa43.29■■■■■ 4.52
PTPN18-215ENST00000490812 DNAJC5BQ9UF47 199 aa43.19■■■■■ 4.5
PTPN18-215ENST00000490812 SCRIBQ14160 1630 aa42.92■■■■■ 4.46
PTPN18-215ENST00000490812 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa42.87■■■■■ 4.45
PTPN18-215ENST00000490812 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP42.19■■■■■ 4.34
PTPN18-215ENST00000490812 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa42.15■■■■■ 4.34
PTPN18-215ENST00000490812 CECR2Q9BXF3 1484 aa41.94■■■■■ 4.3
PTPN18-215ENST00000490812 SMARCA4P51532 1647 aa41.04■■■■■ 4.16
PTPN18-215ENST00000490812 NCAPD3P42695 1498 aa41.02■■■■■ 4.16
PTPN18-215ENST00000490812 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa40.93■■■■■ 4.14
PTPN18-215ENST00000490812 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP40.93■■■■■ 4.14
PTPN18-215ENST00000490812 SMARCA2P51531 1590 aa40.9■■■■■ 4.14
PTPN18-215ENST00000490812 HMGXB3Q12766 1538 aa40.79■■■■■ 4.12
PTPN18-215ENST00000490812 PEG3Q9GZU2 1588 aa40.69■■■■■ 4.1
PTPN18-215ENST00000490812 MROH2BQ7Z745 1585 aa40.59■■■■■ 4.09
PTPN18-215ENST00000490812 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP40.58■■■■■ 4.09
PTPN18-215ENST00000490812 ERCC6Q03468 1493 aa40.21■■■■■ 4.03
PTPN18-215ENST00000490812 WIZO95785 1651 aa40.14■■■■■ 4.02
PTPN18-215ENST00000490812 NESP48681 1621 aa40.13■■■■■ 4.02
PTPN18-215ENST00000490812 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa40.04■■■■■ 4
PTPN18-215ENST00000490812 CUX2O14529 1486 aa40.03■■■■■ 4
PTPN18-215ENST00000490812 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP39.93■■■■□ 3.98
PTPN18-215ENST00000490812 PDS5BQ9NTI5 1447 aa39.77■■■■□ 3.96
PTPN18-215ENST00000490812 CADPSQ9ULU8 1353 aa39.77■■■■□ 3.96
PTPN18-215ENST00000490812 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP39.72■■■■□ 3.95
PTPN18-215ENST00000490812 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP39.71■■■■□ 3.95
PTPN18-215ENST00000490812 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa39.7■■■■□ 3.95
PTPN18-215ENST00000490812 CFTRP13569 1480 aa39.44■■■■□ 3.9
PTPN18-215ENST00000490812 MRC2Q9UBG0 1479 aa39.39■■■■□ 3.9
PTPN18-215ENST00000490812 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa39.38■■■■□ 3.89
PTPN18-215ENST00000490812 CEP164Q9UPV0 1460 aa39.33■■■■□ 3.89
PTPN18-215ENST00000490812 FANCD2Q9BXW9 1451 aa39.31■■■■□ 3.88
PTPN18-215ENST00000490812 WDR62O43379 1518 aa39.3■■■■□ 3.88
PTPN18-215ENST00000490812 CCDC88BA6NC98 1476 aa39.21■■■■□ 3.87
PTPN18-215ENST00000490812 PRDM2Q13029 1718 aa39.15■■■■□ 3.86
PTPN18-215ENST00000490812 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP38.94■■■■□ 3.82
PTPN18-215ENST00000490812 ABCC8Q09428 1581 aa38.64■■■■□ 3.78
PTPN18-215ENST00000490812 TOPBP1Q92547 1522 aa38.63■■■■□ 3.77
PTPN18-215ENST00000490812 DNMBPQ6XZF7 1577 aa38.56■■■■□ 3.76
PTPN18-215ENST00000490812 IFT140Q96RY7 1462 aa38.54■■■■□ 3.76
PTPN18-215ENST00000490812 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP38.43■■■■□ 3.74
PTPN18-215ENST00000490812 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP38.37■■■■□ 3.73
PTPN18-215ENST00000490812 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP38.27■■■■□ 3.72
PTPN18-215ENST00000490812 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP38.27■■■■□ 3.72
PTPN18-215ENST00000490812 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP38.23■■■■□ 3.71
PTPN18-215ENST00000490812 OSCARQ8IYS5 282 aa38.22■■■■□ 3.71
PTPN18-215ENST00000490812 CUX1P39880 1505 aa38.12■■■■□ 3.69
PTPN18-215ENST00000490812 FGD5Q6ZNL6 1462 aa38.09■■■■□ 3.69
PTPN18-215ENST00000490812 SOGA1O94964 1423 aa38.08■■■■□ 3.69
PTPN18-215ENST00000490812 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP38.06■■■■□ 3.68
PTPN18-215ENST00000490812 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa38.06■■■■□ 3.68
PTPN18-215ENST00000490812 WDR97A6NE52 1622 aa38.01■■■■□ 3.67
PTPN18-215ENST00000490812 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP37.91■■■■□ 3.66
PTPN18-215ENST00000490812 CHD1O14646 1710 aa37.85■■■■□ 3.65
PTPN18-215ENST00000490812 TRIM41Q8WV44 630 aa37.78■■■■□ 3.64
PTPN18-215ENST00000490812 GRIN2BQ13224 1484 aa37.73■■■■□ 3.63
PTPN18-215ENST00000490812 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa37.73■■■■□ 3.63
PTPN18-215ENST00000490812 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa37.71■■■■□ 3.63
PTPN18-215ENST00000490812 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP37.71■■■■□ 3.63
PTPN18-215ENST00000490812 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa37.7■■■■□ 3.63
PTPN18-215ENST00000490812 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa37.69■■■■□ 3.62
PTPN18-215ENST00000490812 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa37.69■■■■□ 3.62
PTPN18-215ENST00000490812 TOP2BQ02880 1626 aa37.69■■■■□ 3.62
PTPN18-215ENST00000490812 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa37.69■■■■□ 3.62
PTPN18-215ENST00000490812 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP37.69■■■■□ 3.62
PTPN18-215ENST00000490812 FBLN2P98095 1184 aa37.68■■■■□ 3.62
PTPN18-215ENST00000490812 GAPVD1Q14C86 1478 aa37.64■■■■□ 3.62
PTPN18-215ENST00000490812 ARHGEF11O15085 1522 aa37.63■■■■□ 3.61
PTPN18-215ENST00000490812 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa37.63■■■■□ 3.61
PTPN18-215ENST00000490812 PBRM1Q86U86 1689 aa37.63■■■■□ 3.61
PTPN18-215ENST00000490812 SYNJ1O43426 1573 aa37.62■■■■□ 3.61
PTPN18-215ENST00000490812 SYNJ2O15056 1496 aa37.56■■■■□ 3.6
PTPN18-215ENST00000490812 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP37.54■■■■□ 3.6
PTPN18-215ENST00000490812 CLASP1Q7Z460 1538 aa37.45■■■■□ 3.59
PTPN18-215ENST00000490812 ADAMTS12P58397 1594 aa37.3■■■■□ 3.56
PTPN18-215ENST00000490812 ARAP1Q96P48 1450 aa37.27■■■■□ 3.56
PTPN18-215ENST00000490812 ERICH3Q5RHP9 1530 aa37.27■■■■□ 3.56
PTPN18-215ENST00000490812 CYB5RLQ6IPT4 315 aa37.24■■■■□ 3.55
PTPN18-215ENST00000490812 GRIN2AQ12879 1464 aa37.24■■■■□ 3.55
PTPN18-215ENST00000490812 FHAD1B1AJZ9 1412 aa37.2■■■■□ 3.55
PTPN18-215ENST00000490812 NUP160Q12769 1436 aa37.1■■■■□ 3.53
PTPN18-215ENST00000490812 CEP170Q5SW79 1584 aa37.08■■■■□ 3.53
PTPN18-215ENST00000490812 KIF27Q86VH2 1401 aa36.94■■■■□ 3.5
PTPN18-215ENST00000490812 SHROOM2Q13796 1616 aa36.92■■■■□ 3.5
PTPN18-215ENST00000490812 CUL7Q14999 1698 aa36.84■■■■□ 3.49
PTPN18-215ENST00000490812 IGF1RP08069 1367 aa36.84■■■■□ 3.49
PTPN18-215ENST00000490812 ERCC6L2Q5T890 1561 aa36.83■■■■□ 3.49
PTPN18-215ENST00000490812 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa36.77■■■■□ 3.48
PTPN18-215ENST00000490812 TRHP20396 242 aaPredicted RBP36.67■■■■□ 3.46
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