RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489343.5

NPHP3-AS1-201, NPHP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NPHP3-AS1, Length 2,957 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HOXC6P09630 235 aa16.41■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GZMAP12544 262 aa16.41■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MBTD1Q05BQ5 628 aa16.41■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 AMHR2Q16671 573 aa16.41■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP16.41■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CAPN12Q6ZSI9 719 aa16.41■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GPR142Q7Z601 462 aa16.41■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 BRSK2Q8IWQ3 736 aa16.41■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CCDC13Q8IYE1 715 aa16.41■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP16.41■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TWNKQ96RR1 684 aa16.41■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MROH8Q9H579 483 aa16.41■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KCNK9Q9NPC2 374 aa16.41■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP16.41■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP16.41■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa16.41■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa16.41■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HCRTO43612 131 aa16.41■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ITGB3P05106 788 aa16.41■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP16.41■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ADCY2Q08462 1091 aa16.41■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MTM1Q13496 603 aa16.41■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PPP2R5EQ16537 467 aa16.41■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZNF699Q32M78 642 aa16.41■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CD101Q93033 1021 aa16.41■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 OSBPL7Q9BZF2 842 aa16.41■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SMYD3Q9H7B4 428 aa16.41■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 C10orf88Q9H8K7 445 aa16.41■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LACTBL1A8MY62 500 aa16.41■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 H3BRB1 525 aa16.41■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PODXLO00592 558 aa16.41■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 OGTO15294 1046 aa16.41■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RIPK2O43353 540 aa16.41■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KRT10P13645 584 aa16.41■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 BEX3Q00994 111 aa16.41■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KYNUQ16719 465 aa16.41■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 JADE1Q6IE81 842 aa16.41■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ARMC2Q8NEN0 867 aa16.41■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP16.41■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 IMPG2Q9BZV3 1241 aa16.41■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP16.41■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NMRK2Q9NPI5 230 aa16.41■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP16.41■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ERAP1Q9NZ08 941 aa16.41■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LRRC37A2A6NM11 1700 aa16.41■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 H0YCG3 227 aa16.4■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CYP1A2P05177 515 aa16.4■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ADCY8P40145 1251 aa16.4■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 EMC10Q5UCC4 262 aa16.4■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CHMP6Q96FZ7 201 aa16.4■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP16.4■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP16.4■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PCYOX1Q9UHG3 505 aa16.4■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP16.4■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DNM1LO00429 736 aa16.4■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LGR5O75473 907 aa16.4■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP16.4■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP16.4■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP16.4■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZNF792Q3KQV3 632 aa16.4■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LRRC34Q8IZ02 419 aa16.4■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 EMC1Q8N766 993 aa16.4■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GDAP1Q8TB36 358 aa16.4■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TLCD1Q96CP7 247 aa16.4■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TBC1D31Q96DN5 1066 aa16.4■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SDCBP2Q9H190 292 aa16.4■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ATP8B3O60423 1300 aa16.4■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa16.4■□□□□ 0.22
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 STAG3L1P0CL83 205 aa16.39■□□□□ 0.21
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RALAP11233 206 aa16.39■□□□□ 0.21
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NOMO3P69849 1222 aa16.39■□□□□ 0.21
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SMTNL2Q2TAL5 461 aa16.39■□□□□ 0.21
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MPZL3Q6UWV2 235 aa16.39■□□□□ 0.21
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MCEEQ96PE7 176 aa16.39■□□□□ 0.21
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PLCD4Q9BRC7 762 aa16.39■□□□□ 0.21
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CACNG4Q9UBN1 327 aa16.39■□□□□ 0.21
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 F8VP50 259 aa16.39■□□□□ 0.21
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PPEF2O14830 753 aa16.39■□□□□ 0.21
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TLR3O15455 904 aaKnown RBP16.39■□□□□ 0.21
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CYP2B6P20813 491 aa16.39■□□□□ 0.21
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP16.39■□□□□ 0.21
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP16.39■□□□□ 0.21
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DUOXA2Q1HG44 320 aa16.39■□□□□ 0.21
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GSTA5Q7RTV2 222 aa16.39■□□□□ 0.21
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP16.39■□□□□ 0.21
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FAM167AQ96KS9 214 aa16.39■□□□□ 0.21
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP16.39■□□□□ 0.21
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TMEM134Q9H6X4 195 aa16.39■□□□□ 0.21
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KIAA1586Q9HCI6 787 aa16.39■□□□□ 0.21
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SLC40A1Q9NP59 571 aa16.39■□□□□ 0.21
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HAUS2Q9NVX0 235 aa16.39■□□□□ 0.21
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ETAA1Q9NY74 926 aa16.39■□□□□ 0.21
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FLRT1Q9NZU1 646 aa16.39■□□□□ 0.21
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HBP1O60381 514 aa16.38■□□□□ 0.21
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LDHAP00338 332 aaKnown RBP16.38■□□□□ 0.21
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ASS1P00966 412 aaKnown RBP16.38■□□□□ 0.21
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HSPA6P17066 643 aa16.38■□□□□ 0.21
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ITGA8P53708 1063 aa16.38■□□□□ 0.21
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CLDN10P78369 228 aa16.38■□□□□ 0.21
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RAB6CQ53S08 254 aa16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.9 ms