RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487939.1

PTEN-204, Transcript of phosphatase and tensin homolog, humanhuman

TSL 3

Gene PTEN, Length 477 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTEN-204ENST00000487939 Q96MF0 132 aa5.55□□□□□ -1.52
PTEN-204ENST00000487939 PCGF6Q9BYE7 350 aa5.55□□□□□ -1.52
PTEN-204ENST00000487939 TOR3AQ9H497 397 aa5.55□□□□□ -1.52
PTEN-204ENST00000487939 SYBUQ9NX95 663 aa5.55□□□□□ -1.52
PTEN-204ENST00000487939 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
PTEN-204ENST00000487939 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP5.55□□□□□ -1.52
PTEN-204ENST00000487939 MAST3O60307 1309 aa5.54□□□□□ -1.52
PTEN-204ENST00000487939 A0A0B4J269 797 aa5.54□□□□□ -1.52
PTEN-204ENST00000487939 CFAP69A5D8W1 941 aa5.54□□□□□ -1.52
PTEN-204ENST00000487939 MYO1CO00159 1063 aa5.54□□□□□ -1.52
PTEN-204ENST00000487939 KIF3BO15066 747 aa5.54□□□□□ -1.52
PTEN-204ENST00000487939 DNAJB5O75953 348 aa5.54□□□□□ -1.52
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PTEN-204ENST00000487939 NDUFV1P49821 464 aa5.54□□□□□ -1.52
PTEN-204ENST00000487939 FAM193AP78312 1265 aa5.54□□□□□ -1.52
PTEN-204ENST00000487939 SATB1Q01826 763 aa5.54□□□□□ -1.52
PTEN-204ENST00000487939 TUBB3Q13509 450 aa5.54□□□□□ -1.52
PTEN-204ENST00000487939 LLGL1Q15334 1064 aa5.54□□□□□ -1.52
PTEN-204ENST00000487939 LONRF3Q496Y0 759 aa5.54□□□□□ -1.52
PTEN-204ENST00000487939 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
PTEN-204ENST00000487939 LAYNQ6UX15 382 aa5.54□□□□□ -1.52
PTEN-204ENST00000487939 CCDC149Q6ZUS6 474 aa5.54□□□□□ -1.52
PTEN-204ENST00000487939 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
PTEN-204ENST00000487939 BEND2Q8NDZ0 799 aa5.54□□□□□ -1.52
PTEN-204ENST00000487939 TTC17Q96AE7 1141 aa5.54□□□□□ -1.52
PTEN-204ENST00000487939 LRIG1Q96JA1 1093 aa5.54□□□□□ -1.52
PTEN-204ENST00000487939 NT5C1BQ96P26 610 aa5.54□□□□□ -1.52
PTEN-204ENST00000487939 AIFM2Q9BRQ8 373 aa5.54□□□□□ -1.52
PTEN-204ENST00000487939 MRIQ9BWK5 157 aa5.54□□□□□ -1.52
PTEN-204ENST00000487939 TRIM54Q9BYV2 358 aa5.54□□□□□ -1.52
PTEN-204ENST00000487939 KCTD5Q9NXV2 234 aa5.54□□□□□ -1.52
PTEN-204ENST00000487939 HESX1Q9UBX0 185 aa5.54□□□□□ -1.52
PTEN-204ENST00000487939 PACSIN3Q9UKS6 424 aa5.54□□□□□ -1.52
PTEN-204ENST00000487939 TPCN1Q9ULQ1 816 aa5.54□□□□□ -1.52
PTEN-204ENST00000487939 TMX2Q9Y320 296 aa5.54□□□□□ -1.52
PTEN-204ENST00000487939 COL4A3Q01955 1670 aa5.53□□□□□ -1.52
PTEN-204ENST00000487939 A0A087X1B8 175 aa5.53□□□□□ -1.52
PTEN-204ENST00000487939 F5H697 171 aa5.53□□□□□ -1.52
PTEN-204ENST00000487939 GOLIM4O00461 696 aa5.53□□□□□ -1.52
PTEN-204ENST00000487939 PEX1O43933 1283 aa5.53□□□□□ -1.52
PTEN-204ENST00000487939 MGEA5O60502 916 aa5.53□□□□□ -1.52
PTEN-204ENST00000487939 ESRRBO95718 433 aa5.53□□□□□ -1.52
PTEN-204ENST00000487939 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
PTEN-204ENST00000487939 KITP10721 976 aa5.53□□□□□ -1.52
PTEN-204ENST00000487939 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP5.53□□□□□ -1.52
PTEN-204ENST00000487939 NPR1P16066 1061 aa5.53□□□□□ -1.52
PTEN-204ENST00000487939 KRT4P19013 534 aa5.53□□□□□ -1.52
PTEN-204ENST00000487939 EN2P19622 333 aaPredicted RBP5.53□□□□□ -1.52
PTEN-204ENST00000487939 SLC7A1P30825 629 aa5.53□□□□□ -1.52
PTEN-204ENST00000487939 VIPR2P41587 438 aa5.53□□□□□ -1.52
PTEN-204ENST00000487939 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP5.53□□□□□ -1.52
PTEN-204ENST00000487939 ARFIP2P53365 341 aa5.53□□□□□ -1.52
PTEN-204ENST00000487939 SEC24CP53992 1094 aa5.53□□□□□ -1.52
PTEN-204ENST00000487939 PURAQ00577 322 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
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PTEN-204ENST00000487939 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa5.53□□□□□ -1.52
PTEN-204ENST00000487939 RNF220Q5VTB9 566 aa5.53□□□□□ -1.52
PTEN-204ENST00000487939 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP5.53□□□□□ -1.52
PTEN-204ENST00000487939 Q6ZNX1 250 aa5.53□□□□□ -1.52
PTEN-204ENST00000487939 DGKHQ86XP1 1220 aa5.53□□□□□ -1.52
PTEN-204ENST00000487939 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP5.53□□□□□ -1.52
PTEN-204ENST00000487939 SLC44A3Q8N4M1 653 aa5.53□□□□□ -1.52
PTEN-204ENST00000487939 IL31RAQ8NI17 732 aa5.53□□□□□ -1.52
PTEN-204ENST00000487939 LRTOMTQ8WZ04 291 aa5.53□□□□□ -1.52
PTEN-204ENST00000487939 OSBPL9Q96SU4 736 aa5.53□□□□□ -1.52
PTEN-204ENST00000487939 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
PTEN-204ENST00000487939 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa5.53□□□□□ -1.52
PTEN-204ENST00000487939 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa5.53□□□□□ -1.52
PTEN-204ENST00000487939 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
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PTEN-204ENST00000487939 A6NNZ2 444 aa5.52□□□□□ -1.53
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PTEN-204ENST00000487939 TPP1O14773 563 aa5.52□□□□□ -1.53
PTEN-204ENST00000487939 TBC1D4O60343 1298 aa5.52□□□□□ -1.53
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PTEN-204ENST00000487939 GATA3P23771 443 aa5.52□□□□□ -1.53
PTEN-204ENST00000487939 CD6P30203 668 aa5.52□□□□□ -1.53
PTEN-204ENST00000487939 HMGA2P52926 109 aa5.52□□□□□ -1.53
PTEN-204ENST00000487939 LOXL3P58215 753 aa5.52□□□□□ -1.53
PTEN-204ENST00000487939 ITIH3Q06033 890 aa5.52□□□□□ -1.53
PTEN-204ENST00000487939 FSTL1Q12841 308 aa5.52□□□□□ -1.53
PTEN-204ENST00000487939 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP5.52□□□□□ -1.53
PTEN-204ENST00000487939 IQCB1Q15051 598 aa5.52□□□□□ -1.53
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PTEN-204ENST00000487939 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
PTEN-204ENST00000487939 KIAA0753Q2KHM9 967 aa5.52□□□□□ -1.53
PTEN-204ENST00000487939 VWA1Q6PCB0 445 aa5.52□□□□□ -1.53
PTEN-204ENST00000487939 APOA5Q6Q788 366 aa5.52□□□□□ -1.53
PTEN-204ENST00000487939 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa5.52□□□□□ -1.53
PTEN-204ENST00000487939 FAM156AQ8NDB6 213 aa5.52□□□□□ -1.53
PTEN-204ENST00000487939 ANKS1AQ92625 1134 aa5.52□□□□□ -1.53
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PTEN-204ENST00000487939 PGBD1Q96JS3 809 aa5.52□□□□□ -1.53
PTEN-204ENST00000487939 SLC46A1Q96NT5 459 aa5.52□□□□□ -1.53
PTEN-204ENST00000487939 NELL2Q99435 816 aa5.52□□□□□ -1.53
PTEN-204ENST00000487939 C22orf23Q9BZE7 217 aa5.52□□□□□ -1.53
PTEN-204ENST00000487939 SMOC2Q9H3U7 446 aa5.52□□□□□ -1.53
PTEN-204ENST00000487939 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
PTEN-204ENST00000487939 XPR1Q9UBH6 696 aa5.52□□□□□ -1.53
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