RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485532.1

PRAME-212, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 709 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-212ENST00000485532 DENND4CQ5VZ89 1909 aa13.64□□□□□ -0.23
PRAME-212ENST00000485532 CEP250Q9BV73 2442 aa13.63□□□□□ -0.23
PRAME-212ENST00000485532 GOLGA8IPA6NC78 632 aa13.63□□□□□ -0.23
PRAME-212ENST00000485532 GOLGA8JA6NMD2 632 aa13.63□□□□□ -0.23
PRAME-212ENST00000485532 LILRB5O75023 590 aa13.63□□□□□ -0.23
PRAME-212ENST00000485532 CHRNB1P11230 501 aa13.63□□□□□ -0.23
PRAME-212ENST00000485532 TDGF1P13385 188 aa13.63□□□□□ -0.23
PRAME-212ENST00000485532 SLFN12LQ6IEE8 588 aa13.63□□□□□ -0.23
PRAME-212ENST00000485532 TXNDC11Q6PKC3 985 aa13.63□□□□□ -0.23
PRAME-212ENST00000485532 FAM200AQ8TCP9 573 aa13.63□□□□□ -0.23
PRAME-212ENST00000485532 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa13.63□□□□□ -0.23
PRAME-212ENST00000485532 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP13.63□□□□□ -0.23
PRAME-212ENST00000485532 GPR88Q9GZN0 384 aa13.63□□□□□ -0.23
PRAME-212ENST00000485532 IL21Q9HBE4 155 aa13.63□□□□□ -0.23
PRAME-212ENST00000485532 TMLHEQ9NVH6 421 aa13.63□□□□□ -0.23
PRAME-212ENST00000485532 CCDC39Q9UFE4 941 aa13.63□□□□□ -0.23
PRAME-212ENST00000485532 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP13.63□□□□□ -0.23
PRAME-212ENST00000485532 ASB3Q9Y575 518 aa13.63□□□□□ -0.23
PRAME-212ENST00000485532 OBSL1O75147 1896 aa13.63□□□□□ -0.23
PRAME-212ENST00000485532 CACNA1AO00555 2505 aa13.62□□□□□ -0.23
PRAME-212ENST00000485532 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP13.62□□□□□ -0.23
PRAME-212ENST00000485532 KPNA7A9QM74 516 aa13.62□□□□□ -0.23
PRAME-212ENST00000485532 CHADO15335 359 aa13.62□□□□□ -0.23
PRAME-212ENST00000485532 GCNT3O95395 438 aa13.62□□□□□ -0.23
PRAME-212ENST00000485532 IDEP14735 1019 aa13.62□□□□□ -0.23
PRAME-212ENST00000485532 GPR15P49685 360 aa13.62□□□□□ -0.23
PRAME-212ENST00000485532 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP13.62□□□□□ -0.23
PRAME-212ENST00000485532 SATB1Q01826 763 aa13.62□□□□□ -0.23
PRAME-212ENST00000485532 TNK2Q07912 1038 aa13.62□□□□□ -0.23
PRAME-212ENST00000485532 DMWDQ09019 674 aa13.62□□□□□ -0.23
PRAME-212ENST00000485532 FCHO2Q0JRZ9 810 aa13.62□□□□□ -0.23
PRAME-212ENST00000485532 LPAL2Q16609 132 aa13.62□□□□□ -0.23
PRAME-212ENST00000485532 CCDC142Q17RM4 750 aa13.62□□□□□ -0.23
PRAME-212ENST00000485532 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP13.62□□□□□ -0.23
PRAME-212ENST00000485532 Q6ZS52 159 aa13.62□□□□□ -0.23
PRAME-212ENST00000485532 SV2BQ7L1I2 683 aa13.62□□□□□ -0.23
PRAME-212ENST00000485532 METTL23Q86XA0 190 aa13.62□□□□□ -0.23
PRAME-212ENST00000485532 LINC00301Q8NCQ3 95 aa13.62□□□□□ -0.23
PRAME-212ENST00000485532 GLIS3Q8NEA6 775 aa13.62□□□□□ -0.23
PRAME-212ENST00000485532 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP13.62□□□□□ -0.23
PRAME-212ENST00000485532 ACCSQ96QU6 501 aa13.62□□□□□ -0.23
PRAME-212ENST00000485532 PCIF1Q9H4Z3 704 aa13.62□□□□□ -0.23
PRAME-212ENST00000485532 C2orf42Q9NWW7 574 aa13.62□□□□□ -0.23
PRAME-212ENST00000485532 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP13.62□□□□□ -0.23
PRAME-212ENST00000485532 GTSE1Q9NYZ3 720 aa13.62□□□□□ -0.23
PRAME-212ENST00000485532 NCDNQ9UBB6 729 aa13.62□□□□□ -0.23
PRAME-212ENST00000485532 RCOR1Q9UKL0 485 aa13.62□□□□□ -0.23
PRAME-212ENST00000485532 CFAP45Q9UL16 551 aa13.62□□□□□ -0.23
PRAME-212ENST00000485532 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP13.61□□□□□ -0.23
PRAME-212ENST00000485532 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa13.61□□□□□ -0.23
PRAME-212ENST00000485532 HCRTO43612 131 aa13.61□□□□□ -0.23
PRAME-212ENST00000485532 IL18RAPO95256 599 aa13.61□□□□□ -0.23
PRAME-212ENST00000485532 YEATS4O95619 227 aa13.61□□□□□ -0.23
PRAME-212ENST00000485532 ITGB3P05106 788 aa13.61□□□□□ -0.23
PRAME-212ENST00000485532 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP13.61□□□□□ -0.23
PRAME-212ENST00000485532 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP13.61□□□□□ -0.23
PRAME-212ENST00000485532 ABCD1P33897 745 aa13.61□□□□□ -0.23
PRAME-212ENST00000485532 TUFMP49411 452 aaKnown RBP13.61□□□□□ -0.23
PRAME-212ENST00000485532 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP13.61□□□□□ -0.23
PRAME-212ENST00000485532 SLC39A14Q15043 492 aa13.61□□□□□ -0.23
PRAME-212ENST00000485532 STK38Q15208 465 aa13.61□□□□□ -0.23
PRAME-212ENST00000485532 SDHAF4Q5VUM1 108 aa13.61□□□□□ -0.23
PRAME-212ENST00000485532 ERMP1Q7Z2K6 904 aa13.61□□□□□ -0.23
PRAME-212ENST00000485532 TMEM150AQ86TG1 271 aa13.61□□□□□ -0.23
PRAME-212ENST00000485532 ITIH5Q86UX2 942 aa13.61□□□□□ -0.23
PRAME-212ENST00000485532 THEM5Q8N1Q8 247 aa13.61□□□□□ -0.23
PRAME-212ENST00000485532 C1orf127Q8N9H9 656 aa13.61□□□□□ -0.23
PRAME-212ENST00000485532 HPS3Q969F9 1004 aa13.61□□□□□ -0.23
PRAME-212ENST00000485532 E2F7Q96AV8 911 aa13.61□□□□□ -0.23
PRAME-212ENST00000485532 HVCN1Q96D96 273 aa13.61□□□□□ -0.23
PRAME-212ENST00000485532 SPATA32Q96LK8 384 aa13.61□□□□□ -0.23
PRAME-212ENST00000485532 CBWD1Q9BRT8 395 aa13.61□□□□□ -0.23
PRAME-212ENST00000485532 PI4K2AQ9BTU6 479 aa13.61□□□□□ -0.23
PRAME-212ENST00000485532 SLC46A2Q9BY10 475 aa13.61□□□□□ -0.23
PRAME-212ENST00000485532 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP13.61□□□□□ -0.23
PRAME-212ENST00000485532 EPC1Q9H2F5 836 aa13.61□□□□□ -0.23
PRAME-212ENST00000485532 HSFX1Q9UBD0 423 aa13.61□□□□□ -0.23
PRAME-212ENST00000485532 DSEQ9UL01 958 aa13.61□□□□□ -0.23
PRAME-212ENST00000485532 AGAP1Q9UPQ3 857 aa13.61□□□□□ -0.23
PRAME-212ENST00000485532 DPYSL4O14531 572 aa13.6□□□□□ -0.23
PRAME-212ENST00000485532 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP13.6□□□□□ -0.23
PRAME-212ENST00000485532 GAP43P17677 238 aa13.6□□□□□ -0.23
PRAME-212ENST00000485532 PAX3P23760 479 aa13.6□□□□□ -0.23
PRAME-212ENST00000485532 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP13.6□□□□□ -0.23
PRAME-212ENST00000485532 CTHP32929 405 aa13.6□□□□□ -0.23
PRAME-212ENST00000485532 STAT6P42226 847 aa13.6□□□□□ -0.23
PRAME-212ENST00000485532 FOXK2Q01167 660 aa13.6□□□□□ -0.23
PRAME-212ENST00000485532 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP13.6□□□□□ -0.23
PRAME-212ENST00000485532 VEPH1Q14D04 833 aa13.6□□□□□ -0.23
PRAME-212ENST00000485532 POSTNQ15063 836 aa13.6□□□□□ -0.23
PRAME-212ENST00000485532 PON2Q15165 354 aa13.6□□□□□ -0.23
PRAME-212ENST00000485532 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP13.6□□□□□ -0.23
PRAME-212ENST00000485532 SV2CQ496J9 727 aa13.6□□□□□ -0.23
PRAME-212ENST00000485532 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa13.6□□□□□ -0.23
PRAME-212ENST00000485532 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP13.6□□□□□ -0.23
PRAME-212ENST00000485532 BRSK2Q8IWQ3 736 aa13.6□□□□□ -0.23
PRAME-212ENST00000485532 PDCL2Q8N4E4 241 aa13.6□□□□□ -0.23
PRAME-212ENST00000485532 PDILTQ8N807 584 aa13.6□□□□□ -0.23
PRAME-212ENST00000485532 TASP1Q9H6P5 420 aa13.6□□□□□ -0.23
PRAME-212ENST00000485532 PDE11AQ9HCR9 933 aa13.6□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.4 ms