RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483809.1

HBP1-211, Transcript of HMG-box transcription factor 1, human

TSL 2

Gene HBP1, Length 582 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HBP1-211	ENST00000483809	HDC	P19113	662 aa		4.82	□□□□□ -1.64
HBP1-211	ENST00000483809	EN2	P19622	333 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
HBP1-211	ENST00000483809	ZNF135	P52742	658 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
HBP1-211	ENST00000483809	PSMC1	P62191	440 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
HBP1-211	ENST00000483809	FAM193A	P78312	1265 aa		4.82	□□□□□ -1.64
HBP1-211	ENST00000483809	EXOSC9	Q06265	439 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
HBP1-211	ENST00000483809	HLX	Q14774	488 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
HBP1-211	ENST00000483809	CNN3	Q15417	329 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
HBP1-211	ENST00000483809	HSP90AB2P	Q58FF8	381 aa		4.82	□□□□□ -1.64
HBP1-211	ENST00000483809	TAPT1	Q6NXT6	567 aa		4.82	□□□□□ -1.64
HBP1-211	ENST00000483809	USP51	Q70EK9	711 aa		4.82	□□□□□ -1.64
HBP1-211	ENST00000483809	CLNK	Q7Z7G1	428 aa		4.82	□□□□□ -1.64
HBP1-211	ENST00000483809	COLGALT2	Q8IYK4	626 aa		4.82	□□□□□ -1.64
HBP1-211	ENST00000483809	LNX2	Q8N448	690 aa		4.82	□□□□□ -1.64
HBP1-211	ENST00000483809	IL31RA	Q8NI17	732 aa		4.82	□□□□□ -1.64
HBP1-211	ENST00000483809	TTC17	Q96AE7	1141 aa		4.82	□□□□□ -1.64
HBP1-211	ENST00000483809	COQ10A	Q96MF6	247 aa		4.82	□□□□□ -1.64
HBP1-211	ENST00000483809	SMO	Q99835	787 aa		4.82	□□□□□ -1.64
HBP1-211	ENST00000483809	SERHL2	Q9H4I8	314 aa		4.82	□□□□□ -1.64
HBP1-211	ENST00000483809	ARMT1	Q9H993	441 aa		4.82	□□□□□ -1.64
HBP1-211	ENST00000483809	UNKL	Q9H9P5	680 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
HBP1-211	ENST00000483809	SYBU	Q9NX95	663 aa		4.82	□□□□□ -1.64
HBP1-211	ENST00000483809	MAP3K2	Q9Y2U5	619 aa		4.82	□□□□□ -1.64
HBP1-211	ENST00000483809	REXO2	Q9Y3B8	237 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
HBP1-211	ENST00000483809	PLEKHM1	Q9Y4G2	1056 aa		4.82	□□□□□ -1.64
HBP1-211	ENST00000483809	LAS1L	Q9Y4W2	734 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
HBP1-211	ENST00000483809	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		4.82	□□□□□ -1.64
HBP1-211	ENST00000483809	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		4.82	□□□□□ -1.64
HBP1-211	ENST00000483809	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		4.82	□□□□□ -1.64
HBP1-211	ENST00000483809	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		4.81	□□□□□ -1.64
HBP1-211	ENST00000483809	FRMPD2	Q68DX3	1309 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
HBP1-211	ENST00000483809	COL4A3	Q01955	1670 aa		4.81	□□□□□ -1.64
HBP1-211	ENST00000483809		A0A1W2PPL8	197 aa		4.81	□□□□□ -1.64
HBP1-211	ENST00000483809	GRID2IP	A4D2P6	1211 aa		4.81	□□□□□ -1.64
HBP1-211	ENST00000483809	ISM1	B1AKI9	464 aa		4.81	□□□□□ -1.64
HBP1-211	ENST00000483809	MARCH6	O60337	910 aa		4.81	□□□□□ -1.64
HBP1-211	ENST00000483809	RHCE	P18577	417 aa		4.81	□□□□□ -1.64
HBP1-211	ENST00000483809	TOB1	P50616	345 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
HBP1-211	ENST00000483809	RPS7	P62081	194 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
HBP1-211	ENST00000483809	RHD	Q02161	417 aa		4.81	□□□□□ -1.64
HBP1-211	ENST00000483809	TP53BP2	Q13625	1128 aa		4.81	□□□□□ -1.64
HBP1-211	ENST00000483809	DYRK1A	Q13627	763 aa		4.81	□□□□□ -1.64
HBP1-211	ENST00000483809	PTPA	Q15257	358 aa		4.81	□□□□□ -1.64
HBP1-211	ENST00000483809	FAM160B1	Q5W0V3	765 aa		4.81	□□□□□ -1.64
HBP1-211	ENST00000483809	ASB10	Q8WXI3	467 aa		4.81	□□□□□ -1.64
HBP1-211	ENST00000483809	LINC00476	Q8WZB0	136 aa		4.81	□□□□□ -1.64
HBP1-211	ENST00000483809	LARP4B	Q92615	738 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
HBP1-211	ENST00000483809	NT5C1B	Q96P26	610 aa		4.81	□□□□□ -1.64
HBP1-211	ENST00000483809	TRIB1	Q96RU8	372 aa		4.81	□□□□□ -1.64
HBP1-211	ENST00000483809	PRKRIP1	Q9H875	184 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
HBP1-211	ENST00000483809	SLAMF7	Q9NQ25	335 aa		4.81	□□□□□ -1.64
HBP1-211	ENST00000483809	PCDHA6	Q9UN73	950 aa		4.81	□□□□□ -1.64
HBP1-211	ENST00000483809	MTO1	Q9Y2Z2	717 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
HBP1-211	ENST00000483809	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		4.81	□□□□□ -1.64
HBP1-211	ENST00000483809	NAIP	Q13075	1403 aa		4.8	□□□□□ -1.64
HBP1-211	ENST00000483809	KIF14	Q15058	1648 aa		4.8	□□□□□ -1.64
HBP1-211	ENST00000483809	GOLIM4	O00461	696 aa		4.8	□□□□□ -1.64
HBP1-211	ENST00000483809	PROM1	O43490	865 aa		4.8	□□□□□ -1.64
HBP1-211	ENST00000483809	AKAP8	O43823	692 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
HBP1-211	ENST00000483809	SRGN	P10124	158 aa		4.8	□□□□□ -1.64
HBP1-211	ENST00000483809	MYB	P10242	640 aa		4.8	□□□□□ -1.64
HBP1-211	ENST00000483809	VIPR2	P41587	438 aa		4.8	□□□□□ -1.64
HBP1-211	ENST00000483809	GDF5	P43026	501 aa		4.8	□□□□□ -1.64
HBP1-211	ENST00000483809	SEMA5A	Q13591	1074 aa		4.8	□□□□□ -1.64
HBP1-211	ENST00000483809	POLD3	Q15054	466 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
HBP1-211	ENST00000483809	GEN1	Q17RS7	908 aa		4.8	□□□□□ -1.64
HBP1-211	ENST00000483809	CCDC181	Q5TID7	509 aa		4.8	□□□□□ -1.64
HBP1-211	ENST00000483809	APOA5	Q6Q788	366 aa		4.8	□□□□□ -1.64
HBP1-211	ENST00000483809	MICALCL	Q6ZW33	695 aa		4.8	□□□□□ -1.64
HBP1-211	ENST00000483809	GPR149	Q86SP6	731 aa		4.8	□□□□□ -1.64
HBP1-211	ENST00000483809	FAM109A	Q8N4B1	249 aa		4.8	□□□□□ -1.64
HBP1-211	ENST00000483809	CELF5	Q8N6W0	485 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
HBP1-211	ENST00000483809	FAM156A	Q8NDB6	213 aa		4.8	□□□□□ -1.64
HBP1-211	ENST00000483809	RNF31	Q96EP0	1072 aa		4.8	□□□□□ -1.64
HBP1-211	ENST00000483809	SUCLG2	Q96I99	432 aa		4.8	□□□□□ -1.64
HBP1-211	ENST00000483809	OSBPL9	Q96SU4	736 aa		4.8	□□□□□ -1.64
HBP1-211	ENST00000483809	HEPH	Q9BQS7	1158 aa		4.8	□□□□□ -1.64
HBP1-211	ENST00000483809	SPATA5L1	Q9BVQ7	753 aa		4.8	□□□□□ -1.64
HBP1-211	ENST00000483809	PCED1A	Q9H1Q7	454 aa		4.8	□□□□□ -1.64
HBP1-211	ENST00000483809	HESX1	Q9UBX0	185 aa		4.8	□□□□□ -1.64
HBP1-211	ENST00000483809	STAP2	Q9UGK3	403 aa		4.8	□□□□□ -1.64
HBP1-211	ENST00000483809	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		4.8	□□□□□ -1.64
HBP1-211	ENST00000483809	MAST3	O60307	1309 aa		4.79	□□□□□ -1.64
HBP1-211	ENST00000483809	HMGXB3	Q12766	1538 aa		4.79	□□□□□ -1.64
HBP1-211	ENST00000483809		A0A087WWL8	130 aa		4.79	□□□□□ -1.64
HBP1-211	ENST00000483809	TMEM191C	A6NGB0	347 aa		4.79	□□□□□ -1.64
HBP1-211	ENST00000483809	UNC119B	A6NIH7	251 aa		4.79	□□□□□ -1.64
HBP1-211	ENST00000483809	POLRMT	O00411	1230 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
HBP1-211	ENST00000483809	RRP9	O43818	475 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
HBP1-211	ENST00000483809	HSPA5	P11021	654 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
HBP1-211	ENST00000483809	RPL17	P18621	184 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
HBP1-211	ENST00000483809	KRT4	P19013	534 aa		4.79	□□□□□ -1.64
HBP1-211	ENST00000483809	PHKA1	P46020	1223 aa		4.79	□□□□□ -1.64
HBP1-211	ENST00000483809	WNT3	P56703	355 aa		4.79	□□□□□ -1.64
HBP1-211	ENST00000483809	RNF220	Q5VTB9	566 aa		4.79	□□□□□ -1.64
HBP1-211	ENST00000483809	DARS2	Q6PI48	645 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
HBP1-211	ENST00000483809	RAB11FIP1	Q6WKZ4	1283 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
HBP1-211	ENST00000483809		Q6YL49	198 aa		4.79	□□□□□ -1.64
HBP1-211	ENST00000483809	ZNF627	Q7L945	461 aa		4.79	□□□□□ -1.64
HBP1-211	ENST00000483809	COL23A1	Q86Y22	540 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64

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