RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482015.5

UPP1-211, Transcript of uridine phosphorylase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene UPP1, Length 861 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1-211ENST00000482015 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
UPP1-211ENST00000482015 GIPC2Q8TF65 315 aa20.21■□□□□ 0.83
UPP1-211ENST00000482015 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
UPP1-211ENST00000482015 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
UPP1-211ENST00000482015 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
UPP1-211ENST00000482015 KIAA1586Q9HCI6 787 aa20.21■□□□□ 0.83
UPP1-211ENST00000482015 HEBP1Q9NRV9 189 aa20.21■□□□□ 0.83
UPP1-211ENST00000482015 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
UPP1-211ENST00000482015 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
UPP1-211ENST00000482015 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
UPP1-211ENST00000482015 SLFN14P0C7P3 912 aa20.2■□□□□ 0.82
UPP1-211ENST00000482015 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
UPP1-211ENST00000482015 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
UPP1-211ENST00000482015 GABRR2P28476 465 aa20.2■□□□□ 0.82
UPP1-211ENST00000482015 SMARCB1Q12824 385 aa20.2■□□□□ 0.82
UPP1-211ENST00000482015 SURF1Q15526 300 aa20.2■□□□□ 0.82
UPP1-211ENST00000482015 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
UPP1-211ENST00000482015 ITIH5Q86UX2 942 aa20.2■□□□□ 0.82
UPP1-211ENST00000482015 OSTM1Q86WC4 334 aa20.2■□□□□ 0.82
UPP1-211ENST00000482015 SPPL2BQ8TCT7 592 aa20.2■□□□□ 0.82
UPP1-211ENST00000482015 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
UPP1-211ENST00000482015 PAGE5Q96GU1 130 aa20.2■□□□□ 0.82
UPP1-211ENST00000482015 SPATA32Q96LK8 384 aa20.2■□□□□ 0.82
UPP1-211ENST00000482015 GPR88Q9GZN0 384 aa20.2■□□□□ 0.82
UPP1-211ENST00000482015 ATXN3LQ9H3M9 355 aa20.2■□□□□ 0.82
UPP1-211ENST00000482015 BRD9Q9H8M2 597 aa20.2■□□□□ 0.82
UPP1-211ENST00000482015 GDAP2Q9NXN4 497 aa20.2■□□□□ 0.82
UPP1-211ENST00000482015 PIEZO1Q92508 2521 aa20.2■□□□□ 0.82
UPP1-211ENST00000482015 NCANO14594 1321 aa20.2■□□□□ 0.82
UPP1-211ENST00000482015 UBE4BO95155 1302 aa20.2■□□□□ 0.82
UPP1-211ENST00000482015 HCRTO43612 131 aa20.19■□□□□ 0.82
UPP1-211ENST00000482015 TNNC2P02585 160 aa20.19■□□□□ 0.82
UPP1-211ENST00000482015 PFKFB1P16118 471 aa20.19■□□□□ 0.82
UPP1-211ENST00000482015 PSMC3P17980 439 aa20.19■□□□□ 0.82
UPP1-211ENST00000482015 GDI1P31150 447 aa20.19■□□□□ 0.82
UPP1-211ENST00000482015 TSPY1Q01534 308 aa20.19■□□□□ 0.82
UPP1-211ENST00000482015 UBXN2BQ14CS0 331 aa20.19■□□□□ 0.82
UPP1-211ENST00000482015 DUOXA2Q1HG44 320 aa20.19■□□□□ 0.82
UPP1-211ENST00000482015 TPRG1Q6ZUI0 275 aa20.19■□□□□ 0.82
UPP1-211ENST00000482015 RSPRY1Q96DX4 576 aa20.19■□□□□ 0.82
UPP1-211ENST00000482015 ACBD6Q9BR61 282 aa20.19■□□□□ 0.82
UPP1-211ENST00000482015 PI4K2AQ9BTU6 479 aa20.19■□□□□ 0.82
UPP1-211ENST00000482015 TRPV4Q9HBA0 871 aa20.19■□□□□ 0.82
UPP1-211ENST00000482015 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
UPP1-211ENST00000482015 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa20.19■□□□□ 0.82
UPP1-211ENST00000482015 CACNA1HO95180 2353 aa20.19■□□□□ 0.82
UPP1-211ENST00000482015 FAM170BA6NMN3 283 aa20.18■□□□□ 0.82
UPP1-211ENST00000482015 HEPACAM2A8MVW5 462 aa20.18■□□□□ 0.82
UPP1-211ENST00000482015 KLRC4O43908 158 aa20.18■□□□□ 0.82
UPP1-211ENST00000482015 DLATP10515 647 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
UPP1-211ENST00000482015 CMA1P23946 247 aa20.18■□□□□ 0.82
UPP1-211ENST00000482015 NBL1P41271 181 aa20.18■□□□□ 0.82
UPP1-211ENST00000482015 GPR15P49685 360 aa20.18■□□□□ 0.82
UPP1-211ENST00000482015 KRT85P78386 507 aa20.18■□□□□ 0.82
UPP1-211ENST00000482015 MYO1EQ12965 1108 aa20.18■□□□□ 0.82
UPP1-211ENST00000482015 VEPH1Q14D04 833 aa20.18■□□□□ 0.82
UPP1-211ENST00000482015 CCDC142Q17RM4 750 aa20.18■□□□□ 0.82
UPP1-211ENST00000482015 BMT2Q1RMZ1 405 aa20.18■□□□□ 0.82
UPP1-211ENST00000482015 SOWAHAQ2M3V2 549 aa20.18■□□□□ 0.82
UPP1-211ENST00000482015 HS2ST1Q7LGA3 356 aa20.18■□□□□ 0.82
UPP1-211ENST00000482015 FRMD5Q7Z6J6 570 aa20.18■□□□□ 0.82
UPP1-211ENST00000482015 WDR49Q8IV35 697 aa20.18■□□□□ 0.82
UPP1-211ENST00000482015 TMEM86AQ8N2M4 240 aa20.18■□□□□ 0.82
UPP1-211ENST00000482015 TOP6BLQ8N6T0 577 aa20.18■□□□□ 0.82
UPP1-211ENST00000482015 XXYLT1Q8NBI6 393 aa20.18■□□□□ 0.82
UPP1-211ENST00000482015 CCDC127Q96BQ5 260 aa20.18■□□□□ 0.82
UPP1-211ENST00000482015 HPDLQ96IR7 371 aa20.18■□□□□ 0.82
UPP1-211ENST00000482015 MKNK1Q9BUB5 465 aa20.18■□□□□ 0.82
UPP1-211ENST00000482015 LTB4R2Q9NPC1 389 aa20.18■□□□□ 0.82
UPP1-211ENST00000482015 PROB1E7EW31 1015 aa20.17■□□□□ 0.82
UPP1-211ENST00000482015 GFRA3O60609 400 aa20.17■□□□□ 0.82
UPP1-211ENST00000482015 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
UPP1-211ENST00000482015 TNNI1P19237 187 aa20.17■□□□□ 0.82
UPP1-211ENST00000482015 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
UPP1-211ENST00000482015 CYP4F8P98187 520 aa20.17■□□□□ 0.82
UPP1-211ENST00000482015 MYL7Q01449 175 aa20.17■□□□□ 0.82
UPP1-211ENST00000482015 CYP24A1Q07973 514 aa20.17■□□□□ 0.82
UPP1-211ENST00000482015 STK4Q13043 487 aa20.17■□□□□ 0.82
UPP1-211ENST00000482015 TAF12Q16514 161 aa20.17■□□□□ 0.82
UPP1-211ENST00000482015 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
UPP1-211ENST00000482015 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
UPP1-211ENST00000482015 GPR158Q5T848 1215 aa20.17■□□□□ 0.82
UPP1-211ENST00000482015 SDHAF4Q5VUM1 108 aa20.17■□□□□ 0.82
UPP1-211ENST00000482015 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa20.17■□□□□ 0.82
UPP1-211ENST00000482015 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
UPP1-211ENST00000482015 MFSD6LQ8IWD5 586 aa20.17■□□□□ 0.82
UPP1-211ENST00000482015 ADGRF2Q8IZF7 708 aa20.17■□□□□ 0.82
UPP1-211ENST00000482015 STKLD1Q8NE28 680 aa20.17■□□□□ 0.82
UPP1-211ENST00000482015 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa20.17■□□□□ 0.82
UPP1-211ENST00000482015 DNASE1L2Q92874 299 aa20.17■□□□□ 0.82
UPP1-211ENST00000482015 IRF7Q92985 503 aa20.17■□□□□ 0.82
UPP1-211ENST00000482015 FNBP1Q96RU3 617 aa20.17■□□□□ 0.82
UPP1-211ENST00000482015 IL21Q9HBE4 155 aa20.17■□□□□ 0.82
UPP1-211ENST00000482015 GTF3C4Q9UKN8 822 aa20.17■□□□□ 0.82
UPP1-211ENST00000482015 HPSEQ9Y251 543 aa20.17■□□□□ 0.82
UPP1-211ENST00000482015 SHISA7A6NL88 538 aa20.16■□□□□ 0.82
UPP1-211ENST00000482015 GABRDO14764 452 aa20.16■□□□□ 0.82
UPP1-211ENST00000482015 FGF19O95750 216 aa20.16■□□□□ 0.82
UPP1-211ENST00000482015 CST3P01034 146 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
UPP1-211ENST00000482015 LHX1P48742 406 aa20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.4 ms