RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480301.1

ACTB-211, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 657 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-211ENST00000480301 CCNE1P24864 410 aa22.46■■□□□ 1.19
ACTB-211ENST00000480301 TSPY1Q01534 308 aa22.46■■□□□ 1.19
ACTB-211ENST00000480301 LRRC63Q05C16 580 aa22.46■■□□□ 1.19
ACTB-211ENST00000480301 STIM1Q13586 685 aa22.46■■□□□ 1.19
ACTB-211ENST00000480301 NCOA4Q13772 614 aa22.46■■□□□ 1.19
ACTB-211ENST00000480301 WDR72Q3MJ13 1102 aa22.46■■□□□ 1.19
ACTB-211ENST00000480301 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
ACTB-211ENST00000480301 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
ACTB-211ENST00000480301 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
ACTB-211ENST00000480301 MMS19Q96T76 1030 aa22.46■■□□□ 1.19
ACTB-211ENST00000480301 KIAA1468Q9P260 1216 aa22.46■■□□□ 1.19
ACTB-211ENST00000480301 NOTCH4Q99466 2003 aa22.45■■□□□ 1.18
ACTB-211ENST00000480301 PSMA7O14818 248 aa22.45■■□□□ 1.18
ACTB-211ENST00000480301 TACC1O75410 805 aa22.45■■□□□ 1.18
ACTB-211ENST00000480301 SOAT2O75908 522 aa22.45■■□□□ 1.18
ACTB-211ENST00000480301 ASGR2P07307 311 aa22.45■■□□□ 1.18
ACTB-211ENST00000480301 TRIM49P0CI25 452 aa22.45■■□□□ 1.18
ACTB-211ENST00000480301 TRIM49CP0CI26 452 aa22.45■■□□□ 1.18
ACTB-211ENST00000480301 LMO2P25791 158 aa22.45■■□□□ 1.18
ACTB-211ENST00000480301 PPP1R2P41236 205 aa22.45■■□□□ 1.18
ACTB-211ENST00000480301 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
ACTB-211ENST00000480301 PPP3CAQ08209 521 aa22.45■■□□□ 1.18
ACTB-211ENST00000480301 PTPN21Q16825 1174 aa22.45■■□□□ 1.18
ACTB-211ENST00000480301 SLC5A9Q2M3M2 681 aa22.45■■□□□ 1.18
ACTB-211ENST00000480301 SPPL2BQ8TCT7 592 aa22.45■■□□□ 1.18
ACTB-211ENST00000480301 ELMO3Q96BJ8 720 aa22.45■■□□□ 1.18
ACTB-211ENST00000480301 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
ACTB-211ENST00000480301 CORO1BQ9BR76 489 aa22.45■■□□□ 1.18
ACTB-211ENST00000480301 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
ACTB-211ENST00000480301 DNAJC25Q9H1X3 360 aa22.45■■□□□ 1.18
ACTB-211ENST00000480301 LAMP2P13473 410 aa22.44■■□□□ 1.18
ACTB-211ENST00000480301 PCSK1P29120 753 aa22.44■■□□□ 1.18
ACTB-211ENST00000480301 GCLMP48507 274 aa22.44■■□□□ 1.18
ACTB-211ENST00000480301 TNNC1P63316 161 aa22.44■■□□□ 1.18
ACTB-211ENST00000480301 ZXDAP98168 799 aa22.44■■□□□ 1.18
ACTB-211ENST00000480301 PLD1Q13393 1074 aa22.44■■□□□ 1.18
ACTB-211ENST00000480301 ZNF699Q32M78 642 aa22.44■■□□□ 1.18
ACTB-211ENST00000480301 ELMOD1Q8N336 334 aa22.44■■□□□ 1.18
ACTB-211ENST00000480301 DOCK8Q8NF50 2099 aa22.44■■□□□ 1.18
ACTB-211ENST00000480301 CLSTN2Q9H4D0 955 aa22.44■■□□□ 1.18
ACTB-211ENST00000480301 C11orf16Q9NQ32 467 aa22.44■■□□□ 1.18
ACTB-211ENST00000480301 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
ACTB-211ENST00000480301 CDH7Q9ULB5 785 aa22.44■■□□□ 1.18
ACTB-211ENST00000480301 NME7Q9Y5B8 376 aa22.44■■□□□ 1.18
ACTB-211ENST00000480301 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa22.44■■□□□ 1.18
ACTB-211ENST00000480301 MYO10Q9HD67 2058 aa22.43■■□□□ 1.18
ACTB-211ENST00000480301 MYBPHLA2RUH7 354 aa22.43■■□□□ 1.18
ACTB-211ENST00000480301 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
ACTB-211ENST00000480301 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
ACTB-211ENST00000480301 EPB41P11171 864 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
ACTB-211ENST00000480301 ALDH1A3P47895 512 aa22.43■■□□□ 1.18
ACTB-211ENST00000480301 TUFMP49411 452 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
ACTB-211ENST00000480301 EPHB3P54753 998 aa22.43■■□□□ 1.18
ACTB-211ENST00000480301 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
ACTB-211ENST00000480301 CCDC142Q17RM4 750 aa22.43■■□□□ 1.18
ACTB-211ENST00000480301 PRSS36Q5K4E3 855 aa22.43■■□□□ 1.18
ACTB-211ENST00000480301 IQCEQ6IPM2 695 aa22.43■■□□□ 1.18
ACTB-211ENST00000480301 FAM171BQ6P995 826 aa22.43■■□□□ 1.18
ACTB-211ENST00000480301 HS6ST3Q8IZP7 471 aa22.43■■□□□ 1.18
ACTB-211ENST00000480301 TRIML1Q8N9V2 468 aa22.43■■□□□ 1.18
ACTB-211ENST00000480301 EDAQ92838 391 aa22.43■■□□□ 1.18
ACTB-211ENST00000480301 FGF13Q92913 245 aa22.43■■□□□ 1.18
ACTB-211ENST00000480301 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
ACTB-211ENST00000480301 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
ACTB-211ENST00000480301 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa22.43■■□□□ 1.18
ACTB-211ENST00000480301 LRRC3Q9BY71 257 aa22.43■■□□□ 1.18
ACTB-211ENST00000480301 KCNK12Q9HB15 430 aa22.43■■□□□ 1.18
ACTB-211ENST00000480301 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
ACTB-211ENST00000480301 GTF3C4Q9UKN8 822 aa22.43■■□□□ 1.18
ACTB-211ENST00000480301 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
ACTB-211ENST00000480301 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
ACTB-211ENST00000480301 ATP2C2O75185 946 aa22.42■■□□□ 1.18
ACTB-211ENST00000480301 HLA-DRAP01903 254 aa22.42■■□□□ 1.18
ACTB-211ENST00000480301 PDGFRBP09619 1106 aa22.42■■□□□ 1.18
ACTB-211ENST00000480301 GTF2H1P32780 548 aa22.42■■□□□ 1.18
ACTB-211ENST00000480301 CCR2P41597 374 aa22.42■■□□□ 1.18
ACTB-211ENST00000480301 EPHA5P54756 1037 aa22.42■■□□□ 1.18
ACTB-211ENST00000480301 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa22.42■■□□□ 1.18
ACTB-211ENST00000480301 MGAT5BQ3V5L5 792 aa22.42■■□□□ 1.18
ACTB-211ENST00000480301 ZNF667Q5HYK9 610 aa22.42■■□□□ 1.18
ACTB-211ENST00000480301 KLHL10Q6JEL2 608 aa22.42■■□□□ 1.18
ACTB-211ENST00000480301 TTI2Q6NXR4 508 aa22.42■■□□□ 1.18
ACTB-211ENST00000480301 POTEHQ6S545 545 aa22.42■■□□□ 1.18
ACTB-211ENST00000480301 TAS1R2Q8TE23 839 aa22.42■■□□□ 1.18
ACTB-211ENST00000480301 NELFBQ8WX92 580 aa22.42■■□□□ 1.18
ACTB-211ENST00000480301 TAF4BQ92750 862 aa22.42■■□□□ 1.18
ACTB-211ENST00000480301 TCEAL4Q96EI5 215 aa22.42■■□□□ 1.18
ACTB-211ENST00000480301 GBP4Q96PP9 640 aa22.42■■□□□ 1.18
ACTB-211ENST00000480301 SYT15Q9BQS2 421 aa22.42■■□□□ 1.18
ACTB-211ENST00000480301 CDH9Q9ULB4 789 aa22.42■■□□□ 1.18
ACTB-211ENST00000480301 SORCS3Q9UPU3 1222 aa22.42■■□□□ 1.18
ACTB-211ENST00000480301 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
ACTB-211ENST00000480301 GPR37L1O60883 481 aa22.41■■□□□ 1.18
ACTB-211ENST00000480301 MOSPD3O75425 235 aa22.41■■□□□ 1.18
ACTB-211ENST00000480301 ASS1P00966 412 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
ACTB-211ENST00000480301 ATF6P18850 670 aa22.41■■□□□ 1.18
ACTB-211ENST00000480301 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
ACTB-211ENST00000480301 CYP4A22Q5TCH4 519 aa22.41■■□□□ 1.18
ACTB-211ENST00000480301 FOXR2Q6PJQ5 311 aa22.41■■□□□ 1.18
ACTB-211ENST00000480301 TMC8Q8IU68 726 aa22.41■■□□□ 1.18
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