RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478279.5

APTX-222, Transcript of aprataxin, human

TSL 1 (best)

Gene APTX, Length 684 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
APTX-222	ENST00000478279	DGKE	P52429	567 aa		11.5	□□□□□ -0.57
APTX-222	ENST00000478279	SPAG1	Q07617	926 aa		11.5	□□□□□ -0.57
APTX-222	ENST00000478279	NOLC1	Q14978	699 aa	Known RBP eCLIP	11.5	□□□□□ -0.57
APTX-222	ENST00000478279	ZBTB6	Q15916	424 aa		11.5	□□□□□ -0.57
APTX-222	ENST00000478279	UAP1L1	Q3KQV9	507 aa		11.5	□□□□□ -0.57
APTX-222	ENST00000478279	DEFB124	Q8NES8	71 aa		11.5	□□□□□ -0.57
APTX-222	ENST00000478279	ACD	Q96AP0	544 aa		11.5	□□□□□ -0.57
APTX-222	ENST00000478279	KIF12	Q96FN5	646 aa		11.5	□□□□□ -0.57
APTX-222	ENST00000478279	LPIN3	Q9BQK8	851 aa		11.5	□□□□□ -0.57
APTX-222	ENST00000478279	C17orf75	Q9HAS0	396 aa		11.5	□□□□□ -0.57
APTX-222	ENST00000478279	TBX20	Q9UMR3	447 aa		11.5	□□□□□ -0.57
APTX-222	ENST00000478279	UBQLN1	Q9UMX0	589 aa	Known RBP	11.5	□□□□□ -0.57
APTX-222	ENST00000478279	CCL26	Q9Y258	94 aa		11.5	□□□□□ -0.57
APTX-222	ENST00000478279	MSRB2	Q9Y3D2	182 aa		11.5	□□□□□ -0.57
APTX-222	ENST00000478279	DENND4C	Q5VZ89	1909 aa		11.5	□□□□□ -0.57
APTX-222	ENST00000478279	HELZ2	Q9BYK8	2649 aa	Known RBP	11.49	□□□□□ -0.57
APTX-222	ENST00000478279	TTC26	A0AVF1	554 aa		11.49	□□□□□ -0.57
APTX-222	ENST00000478279	PATE3	B3GLJ2	98 aa		11.49	□□□□□ -0.57
APTX-222	ENST00000478279	CLDN3	O15551	220 aa		11.49	□□□□□ -0.57
APTX-222	ENST00000478279	HYAL3	O43820	417 aa	Predicted RBP	11.49	□□□□□ -0.57
APTX-222	ENST00000478279	HIP1R	O75146	1068 aa		11.49	□□□□□ -0.57
APTX-222	ENST00000478279	CLTA	P09496	248 aa		11.49	□□□□□ -0.57
APTX-222	ENST00000478279	CXCL8	P10145	99 aa		11.49	□□□□□ -0.57
APTX-222	ENST00000478279	ARSA	P15289	507 aa		11.49	□□□□□ -0.57
APTX-222	ENST00000478279	ATF6	P18850	670 aa		11.49	□□□□□ -0.57
APTX-222	ENST00000478279	DDX6	P26196	483 aa	Known RBP eCLIP	11.49	□□□□□ -0.57
APTX-222	ENST00000478279	IRX4	P78413	519 aa		11.49	□□□□□ -0.57
APTX-222	ENST00000478279	BFSP1	Q12934	665 aa		11.49	□□□□□ -0.57
APTX-222	ENST00000478279	ORC2	Q13416	577 aa	Predicted RBP	11.49	□□□□□ -0.57
APTX-222	ENST00000478279	TRIM29	Q14134	588 aa		11.49	□□□□□ -0.57
APTX-222	ENST00000478279	PDGFRL	Q15198	375 aa		11.49	□□□□□ -0.57
APTX-222	ENST00000478279	TAF12	Q16514	161 aa		11.49	□□□□□ -0.57
APTX-222	ENST00000478279	MGAT5B	Q3V5L5	792 aa		11.49	□□□□□ -0.57
APTX-222	ENST00000478279	USP39	Q53GS9	565 aa	Known RBP	11.49	□□□□□ -0.57
APTX-222	ENST00000478279	KIAA1211L	Q6NV74	962 aa		11.49	□□□□□ -0.57
APTX-222	ENST00000478279	CYP2U1	Q7Z449	544 aa		11.49	□□□□□ -0.57
APTX-222	ENST00000478279	EZH1	Q92800	747 aa	Predicted RBP	11.49	□□□□□ -0.57
APTX-222	ENST00000478279	USP13	Q92995	863 aa	Predicted RBP	11.49	□□□□□ -0.57
APTX-222	ENST00000478279	SENP8	Q96LD8	212 aa		11.49	□□□□□ -0.57
APTX-222	ENST00000478279	DRC1	Q96MC2	740 aa		11.49	□□□□□ -0.57
APTX-222	ENST00000478279	SEPT5	Q99719	369 aa	Predicted RBP	11.49	□□□□□ -0.57
APTX-222	ENST00000478279	NTPCR	Q9BSD7	190 aa	Known RBP	11.49	□□□□□ -0.57
APTX-222	ENST00000478279	SLC32A1	Q9H598	525 aa		11.49	□□□□□ -0.57
APTX-222	ENST00000478279	KIF9	Q9HAQ2	790 aa		11.49	□□□□□ -0.57
APTX-222	ENST00000478279	DDX19A	Q9NUU7	478 aa	Known RBP	11.49	□□□□□ -0.57
APTX-222	ENST00000478279	TDP1	Q9NUW8	608 aa		11.49	□□□□□ -0.57
APTX-222	ENST00000478279	ANKFY1	Q9P2R3	1169 aa		11.49	□□□□□ -0.57
APTX-222	ENST00000478279	INVS	Q9Y283	1065 aa		11.49	□□□□□ -0.57
APTX-222	ENST00000478279	SLC16A4	O15374	487 aa		11.48	□□□□□ -0.57
APTX-222	ENST00000478279	XPOT	O43592	962 aa	Known RBP	11.48	□□□□□ -0.57
APTX-222	ENST00000478279	F11	P03951	625 aa		11.48	□□□□□ -0.57
APTX-222	ENST00000478279	ODC1	P11926	461 aa		11.48	□□□□□ -0.57
APTX-222	ENST00000478279	PAX3	P23760	479 aa		11.48	□□□□□ -0.57
APTX-222	ENST00000478279	U2AF2	P26368	475 aa	Known RBP eCLIP	11.48	□□□□□ -0.57	9e-15	■■■■■ 42.9
APTX-222	ENST00000478279	GUCY2F	P51841	1108 aa		11.48	□□□□□ -0.57
APTX-222	ENST00000478279	LILRA4	P59901	499 aa		11.48	□□□□□ -0.57
APTX-222	ENST00000478279	MCL1	Q07820	350 aa		11.48	□□□□□ -0.57
APTX-222	ENST00000478279	STRN3	Q13033	797 aa		11.48	□□□□□ -0.57
APTX-222	ENST00000478279	ZNF174	Q15697	407 aa		11.48	□□□□□ -0.57
APTX-222	ENST00000478279	SLC39A12	Q504Y0	691 aa		11.48	□□□□□ -0.57
APTX-222	ENST00000478279	NAIF1	Q69YI7	327 aa	Predicted RBP	11.48	□□□□□ -0.57
APTX-222	ENST00000478279	CC2D1A	Q6P1N0	951 aa	Predicted RBP	11.48	□□□□□ -0.57
APTX-222	ENST00000478279	ZPBP2	Q6X784	338 aa		11.48	□□□□□ -0.57
APTX-222	ENST00000478279	TMEM150A	Q86TG1	271 aa		11.48	□□□□□ -0.57
APTX-222	ENST00000478279	MAB21L3	Q8N8X9	362 aa		11.48	□□□□□ -0.57
APTX-222	ENST00000478279	TSTD1	Q8NFU3	115 aa		11.48	□□□□□ -0.57
APTX-222	ENST00000478279	OR10T2	Q8NGX3	314 aa		11.48	□□□□□ -0.57
APTX-222	ENST00000478279	RIN3	Q8TB24	985 aa		11.48	□□□□□ -0.57
APTX-222	ENST00000478279	GIPC2	Q8TF65	315 aa		11.48	□□□□□ -0.57
APTX-222	ENST00000478279	CD101	Q93033	1021 aa		11.48	□□□□□ -0.57
APTX-222	ENST00000478279	ECT2	Q9H8V3	914 aa		11.48	□□□□□ -0.57
APTX-222	ENST00000478279	LRWD1	Q9UFC0	647 aa		11.48	□□□□□ -0.57
APTX-222	ENST00000478279	EVL	Q9UI08	416 aa	Predicted RBP	11.48	□□□□□ -0.57
APTX-222	ENST00000478279	KCNG1	Q9UIX4	513 aa		11.48	□□□□□ -0.57
APTX-222	ENST00000478279	KLK13	Q9UKR3	277 aa		11.48	□□□□□ -0.57
APTX-222	ENST00000478279	ACACA	Q13085	2346 aa		11.47	□□□□□ -0.57
APTX-222	ENST00000478279	MYO16	Q9Y6X6	1858 aa		11.47	□□□□□ -0.57
APTX-222	ENST00000478279	SFI1	A8K8P3	1242 aa		11.47	□□□□□ -0.57
APTX-222	ENST00000478279	LACTBL1	A8MY62	500 aa		11.47	□□□□□ -0.57
APTX-222	ENST00000478279		E9PMD0	336 aa		11.47	□□□□□ -0.57
APTX-222	ENST00000478279	PPEF2	O14830	753 aa		11.47	□□□□□ -0.57
APTX-222	ENST00000478279	BCKDHB	P21953	392 aa		11.47	□□□□□ -0.57
APTX-222	ENST00000478279	DHPS	P49366	369 aa	Predicted RBP	11.47	□□□□□ -0.57
APTX-222	ENST00000478279	FXR2	P51116	673 aa	Known RBP eCLIP	11.47	□□□□□ -0.57
APTX-222	ENST00000478279	FOSB	P53539	338 aa		11.47	□□□□□ -0.57
APTX-222	ENST00000478279	NLRP12	P59046	1061 aa		11.47	□□□□□ -0.57
APTX-222	ENST00000478279	PPP2R3A	Q06190	1150 aa		11.47	□□□□□ -0.57
APTX-222	ENST00000478279	LMAN2	Q12907	356 aa		11.47	□□□□□ -0.57
APTX-222	ENST00000478279	MAPK7	Q13164	816 aa		11.47	□□□□□ -0.57
APTX-222	ENST00000478279	PSMD2	Q13200	908 aa		11.47	□□□□□ -0.57
APTX-222	ENST00000478279	ZNF268	Q14587	947 aa	Predicted RBP	11.47	□□□□□ -0.57
APTX-222	ENST00000478279	ANKRD1	Q15327	319 aa		11.47	□□□□□ -0.57
APTX-222	ENST00000478279	TXNDC8	Q6A555	127 aa		11.47	□□□□□ -0.57
APTX-222	ENST00000478279	RINT1	Q6NUQ1	792 aa		11.47	□□□□□ -0.57
APTX-222	ENST00000478279	MON1A	Q86VX9	555 aa		11.47	□□□□□ -0.57
APTX-222	ENST00000478279	RASSF3	Q86WH2	238 aa		11.47	□□□□□ -0.57
APTX-222	ENST00000478279	CPA6	Q8N4T0	437 aa		11.47	□□□□□ -0.57
APTX-222	ENST00000478279	NECAB1	Q8N987	351 aa		11.47	□□□□□ -0.57
APTX-222	ENST00000478279	NSUN7	Q8NE18	718 aa	Known RBP	11.47	□□□□□ -0.57
APTX-222	ENST00000478279	CCDC26	Q8TAB7	109 aa		11.47	□□□□□ -0.57

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