RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476941.5

TRPC1-203, Transcript of transient receptor potential cation channel subfamily C member 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRPC1, Length 3,061 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1-203ENST00000476941 KRT82Q9NSB4 513 aa20.16■□□□□ 0.82
TRPC1-203ENST00000476941 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
TRPC1-203ENST00000476941 RAB20Q9NX57 234 aa20.16■□□□□ 0.82
TRPC1-203ENST00000476941 USTQ9Y2C2 406 aa20.16■□□□□ 0.82
TRPC1-203ENST00000476941 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa20.16■□□□□ 0.82
TRPC1-203ENST00000476941 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa20.15■□□□□ 0.82
TRPC1-203ENST00000476941 WNT10BO00744 389 aa20.15■□□□□ 0.82
TRPC1-203ENST00000476941 HARSP12081 509 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
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TRPC1-203ENST00000476941 HADHBP55084 474 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
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TRPC1-203ENST00000476941 FYB2Q5VWT5 728 aa20.15■□□□□ 0.82
TRPC1-203ENST00000476941 SPOPLQ6IQ16 392 aa20.15■□□□□ 0.82
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TRPC1-203ENST00000476941 DENND1AQ8TEH3 1009 aa20.14■□□□□ 0.82
TRPC1-203ENST00000476941 TRAIPQ9BWF2 469 aa20.14■□□□□ 0.82
TRPC1-203ENST00000476941 TBC1D22BQ9NU19 505 aa20.14■□□□□ 0.82
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TRPC1-203ENST00000476941 OVGP1Q12889 678 aa20.14■□□□□ 0.81
TRPC1-203ENST00000476941 SLC1A5Q15758 541 aa20.14■□□□□ 0.81
TRPC1-203ENST00000476941 CTC1Q2NKJ3 1217 aa20.14■□□□□ 0.81
TRPC1-203ENST00000476941 HELQQ8TDG4 1101 aa20.14■□□□□ 0.81
TRPC1-203ENST00000476941 SHC3Q92529 594 aa20.14■□□□□ 0.81
TRPC1-203ENST00000476941 SMC6Q96SB8 1091 aa20.14■□□□□ 0.81
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TRPC1-203ENST00000476941 SPIRE2Q8WWL2 714 aa20.13■□□□□ 0.81
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TRPC1-203ENST00000476941 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
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TRPC1-203ENST00000476941 CENPKQ9BS16 269 aa20.13■□□□□ 0.81
TRPC1-203ENST00000476941 RRM1P23921 792 aa20.13■□□□□ 0.81
TRPC1-203ENST00000476941 CETN2P41208 172 aa20.13■□□□□ 0.81
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TRPC1-203ENST00000476941 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
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TRPC1-203ENST00000476941 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa20.12■□□□□ 0.81
TRPC1-203ENST00000476941 P4HA2O15460 535 aa20.12■□□□□ 0.81
TRPC1-203ENST00000476941 SPATA31D3P0C874 917 aa20.12■□□□□ 0.81
TRPC1-203ENST00000476941 FGFR1P11362 822 aa20.12■□□□□ 0.81
TRPC1-203ENST00000476941 CCNFP41002 786 aa20.12■□□□□ 0.81
TRPC1-203ENST00000476941 ZBTB16Q05516 673 aa20.12■□□□□ 0.81
TRPC1-203ENST00000476941 MTERF2Q49AM1 385 aa20.12■□□□□ 0.81
TRPC1-203ENST00000476941 SPDYAQ5MJ70 313 aa20.12■□□□□ 0.81
TRPC1-203ENST00000476941 CAPN12Q6ZSI9 719 aa20.12■□□□□ 0.81
TRPC1-203ENST00000476941 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa20.12■□□□□ 0.81
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