RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473661.5

TTLL3-225, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, humanhuman

TSL 5

Gene TTLL3, Length 3,811 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL3-225ENST00000473661 UBR7Q8N806 425 aa11.14□□□□□ -0.63
TTLL3-225ENST00000473661 SLC4A11Q8NBS3 891 aa11.14□□□□□ -0.63
TTLL3-225ENST00000473661 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
TTLL3-225ENST00000473661 C11orf70Q9BRQ4 267 aa11.14□□□□□ -0.63
TTLL3-225ENST00000473661 HTATIP2Q9BUP3 242 aa11.14□□□□□ -0.63
TTLL3-225ENST00000473661 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa11.14□□□□□ -0.63
TTLL3-225ENST00000473661 FAM49BQ9NUQ9 324 aa11.14□□□□□ -0.63
TTLL3-225ENST00000473661 TAS2R14Q9NYV8 317 aa11.14□□□□□ -0.63
TTLL3-225ENST00000473661 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
TTLL3-225ENST00000473661 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
TTLL3-225ENST00000473661 PFKMP08237 780 aa11.13□□□□□ -0.63
TTLL3-225ENST00000473661 PCSK1P29120 753 aa11.13□□□□□ -0.63
TTLL3-225ENST00000473661 PALB2Q86YC2 1186 aa11.13□□□□□ -0.63
TTLL3-225ENST00000473661 LSM8O95777 96 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
TTLL3-225ENST00000473661 FAM163BP0C2L3 166 aa11.13□□□□□ -0.63
TTLL3-225ENST00000473661 ACRP10323 421 aa11.13□□□□□ -0.63
TTLL3-225ENST00000473661 BRCC3P46736 316 aa11.13□□□□□ -0.63
TTLL3-225ENST00000473661 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP11.13□□□□□ -0.633e-7■■□□□ 13.5
TTLL3-225ENST00000473661 CNGA2Q16280 664 aa11.13□□□□□ -0.63
TTLL3-225ENST00000473661 PDCL2Q8N4E4 241 aa11.13□□□□□ -0.63
TTLL3-225ENST00000473661 RFFLQ8WZ73 363 aa11.13□□□□□ -0.63
TTLL3-225ENST00000473661 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
TTLL3-225ENST00000473661 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
TTLL3-225ENST00000473661 MIS12Q9H081 205 aa11.13□□□□□ -0.63
TTLL3-225ENST00000473661 ISCUQ9H1K1 167 aa11.13□□□□□ -0.63
TTLL3-225ENST00000473661 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
TTLL3-225ENST00000473661 TRIM43BA6NCK2 446 aa11.13□□□□□ -0.63
TTLL3-225ENST00000473661 CALB1P05937 261 aa11.13□□□□□ -0.63
TTLL3-225ENST00000473661 MYBL1P10243 752 aa11.13□□□□□ -0.63
TTLL3-225ENST00000473661 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
TTLL3-225ENST00000473661 ZNF280BQ86YH2 543 aa11.13□□□□□ -0.63
TTLL3-225ENST00000473661 C7orf61Q8IZ16 206 aa11.13□□□□□ -0.63
TTLL3-225ENST00000473661 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
TTLL3-225ENST00000473661 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
TTLL3-225ENST00000473661 TWNKQ96RR1 684 aa11.13□□□□□ -0.63
TTLL3-225ENST00000473661 PAAF1Q9BRP4 392 aa11.13□□□□□ -0.63
TTLL3-225ENST00000473661 SYT11Q9BT88 431 aa11.13□□□□□ -0.63
TTLL3-225ENST00000473661 THAP2Q9H0W7 228 aa11.13□□□□□ -0.63
TTLL3-225ENST00000473661 HMGXB4Q9UGU5 601 aa11.13□□□□□ -0.63
TTLL3-225ENST00000473661 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
TTLL3-225ENST00000473661 I3L4J1 428 aa11.12□□□□□ -0.63
TTLL3-225ENST00000473661 TIGD5Q53EQ6 642 aa11.12□□□□□ -0.63
TTLL3-225ENST00000473661 SYCE1Q8N0S2 351 aa11.12□□□□□ -0.63
TTLL3-225ENST00000473661 LRRC43Q8N309 656 aa11.12□□□□□ -0.63
TTLL3-225ENST00000473661 TFAP2BQ92481 460 aa11.12□□□□□ -0.63
TTLL3-225ENST00000473661 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
TTLL3-225ENST00000473661 ZBED2Q9BTP6 218 aa11.12□□□□□ -0.63
TTLL3-225ENST00000473661 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
TTLL3-225ENST00000473661 CEP350Q5VT06 3117 aa11.12□□□□□ -0.63
TTLL3-225ENST00000473661 ADORA2BP29275 332 aa11.12□□□□□ -0.63
TTLL3-225ENST00000473661 TSPY1Q01534 308 aa11.12□□□□□ -0.63
TTLL3-225ENST00000473661 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP11.12□□□□□ -0.63
TTLL3-225ENST00000473661 GTF3C4Q9UKN8 822 aa11.12□□□□□ -0.63
TTLL3-225ENST00000473661 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa11.12□□□□□ -0.63
TTLL3-225ENST00000473661 DDHD2O94830 711 aa11.12□□□□□ -0.63
TTLL3-225ENST00000473661 ABL1P00519 1130 aa11.12□□□□□ -0.63
TTLL3-225ENST00000473661 WARSP23381 471 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
TTLL3-225ENST00000473661 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
TTLL3-225ENST00000473661 GATMP50440 423 aa11.12□□□□□ -0.63
TTLL3-225ENST00000473661 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa11.12□□□□□ -0.63
TTLL3-225ENST00000473661 DCUN1D2Q6PH85 259 aa11.12□□□□□ -0.63
TTLL3-225ENST00000473661 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa11.12□□□□□ -0.63
TTLL3-225ENST00000473661 OTOP2Q7RTS6 562 aa11.12□□□□□ -0.63
TTLL3-225ENST00000473661 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa11.12□□□□□ -0.63
TTLL3-225ENST00000473661 CEP57Q86XR8 500 aa11.12□□□□□ -0.63
TTLL3-225ENST00000473661 UBA3Q8TBC4 463 aa11.12□□□□□ -0.63
TTLL3-225ENST00000473661 SLC35G2Q8TBE7 412 aa11.12□□□□□ -0.63
TTLL3-225ENST00000473661 WHAMMQ8TF30 809 aa11.12□□□□□ -0.63
TTLL3-225ENST00000473661 TSPAN16Q9UKR8 245 aa11.12□□□□□ -0.63
TTLL3-225ENST00000473661 STRIP2Q9ULQ0 834 aa11.12□□□□□ -0.63
TTLL3-225ENST00000473661 PCDHGC3Q9UN70 934 aa11.12□□□□□ -0.63
TTLL3-225ENST00000473661 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa11.11□□□□□ -0.63
TTLL3-225ENST00000473661 FGBP02675 491 aa11.11□□□□□ -0.63
TTLL3-225ENST00000473661 NOMO3P69849 1222 aa11.11□□□□□ -0.63
TTLL3-225ENST00000473661 OVOS1Q6IE37 1185 aa11.11□□□□□ -0.63
TTLL3-225ENST00000473661 DAAM2Q86T65 1068 aa11.11□□□□□ -0.63
TTLL3-225ENST00000473661 C12orf29Q8N999 325 aa11.11□□□□□ -0.63
TTLL3-225ENST00000473661 DPF3Q92784 378 aa11.11□□□□□ -0.63
TTLL3-225ENST00000473661 WDR24Q96S15 920 aa11.11□□□□□ -0.63
TTLL3-225ENST00000473661 SYT15Q9BQS2 421 aa11.11□□□□□ -0.63
TTLL3-225ENST00000473661 IL23AQ9NPF7 189 aa11.11□□□□□ -0.63
TTLL3-225ENST00000473661 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
TTLL3-225ENST00000473661 INPPL1O15357 1258 aa11.11□□□□□ -0.63
TTLL3-225ENST00000473661 MICAL2O94851 1124 aa11.11□□□□□ -0.63
TTLL3-225ENST00000473661 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
TTLL3-225ENST00000473661 DNA2P51530 1060 aa11.11□□□□□ -0.63
TTLL3-225ENST00000473661 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
TTLL3-225ENST00000473661 CENPCQ03188 943 aa11.11□□□□□ -0.63
TTLL3-225ENST00000473661 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
TTLL3-225ENST00000473661 DENND1BQ6P3S1 775 aa11.11□□□□□ -0.63
TTLL3-225ENST00000473661 MCOLN2Q8IZK6 566 aa11.11□□□□□ -0.63
TTLL3-225ENST00000473661 VCPIP1Q96JH7 1222 aa11.11□□□□□ -0.63
TTLL3-225ENST00000473661 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
TTLL3-225ENST00000473661 YME1L1Q96TA2 773 aa11.11□□□□□ -0.63
TTLL3-225ENST00000473661 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
TTLL3-225ENST00000473661 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa11.11□□□□□ -0.63
TTLL3-225ENST00000473661 SCINQ9Y6U3 715 aa11.11□□□□□ -0.63
TTLL3-225ENST00000473661 TRIP11Q15643 1979 aa11.11□□□□□ -0.63
TTLL3-225ENST00000473661 O00370 1275 aa11.11□□□□□ -0.63
TTLL3-225ENST00000473661 UNGP13051 313 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18 ms