RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463615.1

PDLIM4-205, Transcript of PDZ and LIM domain 4, humanhuman

TSL 2

Gene PDLIM4, Length 582 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM4-205ENST00000463615 UNC13DQ70J99 1090 aa22.12■■□□□ 1.13
PDLIM4-205ENST00000463615 LIMS2Q7Z4I7 341 aa22.12■■□□□ 1.13
PDLIM4-205ENST00000463615 PDCL2Q8N4E4 241 aa22.12■■□□□ 1.13
PDLIM4-205ENST00000463615 HPS3Q969F9 1004 aa22.12■■□□□ 1.13
PDLIM4-205ENST00000463615 ACBD6Q9BR61 282 aa22.12■■□□□ 1.13
PDLIM4-205ENST00000463615 PCIF1Q9H4Z3 704 aa22.12■■□□□ 1.13
PDLIM4-205ENST00000463615 IL21Q9HBE4 155 aa22.12■■□□□ 1.13
PDLIM4-205ENST00000463615 INTS13Q9NVM9 706 aa22.12■■□□□ 1.13
PDLIM4-205ENST00000463615 OBP2AQ9NY56 170 aa22.12■■□□□ 1.13
PDLIM4-205ENST00000463615 SIX4Q9UIU6 781 aa22.12■■□□□ 1.13
PDLIM4-205ENST00000463615 ZMYM5Q9UJ78 669 aa22.12■■□□□ 1.13
PDLIM4-205ENST00000463615 RCOR1Q9UKL0 485 aa22.12■■□□□ 1.13
PDLIM4-205ENST00000463615 L1RE1Q9UN81 338 aa22.12■■□□□ 1.13
PDLIM4-205ENST00000463615 NCANO14594 1321 aa22.11■■□□□ 1.13
PDLIM4-205ENST00000463615 ZNF233A6NK53 670 aa22.11■■□□□ 1.13
PDLIM4-205ENST00000463615 NCAM2O15394 837 aa22.11■■□□□ 1.13
PDLIM4-205ENST00000463615 SOAT2O75908 522 aa22.11■■□□□ 1.13
PDLIM4-205ENST00000463615 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
PDLIM4-205ENST00000463615 TARSP26639 723 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
PDLIM4-205ENST00000463615 FZD5Q13467 585 aa22.11■■□□□ 1.13
PDLIM4-205ENST00000463615 UBXN2BQ14CS0 331 aa22.11■■□□□ 1.13
PDLIM4-205ENST00000463615 VEPH1Q14D04 833 aa22.11■■□□□ 1.13
PDLIM4-205ENST00000463615 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
PDLIM4-205ENST00000463615 ZNF528Q3MIS6 628 aa22.11■■□□□ 1.13
PDLIM4-205ENST00000463615 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
PDLIM4-205ENST00000463615 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa22.11■■□□□ 1.13
PDLIM4-205ENST00000463615 TOP6BLQ8N6T0 577 aa22.11■■□□□ 1.13
PDLIM4-205ENST00000463615 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
PDLIM4-205ENST00000463615 HSPBP1Q9NZL4 362 aa22.11■■□□□ 1.13
PDLIM4-205ENST00000463615 FBXO4Q9UKT5 387 aa22.11■■□□□ 1.13
PDLIM4-205ENST00000463615 CFAP45Q9UL16 551 aa22.11■■□□□ 1.13
PDLIM4-205ENST00000463615 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa22.1■■□□□ 1.13
PDLIM4-205ENST00000463615 HEPACAM2A8MVW5 462 aa22.1■■□□□ 1.13
PDLIM4-205ENST00000463615 GABRDO14764 452 aa22.1■■□□□ 1.13
PDLIM4-205ENST00000463615 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
PDLIM4-205ENST00000463615 TGFB1I1O43294 461 aa22.1■■□□□ 1.13
PDLIM4-205ENST00000463615 HUS1O60921 280 aa22.1■■□□□ 1.13
PDLIM4-205ENST00000463615 SP9P0CG40 484 aa22.1■■□□□ 1.13
PDLIM4-205ENST00000463615 GABRR2P28476 465 aa22.1■■□□□ 1.13
PDLIM4-205ENST00000463615 CDC25CP30307 473 aa22.1■■□□□ 1.13
PDLIM4-205ENST00000463615 GDI1P31150 447 aa22.1■■□□□ 1.13
PDLIM4-205ENST00000463615 TSPY1Q01534 308 aa22.1■■□□□ 1.13
PDLIM4-205ENST00000463615 BMT2Q1RMZ1 405 aa22.1■■□□□ 1.13
PDLIM4-205ENST00000463615 MGAT5BQ3V5L5 792 aa22.1■■□□□ 1.13
PDLIM4-205ENST00000463615 MAMSTRQ6ZN01 415 aa22.1■■□□□ 1.13
PDLIM4-205ENST00000463615 DPH6Q7L8W6 267 aa22.1■■□□□ 1.13
PDLIM4-205ENST00000463615 RSPRY1Q96DX4 576 aa22.1■■□□□ 1.13
PDLIM4-205ENST00000463615 MSANTD3Q96H12 275 aa22.1■■□□□ 1.13
PDLIM4-205ENST00000463615 PKMYT1Q99640 499 aa22.1■■□□□ 1.13
PDLIM4-205ENST00000463615 MTMR12Q9C0I1 747 aa22.1■■□□□ 1.13
PDLIM4-205ENST00000463615 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa22.1■■□□□ 1.13
PDLIM4-205ENST00000463615 ABCB6Q9NP58 842 aa22.1■■□□□ 1.13
PDLIM4-205ENST00000463615 FAM13BQ9NYF5 915 aa22.1■■□□□ 1.13
PDLIM4-205ENST00000463615 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa22.1■■□□□ 1.13
PDLIM4-205ENST00000463615 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa22.1■■□□□ 1.13
PDLIM4-205ENST00000463615 FANCMQ8IYD8 2048 aa22.09■■□□□ 1.13
PDLIM4-205ENST00000463615 SOBPA7XYQ1 873 aa22.09■■□□□ 1.13
PDLIM4-205ENST00000463615 ZNF263O14978 683 aa22.09■■□□□ 1.13
PDLIM4-205ENST00000463615 CHADO15335 359 aa22.09■■□□□ 1.13
PDLIM4-205ENST00000463615 TMEM191BP0C7N4 346 aa22.09■■□□□ 1.13
PDLIM4-205ENST00000463615 CD72P21854 359 aa22.09■■□□□ 1.13
PDLIM4-205ENST00000463615 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa22.09■■□□□ 1.13
PDLIM4-205ENST00000463615 STXBP5Q5T5C0 1151 aa22.09■■□□□ 1.13
PDLIM4-205ENST00000463615 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
PDLIM4-205ENST00000463615 SCARA3Q6AZY7 606 aa22.09■■□□□ 1.13
PDLIM4-205ENST00000463615 CBWD2Q8IUF1 395 aa22.09■■□□□ 1.13
PDLIM4-205ENST00000463615 WDR49Q8IV35 697 aa22.09■■□□□ 1.13
PDLIM4-205ENST00000463615 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
PDLIM4-205ENST00000463615 SCFD1Q8WVM8 642 aa22.09■■□□□ 1.13
PDLIM4-205ENST00000463615 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
PDLIM4-205ENST00000463615 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa22.09■■□□□ 1.13
PDLIM4-205ENST00000463615 LPIN3Q9BQK8 851 aa22.09■■□□□ 1.13
PDLIM4-205ENST00000463615 ATXN3LQ9H3M9 355 aa22.09■■□□□ 1.13
PDLIM4-205ENST00000463615 TASP1Q9H6P5 420 aa22.09■■□□□ 1.13
PDLIM4-205ENST00000463615 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa22.09■■□□□ 1.13
PDLIM4-205ENST00000463615 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
PDLIM4-205ENST00000463615 PTPRJQ12913 1337 aa22.08■■□□□ 1.13
PDLIM4-205ENST00000463615 PATJQ8NI35 1801 aa22.08■■□□□ 1.13
PDLIM4-205ENST00000463615 ME1P48163 572 aa22.08■■□□□ 1.13
PDLIM4-205ENST00000463615 LHX1P48742 406 aa22.08■■□□□ 1.13
PDLIM4-205ENST00000463615 MYL7Q01449 175 aa22.08■■□□□ 1.13
PDLIM4-205ENST00000463615 PKP1Q13835 747 aa22.08■■□□□ 1.13
PDLIM4-205ENST00000463615 DUOXA2Q1HG44 320 aa22.08■■□□□ 1.13
PDLIM4-205ENST00000463615 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
PDLIM4-205ENST00000463615 C1orf228Q6PIY5 440 aa22.08■■□□□ 1.13
PDLIM4-205ENST00000463615 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
PDLIM4-205ENST00000463615 C12orf56Q8IXR9 622 aa22.08■■□□□ 1.13
PDLIM4-205ENST00000463615 OR5B17Q8NGF7 314 aa22.08■■□□□ 1.13
PDLIM4-205ENST00000463615 IER2Q9BTL4 223 aa22.08■■□□□ 1.13
PDLIM4-205ENST00000463615 TMLHEQ9NVH6 421 aa22.08■■□□□ 1.13
PDLIM4-205ENST00000463615 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
PDLIM4-205ENST00000463615 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
PDLIM4-205ENST00000463615 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
PDLIM4-205ENST00000463615 BFSP1Q12934 665 aa22.07■■□□□ 1.12
PDLIM4-205ENST00000463615 MYO1EQ12965 1108 aa22.07■■□□□ 1.12
PDLIM4-205ENST00000463615 SOWAHAQ2M3V2 549 aa22.07■■□□□ 1.12
PDLIM4-205ENST00000463615 CFAP221Q4G0U5 840 aa22.07■■□□□ 1.12
PDLIM4-205ENST00000463615 GPR158Q5T848 1215 aa22.07■■□□□ 1.12
PDLIM4-205ENST00000463615 FAM200AQ8TCP9 573 aa22.07■■□□□ 1.12
PDLIM4-205ENST00000463615 NELL1Q92832 810 aa22.07■■□□□ 1.12
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