RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462357.1

IMP4-209, Transcript of IMP4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein, humanhuman

TSL 5

Gene IMP4, Length 533 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP4-209ENST00000462357 PTMSP20962 102 aa22.03■■□□□ 1.12
IMP4-209ENST00000462357 WARSP23381 471 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
IMP4-209ENST00000462357 FSHRP23945 695 aa22.03■■□□□ 1.12
IMP4-209ENST00000462357 DUSP4Q13115 394 aa22.03■■□□□ 1.12
IMP4-209ENST00000462357 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
IMP4-209ENST00000462357 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
IMP4-209ENST00000462357 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa22.03■■□□□ 1.12
IMP4-209ENST00000462357 TTC39CQ8N584 583 aa22.03■■□□□ 1.12
IMP4-209ENST00000462357 OR6B3Q8NGW1 331 aa22.03■■□□□ 1.12
IMP4-209ENST00000462357 FAXDC2Q96IV6 333 aa22.03■■□□□ 1.12
IMP4-209ENST00000462357 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
IMP4-209ENST00000462357 RWDD2AQ9UIY3 292 aa22.03■■□□□ 1.12
IMP4-209ENST00000462357 CTNND2Q9UQB3 1225 aa22.03■■□□□ 1.12
IMP4-209ENST00000462357 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
IMP4-209ENST00000462357 OR4Q2P0C623 313 aa22.02■■□□□ 1.12
IMP4-209ENST00000462357 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
IMP4-209ENST00000462357 GCLMP48507 274 aa22.02■■□□□ 1.12
IMP4-209ENST00000462357 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
IMP4-209ENST00000462357 TWF1Q12792 350 aa22.02■■□□□ 1.12
IMP4-209ENST00000462357 MGAT5BQ3V5L5 792 aa22.02■■□□□ 1.12
IMP4-209ENST00000462357 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
IMP4-209ENST00000462357 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
IMP4-209ENST00000462357 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
IMP4-209ENST00000462357 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
IMP4-209ENST00000462357 OR10T2Q8NGX3 314 aa22.02■■□□□ 1.12
IMP4-209ENST00000462357 FAM200AQ8TCP9 573 aa22.02■■□□□ 1.12
IMP4-209ENST00000462357 PLEKHO2Q8TD55 490 aa22.02■■□□□ 1.12
IMP4-209ENST00000462357 EEF2KMTQ96G04 330 aa22.02■■□□□ 1.12
IMP4-209ENST00000462357 MMRN2Q9H8L6 949 aa22.02■■□□□ 1.12
IMP4-209ENST00000462357 ABCB6Q9NP58 842 aa22.02■■□□□ 1.12
IMP4-209ENST00000462357 MTMR11A4FU01 709 aa22.01■■□□□ 1.11
IMP4-209ENST00000462357 TRIM49BA6NDI0 452 aa22.01■■□□□ 1.11
IMP4-209ENST00000462357 CD44P16070 742 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
IMP4-209ENST00000462357 MXI1P50539 228 aa22.01■■□□□ 1.11
IMP4-209ENST00000462357 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
IMP4-209ENST00000462357 LIMS2Q7Z4I7 341 aa22.01■■□□□ 1.11
IMP4-209ENST00000462357 FBXL13Q8NEE6 735 aa22.01■■□□□ 1.11
IMP4-209ENST00000462357 NXPE3Q969Y0 559 aa22.01■■□□□ 1.11
IMP4-209ENST00000462357 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP22.01■■□□□ 1.11
IMP4-209ENST00000462357 TNIP3Q96KP6 325 aa22.01■■□□□ 1.11
IMP4-209ENST00000462357 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
IMP4-209ENST00000462357 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
IMP4-209ENST00000462357 A8MXQ7 604 aa22■■□□□ 1.11
IMP4-209ENST00000462357 SEC24AO95486 1093 aa22■■□□□ 1.11
IMP4-209ENST00000462357 HLA-DRAP01903 254 aa22■■□□□ 1.11
IMP4-209ENST00000462357 TRIM49P0CI25 452 aa22■■□□□ 1.11
IMP4-209ENST00000462357 TRIM49CP0CI26 452 aa22■■□□□ 1.11
IMP4-209ENST00000462357 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
IMP4-209ENST00000462357 BMP6P22004 513 aa22■■□□□ 1.11
IMP4-209ENST00000462357 PMS1P54277 932 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
IMP4-209ENST00000462357 TTI2Q6NXR4 508 aa22■■□□□ 1.11
IMP4-209ENST00000462357 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
IMP4-209ENST00000462357 ATAD1Q8NBU5 361 aa22■■□□□ 1.11
IMP4-209ENST00000462357 FAM84AQ96KN4 292 aa22■■□□□ 1.11
IMP4-209ENST00000462357 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
IMP4-209ENST00000462357 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
IMP4-209ENST00000462357 XYLT2Q9H1B5 865 aa22■■□□□ 1.11
IMP4-209ENST00000462357 CYP3A43Q9HB55 503 aa22■■□□□ 1.11
IMP4-209ENST00000462357 ASAH2Q9NR71 780 aa22■■□□□ 1.11
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IMP4-209ENST00000462357 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
IMP4-209ENST00000462357 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
IMP4-209ENST00000462357 YIPF1Q9Y548 306 aa22■■□□□ 1.11
IMP4-209ENST00000462357 ANK1P16157 1881 aa22■■□□□ 1.11
IMP4-209ENST00000462357 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
IMP4-209ENST00000462357 MICAL2O94851 1124 aa21.99■■□□□ 1.11
IMP4-209ENST00000462357 ASS1P00966 412 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
IMP4-209ENST00000462357 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
IMP4-209ENST00000462357 NLRP12P59046 1061 aa21.99■■□□□ 1.11
IMP4-209ENST00000462357 SASS6Q6UVJ0 657 aa21.99■■□□□ 1.11
IMP4-209ENST00000462357 RNF135Q8IUD6 432 aa21.99■■□□□ 1.11
IMP4-209ENST00000462357 FAM114A1Q8IWE2 563 aa21.99■■□□□ 1.11
IMP4-209ENST00000462357 RTP3Q9BQQ7 232 aa21.99■■□□□ 1.11
IMP4-209ENST00000462357 SYT15Q9BQS2 421 aa21.99■■□□□ 1.11
IMP4-209ENST00000462357 CORO1BQ9BR76 489 aa21.99■■□□□ 1.11
IMP4-209ENST00000462357 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
IMP4-209ENST00000462357 RAB20Q9NX57 234 aa21.99■■□□□ 1.11
IMP4-209ENST00000462357 EHD2Q9NZN4 543 aa21.99■■□□□ 1.11
IMP4-209ENST00000462357 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa21.99■■□□□ 1.11
IMP4-209ENST00000462357 VWA8A3KMH1 1905 aa21.99■■□□□ 1.11
IMP4-209ENST00000462357 NCOR1O75376 2440 aa21.98■■□□□ 1.11
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IMP4-209ENST00000462357 VNN1O95497 513 aa21.98■■□□□ 1.11
IMP4-209ENST00000462357 RHOP08100 348 aa21.98■■□□□ 1.11
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IMP4-209ENST00000462357 STX17P56962 302 aa21.98■■□□□ 1.11
IMP4-209ENST00000462357 PPP3CAQ08209 521 aa21.98■■□□□ 1.11
IMP4-209ENST00000462357 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
IMP4-209ENST00000462357 CEP295NLQ96MC4 621 aa21.98■■□□□ 1.11
IMP4-209ENST00000462357 TMEM209Q96SK2 561 aa21.98■■□□□ 1.11
IMP4-209ENST00000462357 GPR88Q9GZN0 384 aa21.98■■□□□ 1.11
IMP4-209ENST00000462357 IGSF9Q9P2J2 1179 aa21.98■■□□□ 1.11
IMP4-209ENST00000462357 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
IMP4-209ENST00000462357 GTF3C4Q9UKN8 822 aa21.98■■□□□ 1.11
IMP4-209ENST00000462357 CDH7Q9ULB5 785 aa21.98■■□□□ 1.11
IMP4-209ENST00000462357 ATP8B3O60423 1300 aa21.98■■□□□ 1.11
IMP4-209ENST00000462357 C2CD4DB7Z1M9 353 aa21.97■■□□□ 1.11
IMP4-209ENST00000462357 P4HA2O15460 535 aa21.97■■□□□ 1.11
IMP4-209ENST00000462357 DCXO43602 365 aa21.97■■□□□ 1.11
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