RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462322.2

SMKR1-201, Transcript of small lysine rich protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SMKR1, Length 1,035 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMKR1-201ENST00000462322 FBXL21Q9UKT6 434 aa25.73■■□□□ 1.71
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SMKR1-201ENST00000462322 OSTM1Q86WC4 334 aa25.72■■□□□ 1.71
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SMKR1-201ENST00000462322 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP25.72■■□□□ 1.71
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SMKR1-201ENST00000462322 PCSK1P29120 753 aa25.71■■□□□ 1.71
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SMKR1-201ENST00000462322 TIGD1Q96MW7 591 aa25.71■■□□□ 1.71
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SMKR1-201ENST00000462322 TAF12Q16514 161 aa25.67■■□□□ 1.7
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SMKR1-201ENST00000462322 GPR152Q8TDT2 470 aa25.67■■□□□ 1.7
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SMKR1-201ENST00000462322 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP25.67■■□□□ 1.7
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SMKR1-201ENST00000462322 LMO2P25791 158 aa25.66■■□□□ 1.7
SMKR1-201ENST00000462322 NCOA4Q13772 614 aa25.66■■□□□ 1.7
SMKR1-201ENST00000462322 ZCWPW2Q504Y3 356 aa25.66■■□□□ 1.7
SMKR1-201ENST00000462322 FAM78AQ5JUQ0 283 aa25.66■■□□□ 1.7
SMKR1-201ENST00000462322 ZSWIM3Q96MP5 696 aa25.66■■□□□ 1.7
SMKR1-201ENST00000462322 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP25.66■■□□□ 1.7
SMKR1-201ENST00000462322 XYLT2Q9H1B5 865 aa25.66■■□□□ 1.7
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