RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461017.1

RABGEF1-206, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene RABGEF1, Length 711 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-206ENST00000461017 WDR49Q8IV35 697 aa7.54□□□□□ -1.2
RABGEF1-206ENST00000461017 TCEAL8Q8IYN2 117 aa7.54□□□□□ -1.2
RABGEF1-206ENST00000461017 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
RABGEF1-206ENST00000461017 LRRC52Q8N7C0 313 aa7.54□□□□□ -1.2
RABGEF1-206ENST00000461017 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
RABGEF1-206ENST00000461017 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
RABGEF1-206ENST00000461017 TMEM174Q8WUU8 243 aa7.54□□□□□ -1.2
RABGEF1-206ENST00000461017 EDAQ92838 391 aa7.54□□□□□ -1.2
RABGEF1-206ENST00000461017 ASIC4Q96FT7 647 aa7.54□□□□□ -1.2
RABGEF1-206ENST00000461017 TIGD1Q96MW7 591 aa7.54□□□□□ -1.2
RABGEF1-206ENST00000461017 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
RABGEF1-206ENST00000461017 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa7.54□□□□□ -1.2
RABGEF1-206ENST00000461017 XYLT2Q9H1B5 865 aa7.54□□□□□ -1.2
RABGEF1-206ENST00000461017 PIDD1Q9HB75 910 aa7.54□□□□□ -1.2
RABGEF1-206ENST00000461017 KIAA1586Q9HCI6 787 aa7.54□□□□□ -1.2
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
RABGEF1-206ENST00000461017 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP7.54□□□□□ -1.2
RABGEF1-206ENST00000461017 ITGA11Q9UKX5 1188 aa7.54□□□□□ -1.2
RABGEF1-206ENST00000461017 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa7.54□□□□□ -1.2
RABGEF1-206ENST00000461017 USTQ9Y2C2 406 aa7.54□□□□□ -1.2
RABGEF1-206ENST00000461017 NR2E1Q9Y466 385 aa7.54□□□□□ -1.2
RABGEF1-206ENST00000461017 YIPF1Q9Y548 306 aa7.54□□□□□ -1.2
RABGEF1-206ENST00000461017 INSL5Q9Y5Q6 135 aa7.54□□□□□ -1.2
RABGEF1-206ENST00000461017 SNX9Q9Y5X1 595 aa7.54□□□□□ -1.2
RABGEF1-206ENST00000461017 COL4A2P08572 1712 aa7.54□□□□□ -1.2
RABGEF1-206ENST00000461017 HELZP42694 1942 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
RABGEF1-206ENST00000461017 MIA3Q5JRA6 1907 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGEF1-206ENST00000461017 MYBPHLA2RUH7 354 aa7.53□□□□□ -1.2
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RABGEF1-206ENST00000461017 OR6C75A6NL08 312 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGEF1-206ENST00000461017 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGEF1-206ENST00000461017 BIN1O00499 593 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGEF1-206ENST00000461017 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
RABGEF1-206ENST00000461017 POU2F2P09086 479 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGEF1-206ENST00000461017 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP7.53□□□□□ -1.2
RABGEF1-206ENST00000461017 TRIM49P0CI25 452 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGEF1-206ENST00000461017 TRIM49CP0CI26 452 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGEF1-206ENST00000461017 LAMP2P13473 410 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGEF1-206ENST00000461017 ATF6P18850 670 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGEF1-206ENST00000461017 FSHRP23945 695 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGEF1-206ENST00000461017 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
RABGEF1-206ENST00000461017 ELF1P32519 619 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGEF1-206ENST00000461017 RAP1GAPP47736 663 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGEF1-206ENST00000461017 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
RABGEF1-206ENST00000461017 PPP3CAQ08209 521 aa7.53□□□□□ -1.2
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RABGEF1-206ENST00000461017 NFIL3Q16649 462 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGEF1-206ENST00000461017 SV2CQ496J9 727 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGEF1-206ENST00000461017 LIN9Q5TKA1 542 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
RABGEF1-206ENST00000461017 CEP135Q66GS9 1140 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGEF1-206ENST00000461017 ANKRD40Q6AI12 368 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGEF1-206ENST00000461017 SPOPLQ6IQ16 392 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGEF1-206ENST00000461017 PARM1Q6UWI2 310 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGEF1-206ENST00000461017 HFE2Q6ZVN8 426 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGEF1-206ENST00000461017 HS2ST1Q7LGA3 356 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGEF1-206ENST00000461017 USP37Q86T82 979 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGEF1-206ENST00000461017 GPIHBP1Q8IV16 184 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGEF1-206ENST00000461017 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
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RABGEF1-206ENST00000461017 GPR152Q8TDT2 470 aa7.53□□□□□ -1.2
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RABGEF1-206ENST00000461017 MCRS1Q96EZ8 462 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGEF1-206ENST00000461017 HPDLQ96IR7 371 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGEF1-206ENST00000461017 ZSWIM3Q96MP5 696 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGEF1-206ENST00000461017 MED15Q96RN5 788 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGEF1-206ENST00000461017 FNBP1Q96RU3 617 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGEF1-206ENST00000461017 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
RABGEF1-206ENST00000461017 CORO1BQ9BR76 489 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGEF1-206ENST00000461017 MKNK1Q9BUB5 465 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGEF1-206ENST00000461017 DPEP3Q9H4B8 488 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGEF1-206ENST00000461017 KCNK12Q9HB15 430 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGEF1-206ENST00000461017 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
RABGEF1-206ENST00000461017 CRTAC1Q9NQ79 661 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGEF1-206ENST00000461017 TMEM30AQ9NV96 361 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGEF1-206ENST00000461017 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
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RABGEF1-206ENST00000461017 EPS15L1Q9UBC2 864 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGEF1-206ENST00000461017 GTF3C4Q9UKN8 822 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGEF1-206ENST00000461017 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGEF1-206ENST00000461017 MYO16Q9Y6X6 1858 aa7.52□□□□□ -1.21
RABGEF1-206ENST00000461017 TMEM221A6NGB7 291 aa7.52□□□□□ -1.21
RABGEF1-206ENST00000461017 ANHXE9PGG2 379 aa7.52□□□□□ -1.21
RABGEF1-206ENST00000461017 M0R296 226 aa7.52□□□□□ -1.21
RABGEF1-206ENST00000461017 PRRG1O14668 218 aa7.52□□□□□ -1.21
RABGEF1-206ENST00000461017 CALUO43852 315 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
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RABGEF1-206ENST00000461017 LRG1P02750 347 aa7.52□□□□□ -1.21
RABGEF1-206ENST00000461017 PDGFRBP09619 1106 aa7.52□□□□□ -1.21
RABGEF1-206ENST00000461017 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
RABGEF1-206ENST00000461017 ALADP13716 330 aa7.52□□□□□ -1.21
RABGEF1-206ENST00000461017 PTPN2P17706 415 aa7.52□□□□□ -1.21
RABGEF1-206ENST00000461017 FCARP24071 287 aa7.52□□□□□ -1.21
RABGEF1-206ENST00000461017 NR2F2P24468 414 aa7.52□□□□□ -1.21
RABGEF1-206ENST00000461017 CYP2F1P24903 491 aa7.52□□□□□ -1.21
RABGEF1-206ENST00000461017 VAMP7P51809 220 aa7.52□□□□□ -1.21
RABGEF1-206ENST00000461017 EPHA5P54756 1037 aa7.52□□□□□ -1.21
RABGEF1-206ENST00000461017 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
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