RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460766.5

IMP4-208, Transcript of IMP4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene IMP4, Length 2,379 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP4-208ENST00000460766 LCTP09848 1927 aa21.6■■□□□ 1.05
IMP4-208ENST00000460766 GOLGA8SH3BPF8 625 aa21.6■■□□□ 1.05
IMP4-208ENST00000460766 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
IMP4-208ENST00000460766 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
IMP4-208ENST00000460766 IER5Q5VY09 327 aa21.6■■□□□ 1.05
IMP4-208ENST00000460766 METTL7BQ6UX53 244 aa21.6■■□□□ 1.05
IMP4-208ENST00000460766 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa21.6■■□□□ 1.05
IMP4-208ENST00000460766 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
IMP4-208ENST00000460766 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
IMP4-208ENST00000460766 SGK1O00141 431 aa21.59■■□□□ 1.05
IMP4-208ENST00000460766 ABHD2P08910 425 aa21.59■■□□□ 1.05
IMP4-208ENST00000460766 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
IMP4-208ENST00000460766 COPS2P61201 443 aa21.59■■□□□ 1.05
IMP4-208ENST00000460766 TAP1Q03518 808 aa21.59■■□□□ 1.05
IMP4-208ENST00000460766 SH3D19Q5HYK7 790 aa21.59■■□□□ 1.05
IMP4-208ENST00000460766 TMEM63BQ5T3F8 832 aa21.59■■□□□ 1.05
IMP4-208ENST00000460766 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP21.59■■□□□ 1.052e-6■□□□□ 8.3
IMP4-208ENST00000460766 SIP14410 1827 aa21.59■■□□□ 1.05
IMP4-208ENST00000460766 CHUKO15111 745 aa21.59■■□□□ 1.05
IMP4-208ENST00000460766 CD19P15391 556 aa21.59■■□□□ 1.05
IMP4-208ENST00000460766 EDNRBP24530 442 aa21.59■■□□□ 1.05
IMP4-208ENST00000460766 CDKN2BP42772 138 aa21.59■■□□□ 1.05
IMP4-208ENST00000460766 VCPP55072 806 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
IMP4-208ENST00000460766 DYNLT1P63172 113 aa21.59■■□□□ 1.05
IMP4-208ENST00000460766 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
IMP4-208ENST00000460766 TMEM132AQ24JP5 1023 aa21.59■■□□□ 1.05
IMP4-208ENST00000460766 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa21.59■■□□□ 1.05
IMP4-208ENST00000460766 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
IMP4-208ENST00000460766 SPATA21Q7Z572 469 aa21.59■■□□□ 1.05
IMP4-208ENST00000460766 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
IMP4-208ENST00000460766 VPS37BQ9H9H4 285 aa21.59■■□□□ 1.05
IMP4-208ENST00000460766 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
IMP4-208ENST00000460766 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa21.59■■□□□ 1.05
IMP4-208ENST00000460766 SSC5DA1L4H1 1573 aa21.58■■□□□ 1.05
IMP4-208ENST00000460766 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa21.58■■□□□ 1.05
IMP4-208ENST00000460766 UBOX5O94941 541 aa21.58■■□□□ 1.05
IMP4-208ENST00000460766 ASPAP45381 313 aa21.58■■□□□ 1.05
IMP4-208ENST00000460766 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
IMP4-208ENST00000460766 SMTNL2Q2TAL5 461 aa21.58■■□□□ 1.05
IMP4-208ENST00000460766 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
IMP4-208ENST00000460766 RHPN2Q8IUC4 686 aa21.58■■□□□ 1.05
IMP4-208ENST00000460766 RIOX2Q8IUF8 465 aa21.58■■□□□ 1.05
IMP4-208ENST00000460766 CCDC63Q8NA47 563 aa21.58■■□□□ 1.05
IMP4-208ENST00000460766 FAM167AQ96KS9 214 aa21.58■■□□□ 1.05
IMP4-208ENST00000460766 ZWILCHQ9H900 591 aa21.58■■□□□ 1.05
IMP4-208ENST00000460766 EURLQ9NYK6 297 aa21.58■■□□□ 1.05
IMP4-208ENST00000460766 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
IMP4-208ENST00000460766 ACTL7BQ9Y614 415 aa21.58■■□□□ 1.05
IMP4-208ENST00000460766 HOXC6P09630 235 aa21.58■■□□□ 1.04
IMP4-208ENST00000460766 PSMA2P25787 234 aa21.58■■□□□ 1.04
IMP4-208ENST00000460766 PSMC4P43686 418 aa21.58■■□□□ 1.04
IMP4-208ENST00000460766 VGLL4Q14135 290 aa21.58■■□□□ 1.04
IMP4-208ENST00000460766 OASLQ15646 514 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.04
IMP4-208ENST00000460766 WDR72Q3MJ13 1102 aa21.58■■□□□ 1.04
IMP4-208ENST00000460766 DENND1BQ6P3S1 775 aa21.58■■□□□ 1.04
IMP4-208ENST00000460766 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa21.58■■□□□ 1.04
IMP4-208ENST00000460766 ZBED8Q8IZ13 594 aa21.58■■□□□ 1.04
IMP4-208ENST00000460766 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.04
IMP4-208ENST00000460766 TCP11Q8WWU5 503 aa21.58■■□□□ 1.04
IMP4-208ENST00000460766 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa21.58■■□□□ 1.04
IMP4-208ENST00000460766 MAGEB18Q96M61 343 aa21.58■■□□□ 1.04
IMP4-208ENST00000460766 TTC25Q96NG3 672 aa21.58■■□□□ 1.04
IMP4-208ENST00000460766 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.04
IMP4-208ENST00000460766 PCDHGC3Q9UN70 934 aa21.58■■□□□ 1.04
IMP4-208ENST00000460766 TNNC2P02585 160 aa21.57■■□□□ 1.04
IMP4-208ENST00000460766 KRT19P08727 400 aa21.57■■□□□ 1.04
IMP4-208ENST00000460766 TGFB3P10600 412 aa21.57■■□□□ 1.04
IMP4-208ENST00000460766 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
IMP4-208ENST00000460766 MORF4L2Q15014 288 aa21.57■■□□□ 1.04
IMP4-208ENST00000460766 SURF1Q15526 300 aa21.57■■□□□ 1.04
IMP4-208ENST00000460766 HSDL1Q3SXM5 330 aa21.57■■□□□ 1.04
IMP4-208ENST00000460766 MAML1Q92585 1016 aa21.57■■□□□ 1.04
IMP4-208ENST00000460766 NLRP4Q96MN2 994 aa21.57■■□□□ 1.04
IMP4-208ENST00000460766 SPATC1LQ9H0A9 340 aa21.57■■□□□ 1.04
IMP4-208ENST00000460766 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
IMP4-208ENST00000460766 POLIQ9UNA4 740 aa21.57■■□□□ 1.04
IMP4-208ENST00000460766 AGAP1Q9UPQ3 857 aa21.57■■□□□ 1.04
IMP4-208ENST00000460766 FAM47DPA6NHR8 397 aa21.56■■□□□ 1.04
IMP4-208ENST00000460766 GOLGA8MH3BSY2 632 aa21.56■■□□□ 1.04
IMP4-208ENST00000460766 NOP56O00567 594 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
IMP4-208ENST00000460766 ABLIM1O14639 778 aa21.56■■□□□ 1.04
IMP4-208ENST00000460766 SPAG7O75391 227 aa21.56■■□□□ 1.04
IMP4-208ENST00000460766 GJB1P08034 283 aa21.56■■□□□ 1.04
IMP4-208ENST00000460766 RDXP35241 583 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
IMP4-208ENST00000460766 RAP1GAPP47736 663 aa21.56■■□□□ 1.04
IMP4-208ENST00000460766 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
IMP4-208ENST00000460766 KCNT1Q5JUK3 1230 aa21.56■■□□□ 1.04
IMP4-208ENST00000460766 NIPA2Q8N8Q9 360 aa21.56■■□□□ 1.04
IMP4-208ENST00000460766 CEP120Q8N960 986 aa21.56■■□□□ 1.04
IMP4-208ENST00000460766 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
IMP4-208ENST00000460766 XYLT2Q9H1B5 865 aa21.56■■□□□ 1.04
IMP4-208ENST00000460766 TJP2Q9UDY2 1190 aa21.56■■□□□ 1.04
IMP4-208ENST00000460766 STRIP2Q9ULQ0 834 aa21.56■■□□□ 1.04
IMP4-208ENST00000460766 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa21.56■■□□□ 1.04
IMP4-208ENST00000460766 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa21.56■■□□□ 1.04
IMP4-208ENST00000460766 USP2O75604 605 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
IMP4-208ENST00000460766 ARIH2O95376 493 aa21.56■■□□□ 1.04
IMP4-208ENST00000460766 ITGAVP06756 1048 aa21.56■■□□□ 1.04
IMP4-208ENST00000460766 KRT3P12035 628 aa21.56■■□□□ 1.04
IMP4-208ENST00000460766 GCAP28676 217 aa21.56■■□□□ 1.04
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