RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460308.6

ABCD4-202, Transcript of ATP binding cassette subfamily D member 4, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ABCD4, Length 1,003 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD4-202ENST00000460308 GABRDO14764 452 aa22.94■■□□□ 1.26
ABCD4-202ENST00000460308 VNN1O95497 513 aa22.94■■□□□ 1.26
ABCD4-202ENST00000460308 HLA-DRAP01903 254 aa22.94■■□□□ 1.26
ABCD4-202ENST00000460308 PTPN2P17706 415 aa22.94■■□□□ 1.26
ABCD4-202ENST00000460308 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
ABCD4-202ENST00000460308 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
ABCD4-202ENST00000460308 ALDH1A3P47895 512 aa22.94■■□□□ 1.26
ABCD4-202ENST00000460308 PPP3CAQ08209 521 aa22.94■■□□□ 1.26
ABCD4-202ENST00000460308 TWF1Q12792 350 aa22.94■■□□□ 1.26
ABCD4-202ENST00000460308 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
ABCD4-202ENST00000460308 CCDC40Q4G0X9 1142 aa22.94■■□□□ 1.26
ABCD4-202ENST00000460308 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
ABCD4-202ENST00000460308 KRT39Q6A163 491 aa22.94■■□□□ 1.26
ABCD4-202ENST00000460308 IQCEQ6IPM2 695 aa22.94■■□□□ 1.26
ABCD4-202ENST00000460308 TTI2Q6NXR4 508 aa22.94■■□□□ 1.26
ABCD4-202ENST00000460308 FOXR2Q6PJQ5 311 aa22.94■■□□□ 1.26
ABCD4-202ENST00000460308 LRRTM3Q86VH5 581 aa22.94■■□□□ 1.26
ABCD4-202ENST00000460308 MLKLQ8NB16 471 aa22.94■■□□□ 1.26
ABCD4-202ENST00000460308 CCDC150Q8NCX0 1101 aa22.94■■□□□ 1.26
ABCD4-202ENST00000460308 OR6B3Q8NGW1 331 aa22.94■■□□□ 1.26
ABCD4-202ENST00000460308 GPT2Q8TD30 523 aa22.94■■□□□ 1.26
ABCD4-202ENST00000460308 TAF4BQ92750 862 aa22.94■■□□□ 1.26
ABCD4-202ENST00000460308 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
ABCD4-202ENST00000460308 VRTNQ9H8Y1 702 aa22.94■■□□□ 1.26
ABCD4-202ENST00000460308 TMEM8AQ9HCN3 771 aa22.94■■□□□ 1.26
ABCD4-202ENST00000460308 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa22.94■■□□□ 1.26
ABCD4-202ENST00000460308 DOCK6Q96HP0 2047 aa22.93■■□□□ 1.26
ABCD4-202ENST00000460308 C2CD4DB7Z1M9 353 aa22.93■■□□□ 1.26
ABCD4-202ENST00000460308 TACC1O75410 805 aa22.93■■□□□ 1.26
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ABCD4-202ENST00000460308 FSHRP23945 695 aa22.93■■□□□ 1.26
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ABCD4-202ENST00000460308 TUFMP49411 452 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
ABCD4-202ENST00000460308 EPHB3P54753 998 aa22.93■■□□□ 1.26
ABCD4-202ENST00000460308 MGAT5BQ3V5L5 792 aa22.93■■□□□ 1.26
ABCD4-202ENST00000460308 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
ABCD4-202ENST00000460308 LIMS2Q7Z4I7 341 aa22.93■■□□□ 1.26
ABCD4-202ENST00000460308 FRMD5Q7Z6J6 570 aa22.93■■□□□ 1.26
ABCD4-202ENST00000460308 RNF135Q8IUD6 432 aa22.93■■□□□ 1.26
ABCD4-202ENST00000460308 SPPL2BQ8TCT7 592 aa22.93■■□□□ 1.26
ABCD4-202ENST00000460308 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa22.93■■□□□ 1.26
ABCD4-202ENST00000460308 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
ABCD4-202ENST00000460308 HSFX1Q9UBD0 423 aa22.93■■□□□ 1.26
ABCD4-202ENST00000460308 CDH9Q9ULB4 789 aa22.93■■□□□ 1.26
ABCD4-202ENST00000460308 YIPF1Q9Y548 306 aa22.93■■□□□ 1.26
ABCD4-202ENST00000460308 VNN2O95498 520 aa22.92■■□□□ 1.26
ABCD4-202ENST00000460308 MBD3O95983 291 aa22.92■■□□□ 1.26
ABCD4-202ENST00000460308 PDGFRBP09619 1106 aa22.92■■□□□ 1.26
ABCD4-202ENST00000460308 MXI1P50539 228 aa22.92■■□□□ 1.26
ABCD4-202ENST00000460308 CDR1P51861 262 aa22.92■■□□□ 1.26
ABCD4-202ENST00000460308 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
ABCD4-202ENST00000460308 NTHL1P78549 312 aa22.92■■□□□ 1.26
ABCD4-202ENST00000460308 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
ABCD4-202ENST00000460308 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
ABCD4-202ENST00000460308 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
ABCD4-202ENST00000460308 SYT15Q9BQS2 421 aa22.92■■□□□ 1.26
ABCD4-202ENST00000460308 CORO1BQ9BR76 489 aa22.92■■□□□ 1.26
ABCD4-202ENST00000460308 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
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ABCD4-202ENST00000460308 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP22.92■■□□□ 1.26
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ABCD4-202ENST00000460308 GTF3C4Q9UKN8 822 aa22.92■■□□□ 1.26
ABCD4-202ENST00000460308 CUL9Q8IWT3 2517 aa22.92■■□□□ 1.26
ABCD4-202ENST00000460308 C5orf42Q9H799 3197 aa22.91■■□□□ 1.26
ABCD4-202ENST00000460308 GNA14O95837 355 aa22.91■■□□□ 1.26
ABCD4-202ENST00000460308 LMO2P25791 158 aa22.91■■□□□ 1.26
ABCD4-202ENST00000460308 CYP4A22Q5TCH4 519 aa22.91■■□□□ 1.26
ABCD4-202ENST00000460308 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa22.91■■□□□ 1.26
ABCD4-202ENST00000460308 FAM200AQ8TCP9 573 aa22.91■■□□□ 1.26
ABCD4-202ENST00000460308 TAS1R2Q8TE23 839 aa22.91■■□□□ 1.26
ABCD4-202ENST00000460308 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
ABCD4-202ENST00000460308 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa22.91■■□□□ 1.26
ABCD4-202ENST00000460308 DACH1Q9UI36 760 aa22.91■■□□□ 1.26
ABCD4-202ENST00000460308 RWDD2AQ9UIY3 292 aa22.91■■□□□ 1.26
ABCD4-202ENST00000460308 DENND4AQ7Z401 1863 aa22.9■■□□□ 1.26
ABCD4-202ENST00000460308 A8MXQ7 604 aa22.9■■□□□ 1.26
ABCD4-202ENST00000460308 HCRTO43612 131 aa22.9■■□□□ 1.26
ABCD4-202ENST00000460308 ASS1P00966 412 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
ABCD4-202ENST00000460308 RHOP08100 348 aa22.9■■□□□ 1.26
ABCD4-202ENST00000460308 NLRP12P59046 1061 aa22.9■■□□□ 1.26
ABCD4-202ENST00000460308 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
ABCD4-202ENST00000460308 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa22.9■■□□□ 1.26
ABCD4-202ENST00000460308 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
ABCD4-202ENST00000460308 ELMO3Q96BJ8 720 aa22.9■■□□□ 1.26
ABCD4-202ENST00000460308 PI4K2AQ9BTU6 479 aa22.9■■□□□ 1.26
ABCD4-202ENST00000460308 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP22.9■■□□□ 1.26
ABCD4-202ENST00000460308 TMLHEQ9NVH6 421 aa22.9■■□□□ 1.26
ABCD4-202ENST00000460308 LIMD1Q9UGP4 676 aa22.9■■□□□ 1.26
ABCD4-202ENST00000460308 ALADP13716 330 aa22.89■■□□□ 1.25
ABCD4-202ENST00000460308 CDH8P55286 799 aa22.89■■□□□ 1.25
ABCD4-202ENST00000460308 VEPH1Q14D04 833 aa22.89■■□□□ 1.25
ABCD4-202ENST00000460308 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
ABCD4-202ENST00000460308 C4orf50Q6ZRC1 276 aa22.89■■□□□ 1.25
ABCD4-202ENST00000460308 ITIH5Q86UX2 942 aa22.89■■□□□ 1.25
ABCD4-202ENST00000460308 TTC9BQ8N6N2 239 aa22.89■■□□□ 1.25
ABCD4-202ENST00000460308 FBXL13Q8NEE6 735 aa22.89■■□□□ 1.25
ABCD4-202ENST00000460308 SMYD3Q9H7B4 428 aa22.89■■□□□ 1.25
ABCD4-202ENST00000460308 CEP72Q9P209 647 aa22.89■■□□□ 1.25
ABCD4-202ENST00000460308 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
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