RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000454741.5

TTC28-AS1-219, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TTC28-AS1, Length 5,064 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-219ENST00000454741 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-219ENST00000454741 PHF20L1A8MW92 1017 aa15.92■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-219ENST00000454741 CYP2C9P11712 490 aa15.92■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-219ENST00000454741 GARTP22102 1010 aa15.92■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-219ENST00000454741 TAF6P49848 677 aa15.92■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-219ENST00000454741 TNIP2Q8NFZ5 429 aa15.92■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-219ENST00000454741 CYFIP2Q96F07 1278 aa15.92■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-219ENST00000454741 HPDLQ96IR7 371 aa15.92■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-219ENST00000454741 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-219ENST00000454741 PTGER2P43116 358 aa15.92■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-219ENST00000454741 CUL2Q13617 745 aa15.92■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-219ENST00000454741 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa15.92■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-219ENST00000454741 SYTL3Q4VX76 610 aa15.92■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-219ENST00000454741 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-219ENST00000454741 C5orf58C9J3I9 102 aa15.92■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-219ENST00000454741 OGTO15294 1046 aa15.92■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-219ENST00000454741 ICAM1P05362 532 aa15.92■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-219ENST00000454741 DPEP1P16444 411 aa15.92■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-219ENST00000454741 AGR3Q8TD06 166 aa15.92■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-219ENST00000454741 TRPC5OSA6NMA1 111 aa15.91■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-219ENST00000454741 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-219ENST00000454741 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-219ENST00000454741 PLA2G4AP47712 749 aa15.91■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-219ENST00000454741 WASHC5Q12768 1159 aa15.91■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-219ENST00000454741 SREBF2Q12772 1141 aa15.91■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-219ENST00000454741 EFCAB12Q6NXP0 572 aa15.91■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-219ENST00000454741 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-219ENST00000454741 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-219ENST00000454741 FAM200BP0CF97 657 aa15.91■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-219ENST00000454741 BTNL9Q6UXG8 535 aa15.91■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-219ENST00000454741 EME1Q96AY2 570 aa15.91■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-219ENST00000454741 FAR2Q96K12 515 aa15.91■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-219ENST00000454741 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-219ENST00000454741 MANSC1Q9H8J5 431 aa15.91■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-219ENST00000454741 LATS2Q9NRM7 1088 aa15.91■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-219ENST00000454741 HPSEQ9Y251 543 aa15.91■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-219ENST00000454741 CETPP11597 493 aa15.91■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-219ENST00000454741 MCL1Q07820 350 aa15.91■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-219ENST00000454741 DGKDQ16760 1214 aa15.91■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-219ENST00000454741 LVRNQ6Q4G3 990 aa15.91■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-219ENST00000454741 VPS37AQ8NEZ2 397 aa15.91■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-219ENST00000454741 TMC2Q8TDI7 906 aa15.91■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-219ENST00000454741 DTNBP1Q96EV8 351 aa15.91■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-219ENST00000454741 NSL1Q96IY1 281 aa15.91■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-219ENST00000454741 NRXN1Q9ULB1 1477 aa15.91■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-219ENST00000454741 MSH4O15457 936 aa15.91■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-219ENST00000454741 PDGFRBP09619 1106 aa15.91■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-219ENST00000454741 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-219ENST00000454741 PTGISQ16647 500 aa15.91■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-219ENST00000454741 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-219ENST00000454741 TRIM65Q6PJ69 517 aa15.91■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-219ENST00000454741 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-219ENST00000454741 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-219ENST00000454741 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-219ENST00000454741 MTFR1LQ9H019 292 aa15.91■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-219ENST00000454741 GGA3Q9NZ52 723 aa15.91■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-219ENST00000454741 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa15.91■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-219ENST00000454741 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-219ENST00000454741 IQSEC2Q5JU85 1478 aa15.9■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-219ENST00000454741 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-219ENST00000454741 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP15.9■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-219ENST00000454741 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-219ENST00000454741 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-219ENST00000454741 F9P00740 461 aa15.9■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-219ENST00000454741 YAF2Q8IY57 180 aa15.9■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-219ENST00000454741 THAP11Q96EK4 314 aa15.9■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-219ENST00000454741 RBBP8Q99708 897 aa15.9■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-219ENST00000454741 KBTBD4Q9NVX7 518 aa15.9■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-219ENST00000454741 B2RBV5 119 aa15.9■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-219ENST00000454741 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-219ENST00000454741 ITPK1Q13572 414 aa15.9■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-219ENST00000454741 SLC29A2Q14542 456 aa15.9■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-219ENST00000454741 PDK2Q15119 407 aa15.9■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-219ENST00000454741 KDM7AQ6ZMT4 941 aa15.9■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-219ENST00000454741 REXO1L1PQ8IX06 675 aa15.9■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-219ENST00000454741 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa15.9■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-219ENST00000454741 SLC7A14Q8TBB6 771 aa15.9■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-219ENST00000454741 SLITRK1Q96PX8 696 aa15.9■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-219ENST00000454741 TBC1D4O60343 1298 aa15.9■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-219ENST00000454741 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-219ENST00000454741 HSPA13P48723 471 aa15.9■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-219ENST00000454741 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-219ENST00000454741 GRB10Q13322 594 aa15.9■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-219ENST00000454741 ARHGEF7Q14155 803 aa15.9■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-219ENST00000454741 FAM83EQ2M2I3 478 aa15.9■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-219ENST00000454741 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa15.9■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-219ENST00000454741 IL31Q6EBC2 164 aa15.9■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-219ENST00000454741 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-219ENST00000454741 LRRC6Q86X45 466 aa15.9■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-219ENST00000454741 CLEC10AQ8IUN9 316 aa15.9■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-219ENST00000454741 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa15.9■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-219ENST00000454741 CCDC126Q96EE4 140 aa15.9■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-219ENST00000454741 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-219ENST00000454741 SH2D3AQ9BRG2 576 aa15.9■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-219ENST00000454741 DIP2AQ14689 1571 aa15.9■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-219ENST00000454741 E9PCH4 1651 aa15.9■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-219ENST00000454741 TGFB2P61812 414 aa15.9■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-219ENST00000454741 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-219ENST00000454741 STX5Q13190 355 aa15.9■□□□□ 0.14
TTC28-AS1-219ENST00000454741 DCAF6Q58WW2 860 aa15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.1 ms