RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442563.5

RABGEF1-204, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 4

Gene RABGEF1, Length 553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-204ENST00000442563 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP18.06■□□□□ 0.48
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RABGEF1-204ENST00000442563 CCL16O15467 120 aa18.05■□□□□ 0.48
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RABGEF1-204ENST00000442563 P4HA1P13674 534 aa18.05■□□□□ 0.48
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RABGEF1-204ENST00000442563 PLD1Q13393 1074 aa18.05■□□□□ 0.48
RABGEF1-204ENST00000442563 SLC39A12Q504Y0 691 aa18.05■□□□□ 0.48
RABGEF1-204ENST00000442563 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP18.05■□□□□ 0.48
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RABGEF1-204ENST00000442563 NLRP12P59046 1061 aa18.04■□□□□ 0.48
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RABGEF1-204ENST00000442563 POLIQ9UNA4 740 aa18.04■□□□□ 0.48
RABGEF1-204ENST00000442563 COQ4Q9Y3A0 265 aa18.04■□□□□ 0.48
RABGEF1-204ENST00000442563 ASB3Q9Y575 518 aa18.04■□□□□ 0.48
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RABGEF1-204ENST00000442563 MICAL2O94851 1124 aa18.02■□□□□ 0.48
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RABGEF1-204ENST00000442563 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP18.01■□□□□ 0.47
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RABGEF1-204ENST00000442563 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP18.01■□□□□ 0.47
RABGEF1-204ENST00000442563 EPS15L1Q9UBC2 864 aa18.01■□□□□ 0.47
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