RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437713.5

TTC28-AS1-216, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TTC28-AS1, Length 854 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-216ENST00000437713 PLD1Q13393 1074 aa8.75□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ADAM9Q13443 819 aa8.75□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-216ENST00000437713 STIM1Q13586 685 aa8.75□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-216ENST00000437713 CENPPQ6IPU0 288 aa8.75□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-216ENST00000437713 FOXR2Q6PJQ5 311 aa8.75□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-216ENST00000437713 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa8.75□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-216ENST00000437713 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-216ENST00000437713 RNF135Q8IUD6 432 aa8.75□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-216ENST00000437713 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ELMOD1Q8N336 334 aa8.75□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TOP6BLQ8N6T0 577 aa8.75□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-216ENST00000437713 LEMD2Q8NC56 503 aa8.75□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-216ENST00000437713 OR5B17Q8NGF7 314 aa8.75□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SLC7A14Q8TBB6 771 aa8.75□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-216ENST00000437713 CCDC127Q96BQ5 260 aa8.75□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-216ENST00000437713 HPDLQ96IR7 371 aa8.75□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ACBD6Q9BR61 282 aa8.75□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-216ENST00000437713 MKNK1Q9BUB5 465 aa8.75□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-216ENST00000437713 MTMR12Q9C0I1 747 aa8.75□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-216ENST00000437713 CYP4F11Q9HBI6 524 aa8.75□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SIX4Q9UIU6 781 aa8.75□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ASB3Q9Y575 518 aa8.75□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-216ENST00000437713 XIRP2A4UGR9 3374 aa8.75□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-216ENST00000437713 PRRG1O14668 218 aa8.74□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-216ENST00000437713 CETN3O15182 167 aa8.74□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-216ENST00000437713 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-216ENST00000437713 MICAL2O94851 1124 aa8.74□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-216ENST00000437713 WEE2P0C1S8 567 aa8.74□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-216ENST00000437713 NR2F2P24468 414 aa8.74□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-216ENST00000437713 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-216ENST00000437713 MYL7Q01449 175 aa8.74□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TSPY1Q01534 308 aa8.74□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-216ENST00000437713 LRRC63Q05C16 580 aa8.74□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ADCY1Q08828 1119 aa8.74□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-216ENST00000437713 BFSP1Q12934 665 aa8.74□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TRPC3Q13507 836 aa8.74□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-216ENST00000437713 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ZCWPW2Q504Y3 356 aa8.74□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-216ENST00000437713 WSCD1Q658N2 575 aa8.74□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-216ENST00000437713 LIMS2Q7Z4I7 341 aa8.74□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-216ENST00000437713 PDCL2Q8N4E4 241 aa8.74□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SPPL2BQ8TCT7 592 aa8.74□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-216ENST00000437713 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TSG101Q99816 390 aa8.74□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa8.74□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-216ENST00000437713 VRTNQ9H8Y1 702 aa8.74□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-216ENST00000437713 IGSF9Q9P2J2 1179 aa8.74□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SNX9Q9Y5X1 595 aa8.74□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-216ENST00000437713 PLXNA3P51805 1871 aa8.74□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-216ENST00000437713 CLUHO75153 1309 aa8.74□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SCN1AP35498 2009 aa8.73□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-216ENST00000437713 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-216ENST00000437713 C2CD4DB7Z1M9 353 aa8.73□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ZNF197O14709 1029 aa8.73□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-216ENST00000437713 GABRDO14764 452 aa8.73□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-216ENST00000437713 PSMA7O14818 248 aa8.73□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-216ENST00000437713 GPR37L1O60883 481 aa8.73□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-216ENST00000437713 PHACTR2O75167 634 aa8.73□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TACC1O75410 805 aa8.73□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SEC24AO95486 1093 aa8.73□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-216ENST00000437713 CST3P01034 146 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-216ENST00000437713 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-216ENST00000437713 KRT13P13646 458 aa8.73□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-216ENST00000437713 FSHRP23945 695 aa8.73□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-216ENST00000437713 PCSK1P29120 753 aa8.73□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-216ENST00000437713 GTF2H1P32780 548 aa8.73□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-216ENST00000437713 CLCN1P35523 988 aa8.73□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-216ENST00000437713 PRCPP42785 496 aa8.73□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ALDH1A3P47895 512 aa8.73□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-216ENST00000437713 CASP4P49662 377 aa8.73□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-216ENST00000437713 EPHB3P54753 998 aa8.73□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-216ENST00000437713 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-216ENST00000437713 DUSP4Q13115 394 aa8.73□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa8.73□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-216ENST00000437713 CEP135Q66GS9 1140 aa8.73□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-216ENST00000437713 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-216ENST00000437713 IQCEQ6IPM2 695 aa8.73□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-216ENST00000437713 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa8.73□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-216ENST00000437713 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-216ENST00000437713 UBALD2Q8IYN6 164 aa8.73□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ADSSL1Q8N142 457 aa8.73□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TMEM130Q8N3G9 435 aa8.73□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TRIML1Q8N9V2 468 aa8.73□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TAF4BQ92750 862 aa8.73□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-216ENST00000437713 EDAQ92838 391 aa8.73□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-216ENST00000437713 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-216ENST00000437713 PHOX2BQ99453 314 aa8.73□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-216ENST00000437713 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-216ENST00000437713 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-216ENST00000437713 EPS15L1Q9UBC2 864 aa8.73□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-216ENST00000437713 L1RE1Q9UN81 338 aa8.73□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-216ENST00000437713 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa8.73□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-216ENST00000437713 INSL5Q9Y5Q6 135 aa8.73□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-216ENST00000437713 BDP1A6H8Y1 2624 aa8.73□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-216ENST00000437713 PTPRJQ12913 1337 aa8.73□□□□□ -1.01
TTC28-AS1-216ENST00000437713 MTMR11A4FU01 709 aa8.72□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.4 ms