RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435136.6

SH3BP2-202, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene SH3BP2, Length 2,318 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-202ENST00000435136 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP19.75■□□□□ 0.75
SH3BP2-202ENST00000435136 WDR72Q3MJ13 1102 aa19.75■□□□□ 0.75
SH3BP2-202ENST00000435136 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa19.75■□□□□ 0.75
SH3BP2-202ENST00000435136 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP19.75■□□□□ 0.75
SH3BP2-202ENST00000435136 ERICH1Q86X53 443 aa19.75■□□□□ 0.75
SH3BP2-202ENST00000435136 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP19.75■□□□□ 0.75
SH3BP2-202ENST00000435136 FAM76AQ8TAV0 307 aa19.75■□□□□ 0.75
SH3BP2-202ENST00000435136 TFAP2BQ92481 460 aa19.75■□□□□ 0.75
SH3BP2-202ENST00000435136 FMO2Q99518 471 aa19.75■□□□□ 0.75
SH3BP2-202ENST00000435136 NEUROG2Q9H2A3 272 aa19.75■□□□□ 0.75
SH3BP2-202ENST00000435136 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa19.75■□□□□ 0.75
SH3BP2-202ENST00000435136 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP19.75■□□□□ 0.75
SH3BP2-202ENST00000435136 KIAA1257Q9ULG3 409 aa19.75■□□□□ 0.75
SH3BP2-202ENST00000435136 HAS3O00219 553 aa19.75■□□□□ 0.75
SH3BP2-202ENST00000435136 PPFIA2O75334 1257 aa19.75■□□□□ 0.75
SH3BP2-202ENST00000435136 CPT1AP50416 773 aa19.75■□□□□ 0.75
SH3BP2-202ENST00000435136 INCA1Q0VD86 236 aa19.75■□□□□ 0.75
SH3BP2-202ENST00000435136 TTC27Q6P3X3 843 aa19.75■□□□□ 0.75
SH3BP2-202ENST00000435136 TMC3Q7Z5M5 1100 aa19.75■□□□□ 0.75
SH3BP2-202ENST00000435136 GRK7Q8WTQ7 553 aa19.75■□□□□ 0.75
SH3BP2-202ENST00000435136 SOCS4Q8WXH5 440 aa19.75■□□□□ 0.75
SH3BP2-202ENST00000435136 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP19.75■□□□□ 0.75
SH3BP2-202ENST00000435136 TXLNGYQ9BZA5 131 aa19.75■□□□□ 0.75
SH3BP2-202ENST00000435136 CCDC85CA6NKD9 419 aa19.74■□□□□ 0.75
SH3BP2-202ENST00000435136 A6NNZ2 444 aa19.74■□□□□ 0.75
SH3BP2-202ENST00000435136 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP19.74■□□□□ 0.75
SH3BP2-202ENST00000435136 GPR32O75388 356 aa19.74■□□□□ 0.75
SH3BP2-202ENST00000435136 IGHA2P01877 340 aa19.74■□□□□ 0.75
SH3BP2-202ENST00000435136 HOXD10P28358 340 aa19.74■□□□□ 0.75
SH3BP2-202ENST00000435136 HSD17B3P37058 310 aa19.74■□□□□ 0.75
SH3BP2-202ENST00000435136 TUBB8Q3ZCM7 444 aa19.74■□□□□ 0.75
SH3BP2-202ENST00000435136 SLC27A1Q6PCB7 646 aa19.74■□□□□ 0.75
SH3BP2-202ENST00000435136 TLK2Q86UE8 772 aa19.74■□□□□ 0.75
SH3BP2-202ENST00000435136 WDTC1Q8N5D0 677 aa19.74■□□□□ 0.75
SH3BP2-202ENST00000435136 SH3TC2Q8TF17 1288 aa19.74■□□□□ 0.75
SH3BP2-202ENST00000435136 FNIP1Q8TF40 1166 aa19.74■□□□□ 0.75
SH3BP2-202ENST00000435136 KAT2BQ92831 832 aa19.74■□□□□ 0.75
SH3BP2-202ENST00000435136 DPH5Q9H2P9 285 aa19.74■□□□□ 0.75
SH3BP2-202ENST00000435136 SETD4Q9NVD3 440 aa19.74■□□□□ 0.75
SH3BP2-202ENST00000435136 RGS2P41220 211 aa19.74■□□□□ 0.75
SH3BP2-202ENST00000435136 SGO2Q562F6 1265 aa19.74■□□□□ 0.75
SH3BP2-202ENST00000435136 HPDLQ96IR7 371 aa19.74■□□□□ 0.75
SH3BP2-202ENST00000435136 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP19.74■□□□□ 0.75
SH3BP2-202ENST00000435136 KATNAL1Q9BW62 490 aa19.74■□□□□ 0.75
SH3BP2-202ENST00000435136 DPP3Q9NY33 737 aa19.74■□□□□ 0.75
SH3BP2-202ENST00000435136 ECEL1O95672 775 aa19.73■□□□□ 0.75
SH3BP2-202ENST00000435136 VDRP11473 427 aa19.73■□□□□ 0.75
SH3BP2-202ENST00000435136 PTPN7P35236 360 aa19.73■□□□□ 0.75
SH3BP2-202ENST00000435136 COPS2P61201 443 aa19.73■□□□□ 0.75
SH3BP2-202ENST00000435136 ADAM17P78536 824 aa19.73■□□□□ 0.75
SH3BP2-202ENST00000435136 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP19.73■□□□□ 0.75
SH3BP2-202ENST00000435136 MFSD10Q14728 455 aa19.73■□□□□ 0.75
SH3BP2-202ENST00000435136 LLGL2Q6P1M3 1020 aa19.73■□□□□ 0.75
SH3BP2-202ENST00000435136 CCDC105Q8IYK2 499 aa19.73■□□□□ 0.75
SH3BP2-202ENST00000435136 RCOR2Q8IZ40 523 aa19.73■□□□□ 0.75
SH3BP2-202ENST00000435136 TMEM176AQ96HP8 235 aa19.73■□□□□ 0.75
SH3BP2-202ENST00000435136 SDCBP2Q9H190 292 aa19.73■□□□□ 0.75
SH3BP2-202ENST00000435136 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa19.73■□□□□ 0.75
SH3BP2-202ENST00000435136 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP19.73■□□□□ 0.75
SH3BP2-202ENST00000435136 MYCP01106 439 aaPredicted RBP19.73■□□□□ 0.75
SH3BP2-202ENST00000435136 HMGCRP04035 888 aa19.73■□□□□ 0.75
SH3BP2-202ENST00000435136 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP19.73■□□□□ 0.75
SH3BP2-202ENST00000435136 STILQ15468 1287 aa19.73■□□□□ 0.75
SH3BP2-202ENST00000435136 ZNF394Q53GI3 561 aa19.73■□□□□ 0.75
SH3BP2-202ENST00000435136 C2CD6Q53TS8 623 aa19.73■□□□□ 0.75
SH3BP2-202ENST00000435136 NOTUMQ6P988 496 aa19.73■□□□□ 0.75
SH3BP2-202ENST00000435136 SLC4A11Q8NBS3 891 aa19.73■□□□□ 0.75
SH3BP2-202ENST00000435136 RAET1EQ8TD07 263 aa19.73■□□□□ 0.75
SH3BP2-202ENST00000435136 PPP1R16BQ96T49 567 aa19.73■□□□□ 0.75
SH3BP2-202ENST00000435136 APBA2Q99767 749 aa19.73■□□□□ 0.75
SH3BP2-202ENST00000435136 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP19.73■□□□□ 0.75
SH3BP2-202ENST00000435136 CD19P15391 556 aa19.72■□□□□ 0.75
SH3BP2-202ENST00000435136 GYS2P54840 703 aa19.72■□□□□ 0.75
SH3BP2-202ENST00000435136 TAS2R40P59535 323 aa19.72■□□□□ 0.75
SH3BP2-202ENST00000435136 EMC10Q5UCC4 262 aa19.72■□□□□ 0.75
SH3BP2-202ENST00000435136 DENND1BQ6P3S1 775 aa19.72■□□□□ 0.75
SH3BP2-202ENST00000435136 SMYD3Q9H7B4 428 aa19.72■□□□□ 0.75
SH3BP2-202ENST00000435136 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP19.72■□□□□ 0.75
SH3BP2-202ENST00000435136 GRHL1Q9NZI5 618 aa19.72■□□□□ 0.75
SH3BP2-202ENST00000435136 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP19.72■□□□□ 0.75
SH3BP2-202ENST00000435136 AGAP1Q9UPQ3 857 aa19.72■□□□□ 0.75
SH3BP2-202ENST00000435136 PLAAQ9Y263 795 aa19.72■□□□□ 0.75
SH3BP2-202ENST00000435136 SIGLEC16A6NMB1 481 aa19.71■□□□□ 0.75
SH3BP2-202ENST00000435136 DARSP14868 501 aaKnown RBP19.71■□□□□ 0.75
SH3BP2-202ENST00000435136 ELNP15502 786 aa19.71■□□□□ 0.75
SH3BP2-202ENST00000435136 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP19.71■□□□□ 0.75
SH3BP2-202ENST00000435136 PSEN2P49810 448 aa19.71■□□□□ 0.75
SH3BP2-202ENST00000435136 MYO1EQ12965 1108 aa19.71■□□□□ 0.75
SH3BP2-202ENST00000435136 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP19.71■□□□□ 0.75
SH3BP2-202ENST00000435136 CNGA2Q16280 664 aa19.71■□□□□ 0.75
SH3BP2-202ENST00000435136 DCUN1D2Q6PH85 259 aa19.71■□□□□ 0.75
SH3BP2-202ENST00000435136 ZDHHC24Q6UX98 284 aa19.71■□□□□ 0.75
SH3BP2-202ENST00000435136 POLNQ7Z5Q5 900 aa19.71■□□□□ 0.75
SH3BP2-202ENST00000435136 SNX27Q96L92 541 aa19.71■□□□□ 0.75
SH3BP2-202ENST00000435136 MIS12Q9H081 205 aa19.71■□□□□ 0.75
SH3BP2-202ENST00000435136 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP19.71■□□□□ 0.75
SH3BP2-202ENST00000435136 H0YGN5 161 aa19.71■□□□□ 0.75
SH3BP2-202ENST00000435136 CYP2C9P11712 490 aa19.71■□□□□ 0.75
SH3BP2-202ENST00000435136 GABRB2P47870 512 aa19.71■□□□□ 0.75
SH3BP2-202ENST00000435136 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP19.71■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.4 ms