RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000430766.1

PTPRD-AS1-201, PTPRD antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRD-AS1, Length 1,959 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 NDUFS2O75306 463 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MT-CO3P00414 261 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 DRD2P14416 443 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 GABRG2P18507 467 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CLCA4Q14CN2 919 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 GAREM2Q75VX8 874 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CUL5Q93034 780 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 FAM167AQ96KS9 214 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MDFIQ99750 246 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TASP1Q9H6P5 420 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 STAB1Q9NY15 2570 aa9.49□□□□□ -0.89
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MEI4A8MW99 385 aa9.49□□□□□ -0.89
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MEIS2O14770 477 aa9.49□□□□□ -0.89
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 GJB6O95452 261 aa9.49□□□□□ -0.89
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ST3GAL1Q11201 340 aa9.49□□□□□ -0.89
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ESPL1Q14674 2120 aa9.49□□□□□ -0.89
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 KBTBD3Q8NAB2 608 aa9.49□□□□□ -0.89
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 IGSF8Q969P0 613 aa9.49□□□□□ -0.89
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MARVELD3Q96A59 401 aa9.49□□□□□ -0.89
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PRIMPOLQ96LW4 560 aa9.49□□□□□ -0.89
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa9.49□□□□□ -0.89
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa9.49□□□□□ -0.89
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CYP8B1Q9UNU6 501 aa9.49□□□□□ -0.89
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 FOXP2O15409 715 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MTSS1O43312 755 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ADAM23O75077 832 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CYP4A11Q02928 519 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 KIF19Q2TAC6 998 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CATIPQ7Z7H3 387 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 HOMER1Q86YM7 354 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 STAG2Q8N3U4 1231 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ARHGAP45Q92619 1136 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ATXN3LQ9H3M9 355 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 HES2Q9Y543 173 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SNX11Q9Y5W9 270 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CSPG4Q6UVK1 2322 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CASTOR2A6NHX0 329 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 FGF19O95750 216 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PRKCGP05129 697 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MORC3Q14149 939 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TIPARPQ7Z3E1 657 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 C1orf216Q8TAB5 229 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PIGSQ96S52 555 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MXRA8Q9BRK3 442 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 KAT14Q9H8E8 782 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 DENND4CQ5VZ89 1909 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 KLRF2D3W0D1 207 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TKTP29401 623 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 KIF5BP33176 963 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 DNAJC25Q9H1X3 360 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ECHDC1Q9NTX5 307 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.89
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 WDR64B1ANS9 1081 aa9.46□□□□□ -0.89
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 H0Y8X5 98 aa9.46□□□□□ -0.89
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa9.46□□□□□ -0.89
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 GNLYP22749 145 aa9.46□□□□□ -0.89
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TIE1P35590 1138 aa9.46□□□□□ -0.89
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 OPRD1P41143 372 aa9.46□□□□□ -0.89
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SART3Q15020 963 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.89
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa9.46□□□□□ -0.89
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 FUCA2Q9BTY2 467 aa9.46□□□□□ -0.89
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.89
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 KIF9Q9HAQ2 790 aa9.46□□□□□ -0.89
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 IFT122Q9HBG6 1241 aa9.46□□□□□ -0.89
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TUBD1Q9UJT1 453 aa9.46□□□□□ -0.89
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PHTF1Q9UMS5 762 aa9.46□□□□□ -0.89
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 YIPF1Q9Y548 306 aa9.46□□□□□ -0.89
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa9.46□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 USP12O75317 370 aa9.46□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ARPP19P56211 112 aa9.46□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PLD1Q13393 1074 aa9.46□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SLC35G1Q2M3R5 365 aa9.46□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 HACE1Q8IYU2 909 aa9.46□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RIN3Q8TB24 985 aa9.46□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CCDC51Q96ER9 411 aa9.46□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TMEM245Q9H330 911 aa9.46□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RIOX1Q9H6W3 641 aa9.46□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ZMYM5Q9UJ78 669 aa9.46□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 JMJD1CQ15652 2540 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 GABRR2P28476 465 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 E2F1Q01094 437 aa9.45□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.4 ms