RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427658.1

AFG3L1P-208, Transcript of AFG3 like matrix AAA peptidase subunit 1, pseudogene, human

TSL 2

Gene AFG3L1P, Length 2,758 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AFG3L1P-208	ENST00000427658	FAM47E-STBD1	D6RA91	191 aa		10.99	□□□□□ -0.65
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CYP26A1	O43174	497 aa		10.99	□□□□□ -0.65
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PRKAB2	O43741	272 aa		10.99	□□□□□ -0.65
AFG3L1P-208	ENST00000427658	C6orf222	P0C671	652 aa	Predicted RBP	10.99	□□□□□ -0.65
AFG3L1P-208	ENST00000427658	RBP3	P10745	1247 aa		10.99	□□□□□ -0.65
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SCG2	P13521	617 aa		10.99	□□□□□ -0.65
AFG3L1P-208	ENST00000427658	UCHL3	P15374	230 aa		10.99	□□□□□ -0.65
AFG3L1P-208	ENST00000427658	FGFR2	P21802	821 aa		10.99	□□□□□ -0.65
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PON1	P27169	355 aa		10.99	□□□□□ -0.65
AFG3L1P-208	ENST00000427658	NCKAP1L	P55160	1127 aa		10.99	□□□□□ -0.65
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PDAP1	Q13442	181 aa	Known RBP	10.99	□□□□□ -0.65
AFG3L1P-208	ENST00000427658	EFTUD2	Q15029	972 aa	Known RBP eCLIP	10.99	□□□□□ -0.65
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CLUL1	Q15846	466 aa		10.99	□□□□□ -0.65
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ARL13B	Q3SXY8	428 aa		10.99	□□□□□ -0.65
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ARSH	Q5FYA8	562 aa		10.99	□□□□□ -0.65
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SPTY2D1	Q68D10	685 aa	Predicted RBP	10.99	□□□□□ -0.65
AFG3L1P-208	ENST00000427658	DDX51	Q8N8A6	666 aa	Known RBP eCLIP	10.99	□□□□□ -0.65
AFG3L1P-208	ENST00000427658	RNF169	Q8NCN4	708 aa		10.99	□□□□□ -0.65
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ICA1L	Q8NDH6	482 aa		10.99	□□□□□ -0.65
AFG3L1P-208	ENST00000427658	DDX12P	Q92771	950 aa		10.99	□□□□□ -0.65
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TSG101	Q99816	390 aa		10.99	□□□□□ -0.65
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PLK2	Q9NYY3	685 aa		10.99	□□□□□ -0.65
AFG3L1P-208	ENST00000427658	RSL24D1	Q9UHA3	163 aa	Known RBP	10.99	□□□□□ -0.65
AFG3L1P-208	ENST00000427658	IVNS1ABP	Q9Y6Y0	642 aa		10.99	□□□□□ -0.65
AFG3L1P-208	ENST00000427658	IQCA1L	A6NCM1	817 aa		10.99	□□□□□ -0.65
AFG3L1P-208	ENST00000427658		K7EPI3	171 aa		10.99	□□□□□ -0.65
AFG3L1P-208	ENST00000427658	FOXD2	O60548	495 aa	Predicted RBP	10.99	□□□□□ -0.65
AFG3L1P-208	ENST00000427658	STAMBP	O95630	424 aa		10.99	□□□□□ -0.65
AFG3L1P-208	ENST00000427658	THRA	P10827	490 aa		10.99	□□□□□ -0.65
AFG3L1P-208	ENST00000427658	HSPA6	P17066	643 aa		10.99	□□□□□ -0.65
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CDH3	P22223	829 aa		10.99	□□□□□ -0.65
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PPARG	P37231	505 aa	Predicted RBP	10.99	□□□□□ -0.65
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MARCKSL1	P49006	195 aa		10.99	□□□□□ -0.65
AFG3L1P-208	ENST00000427658	RPL26	P61254	145 aa	Known RBP	10.99	□□□□□ -0.65
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CDK16	Q00536	496 aa		10.99	□□□□□ -0.65
AFG3L1P-208	ENST00000427658	GRAP	Q13588	217 aa		10.99	□□□□□ -0.65
AFG3L1P-208	ENST00000427658	GK3P	Q14409	553 aa		10.99	□□□□□ -0.65
AFG3L1P-208	ENST00000427658	RASA2	Q15283	850 aa		10.99	□□□□□ -0.65
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TRIP10	Q15642	601 aa		10.99	□□□□□ -0.65
AFG3L1P-208	ENST00000427658	DPY19L2P1	Q6NXN4	242 aa		10.99	□□□□□ -0.65
AFG3L1P-208	ENST00000427658	AAGAB	Q6PD74	315 aa		10.99	□□□□□ -0.65
AFG3L1P-208	ENST00000427658	LVRN	Q6Q4G3	990 aa		10.99	□□□□□ -0.65
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TRIM59	Q8IWR1	403 aa		10.99	□□□□□ -0.65
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CENPS	Q8N2Z9	138 aa		10.99	□□□□□ -0.65
AFG3L1P-208	ENST00000427658	LZTR1	Q8N653	840 aa		10.99	□□□□□ -0.65
AFG3L1P-208	ENST00000427658	GRAPL	Q8TC17	118 aa	Predicted RBP	10.99	□□□□□ -0.65
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CEP295NL	Q96MC4	621 aa		10.99	□□□□□ -0.65
AFG3L1P-208	ENST00000427658	BTBD9	Q96Q07	612 aa		10.99	□□□□□ -0.65
AFG3L1P-208	ENST00000427658	RBM15	Q96T37	977 aa	Known RBP eCLIP	10.99	□□□□□ -0.65
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CCDC77	Q9BR77	488 aa		10.99	□□□□□ -0.65
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TMEM120A	Q9BXJ8	343 aa		10.99	□□□□□ -0.65
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TRIM55	Q9BYV6	548 aa		10.99	□□□□□ -0.65
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CEP44	Q9C0F1	390 aa		10.99	□□□□□ -0.65
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MRPL46	Q9H2W6	279 aa	Known RBP	10.99	□□□□□ -0.65
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CNNM1	Q9NRU3	951 aa		10.99	□□□□□ -0.65
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TBC1D23	Q9NUY8	699 aa		10.99	□□□□□ -0.65
AFG3L1P-208	ENST00000427658	IGF2BP1	Q9NZI8	577 aa	Known RBP eCLIP	10.99	□□□□□ -0.65
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SCHIP1	Q9P0W5	487 aa	Predicted RBP	10.99	□□□□□ -0.65
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CAPN8	A6NHC0	703 aa		10.99	□□□□□ -0.65
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SOBP	A7XYQ1	873 aa		10.99	□□□□□ -0.65
AFG3L1P-208	ENST00000427658	GSG1L2	A8MUP6	293 aa		10.99	□□□□□ -0.65
AFG3L1P-208	ENST00000427658	FCHO1	O14526	889 aa		10.99	□□□□□ -0.65
AFG3L1P-208	ENST00000427658	DENR	O43583	198 aa	Known RBP	10.99	□□□□□ -0.65
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PDE8B	O95263	885 aa		10.99	□□□□□ -0.65
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ENO1	P06733	434 aa	Known RBP	10.99	□□□□□ -0.65
AFG3L1P-208	ENST00000427658	FDFT1	P37268	417 aa		10.99	□□□□□ -0.65
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MYBPC1	Q00872	1141 aa		10.99	□□□□□ -0.65
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SNAPC2	Q13487	334 aa		10.99	□□□□□ -0.65
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MTMR2	Q13614	643 aa		10.99	□□□□□ -0.65
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PKN2	Q16513	984 aa	Known RBP	10.99	□□□□□ -0.65
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ZNF394	Q53GI3	561 aa		10.99	□□□□□ -0.65
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PPM1K	Q8N3J5	372 aa		10.99	□□□□□ -0.65
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CCDC24	Q8N4L8	307 aa		10.99	□□□□□ -0.65
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ACTRT2	Q8TDY3	377 aa		10.99	□□□□□ -0.65
AFG3L1P-208	ENST00000427658	RFFL	Q8WZ73	363 aa		10.99	□□□□□ -0.65
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CELF1	Q92879	486 aa	Known RBP	10.99	□□□□□ -0.65
AFG3L1P-208	ENST00000427658	C9orf72	Q96LT7	481 aa		10.99	□□□□□ -0.65
AFG3L1P-208	ENST00000427658	BIRC8	Q96P09	236 aa		10.99	□□□□□ -0.65
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ADAM33	Q9BZ11	813 aa		10.99	□□□□□ -0.65
AFG3L1P-208	ENST00000427658	NMUR2	Q9GZQ4	415 aa		10.99	□□□□□ -0.65
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TMOD2	Q9NZR1	351 aa		10.99	□□□□□ -0.65
AFG3L1P-208	ENST00000427658	WHRN	Q9P202	907 aa		10.99	□□□□□ -0.65
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ALG6	Q9Y672	507 aa		10.99	□□□□□ -0.65
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TCRBV5S4A2T	A0A5A2	114 aa		10.98	□□□□□ -0.65
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MGEA5	O60502	916 aa		10.98	□□□□□ -0.65
AFG3L1P-208	ENST00000427658	DNAJA2	O60884	412 aa		10.98	□□□□□ -0.65
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SLC18A1	P54219	525 aa		10.98	□□□□□ -0.65
AFG3L1P-208	ENST00000427658	NR1H2	P55055	460 aa		10.98	□□□□□ -0.65
AFG3L1P-208	ENST00000427658	STAT4	Q14765	748 aa		10.98	□□□□□ -0.65
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PSMD6	Q15008	389 aa		10.98	□□□□□ -0.65
AFG3L1P-208	ENST00000427658	METTL24	Q5JXM2	366 aa		10.98	□□□□□ -0.65
AFG3L1P-208	ENST00000427658	FASTKD5	Q7L8L6	764 aa	Known RBP	10.98	□□□□□ -0.65
AFG3L1P-208	ENST00000427658	VPS36	Q86VN1	386 aa		10.98	□□□□□ -0.65
AFG3L1P-208	ENST00000427658	EXOC8	Q8IYI6	725 aa		10.98	□□□□□ -0.65
AFG3L1P-208	ENST00000427658	POU5F2	Q8N7G0	328 aa		10.98	□□□□□ -0.65
AFG3L1P-208	ENST00000427658	DDI1	Q8WTU0	396 aa		10.98	□□□□□ -0.65
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TMIGD2	Q96BF3	282 aa		10.98	□□□□□ -0.65
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ANKRD36BP1	Q96IX9	119 aa		10.98	□□□□□ -0.65
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PDGFD	Q9GZP0	370 aa	Predicted RBP	10.98	□□□□□ -0.65
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PAIP1	Q9H074	479 aa	Known RBP	10.98	□□□□□ -0.65

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