RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426333.6

EFTUD2-202, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene EFTUD2, Length 4,548 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-202ENST00000426333 POLBP06746 335 aa11.48□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 KLRC1P26715 233 aa11.48□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 SERPINB1P30740 379 aa11.48□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 WLSQ5T9L3 541 aa11.48□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 BARGINQ6ZT62 677 aa11.48□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 USP49Q70CQ1 688 aa11.48□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 USP38Q8NB14 1042 aa11.48□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 ZFYVE19Q96K21 471 aa11.48□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 MCEEQ96PE7 176 aa11.48□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 CARD9Q9H257 536 aa11.48□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 VPS33BQ9H267 617 aa11.48□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 RSAD1Q9HA92 442 aa11.48□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 STMN3Q9NZ72 180 aa11.48□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa11.48□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 RARBP10826 455 aa11.48□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 BTKQ06187 659 aa11.48□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 DNAJC3Q13217 504 aa11.48□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 MTM1Q13496 603 aa11.48□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 MEI1Q5TIA1 1274 aa11.48□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 PKN3Q6P5Z2 889 aa11.48□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 BTN2A2Q8WVV5 523 aa11.48□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 MED15Q96RN5 788 aa11.48□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 REEP2Q9BRK0 252 aa11.48□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 PKP3Q9Y446 797 aa11.48□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 EVPLLA8MZ36 301 aa11.48□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP11.48□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 MMGT1Q8N4V1 131 aa11.48□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 ATPAF2Q8N5M1 289 aa11.48□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 ANKRD7Q92527 254 aa11.48□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 NSL1Q96IY1 281 aa11.48□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 MYMKA6NI61 221 aa11.47□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 TBX3O15119 743 aa11.47□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 GYPCP04921 128 aa11.47□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 RGS4P49798 205 aa11.47□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 SULT1E1P49888 294 aa11.47□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 TBC1D19Q8N5T2 526 aa11.47□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 APPL2Q8NEU8 664 aa11.47□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 MKNK1Q9BUB5 465 aa11.47□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 ISCA1Q9BUE6 129 aa11.47□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa11.47□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 ATP6V1B1P15313 513 aa11.47□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 PDK1Q15118 436 aa11.47□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 PTGISQ16647 500 aa11.47□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 LRP10Q7Z4F1 713 aa11.47□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 VPS37AQ8NEZ2 397 aa11.47□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 USP33Q8TEY7 942 aa11.47□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 ELMO2Q96JJ3 720 aa11.47□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 PHF20Q9BVI0 1012 aa11.47□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 PIDD1Q9HB75 910 aa11.47□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 CDYLQ9Y232 598 aa11.47□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 ALBP02768 609 aa11.47□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 AKT1P31749 480 aa11.47□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 SOX11P35716 441 aa11.47□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 VHLP40337 213 aa11.47□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 PLA2G4AP47712 749 aa11.47□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 CPA2P48052 419 aa11.47□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 ITGA8P53708 1063 aa11.47□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF543Q08ER8 600 aa11.47□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 KCNV1Q6PIU1 500 aa11.47□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 LAYNQ6UX15 382 aa11.47□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 TTC30AQ86WT1 665 aa11.47□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 CNDP1Q96KN2 507 aa11.47□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 CAAP1Q9H8G2 361 aa11.47□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 SLC40A1Q9NP59 571 aa11.47□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 RIC8BQ9NVN3 520 aa11.47□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa11.47□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF263O14978 683 aa11.47□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 ECE2O60344 883 aa11.47□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 WBP4O75554 376 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 ASMTLO95671 621 aa11.47□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 ACADSP16219 412 aa11.47□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 OLFML2BQ68BL8 750 aa11.47□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP11.47□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 ADCK2Q7Z695 626 aa11.47□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 LRRC6Q86X45 466 aa11.47□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 MANSC1Q9H8J5 431 aa11.47□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 C10orf88Q9H8K7 445 aa11.47□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 SELENONQ9NZV5 590 aa11.47□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 KCND2Q9NZV8 630 aa11.47□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 PIM2Q9P1W9 311 aa11.47□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.8 ms