RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418331.6

PTPRJ-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRJ, Length 5,122 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-201ENST00000418331 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
PTPRJ-201ENST00000418331 TTC30AQ86WT1 665 aa22.38■■□□□ 1.17
PTPRJ-201ENST00000418331 CD302Q8IX05 232 aa22.38■■□□□ 1.17
PTPRJ-201ENST00000418331 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
PTPRJ-201ENST00000418331 CGRRF1Q99675 332 aa22.38■■□□□ 1.17
PTPRJ-201ENST00000418331 GZMAP12544 262 aa22.38■■□□□ 1.17
PTPRJ-201ENST00000418331 IFNA8P32881 189 aa22.38■■□□□ 1.17
PTPRJ-201ENST00000418331 SPRP35270 261 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
PTPRJ-201ENST00000418331 MAPK7Q13164 816 aa22.38■■□□□ 1.17
PTPRJ-201ENST00000418331 C2CD6Q53TS8 623 aa22.38■■□□□ 1.17
PTPRJ-201ENST00000418331 TAS1R2Q8TE23 839 aa22.38■■□□□ 1.17
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PTPRJ-201ENST00000418331 POLBP06746 335 aa22.37■■□□□ 1.17
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PTPRJ-201ENST00000418331 TMEM259Q4ZIN3 620 aa22.37■■□□□ 1.17
PTPRJ-201ENST00000418331 C4orf22Q6V702 233 aa22.37■■□□□ 1.17
PTPRJ-201ENST00000418331 TSPAN17Q96FV3 270 aa22.37■■□□□ 1.17
PTPRJ-201ENST00000418331 NPHS2Q9NP85 383 aa22.37■■□□□ 1.17
PTPRJ-201ENST00000418331 TLR2O60603 784 aa22.37■■□□□ 1.17
PTPRJ-201ENST00000418331 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
PTPRJ-201ENST00000418331 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
PTPRJ-201ENST00000418331 PCSK7Q16549 785 aa22.37■■□□□ 1.17
PTPRJ-201ENST00000418331 PARP9Q8IXQ6 854 aa22.37■■□□□ 1.17
PTPRJ-201ENST00000418331 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
PTPRJ-201ENST00000418331 MTSS1O43312 755 aa22.37■■□□□ 1.17
PTPRJ-201ENST00000418331 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
PTPRJ-201ENST00000418331 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
PTPRJ-201ENST00000418331 KIAA0895Q8NCT3 520 aa22.37■■□□□ 1.17
PTPRJ-201ENST00000418331 SLC26A7Q8TE54 656 aa22.37■■□□□ 1.17
PTPRJ-201ENST00000418331 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
PTPRJ-201ENST00000418331 DYRK4Q9NR20 520 aa22.37■■□□□ 1.17
PTPRJ-201ENST00000418331 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
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PTPRJ-201ENST00000418331 F8VZ95 297 aa22.36■■□□□ 1.17
PTPRJ-201ENST00000418331 PRLRP16471 622 aa22.36■■□□□ 1.17
PTPRJ-201ENST00000418331 KRT4P19013 534 aa22.36■■□□□ 1.17
PTPRJ-201ENST00000418331 LSP1P33241 339 aa22.36■■□□□ 1.17
PTPRJ-201ENST00000418331 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP22.36■■□□□ 1.17
PTPRJ-201ENST00000418331 PMS1P54277 932 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
PTPRJ-201ENST00000418331 KDSRQ06136 332 aa22.36■■□□□ 1.17
PTPRJ-201ENST00000418331 ORC1Q13415 861 aa22.36■■□□□ 1.17
PTPRJ-201ENST00000418331 MYBPC2Q14324 1141 aa22.36■■□□□ 1.17
PTPRJ-201ENST00000418331 TBCCQ15814 346 aa22.36■■□□□ 1.17
PTPRJ-201ENST00000418331 AMHR2Q16671 573 aa22.36■■□□□ 1.17
PTPRJ-201ENST00000418331 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa22.36■■□□□ 1.17
PTPRJ-201ENST00000418331 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
PTPRJ-201ENST00000418331 COBLL1Q53SF7 1204 aa22.36■■□□□ 1.17
PTPRJ-201ENST00000418331 PLEKHH3Q7Z736 793 aa22.36■■□□□ 1.17
PTPRJ-201ENST00000418331 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
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PTPRJ-201ENST00000418331 GLT1D1Q96MS3 346 aa22.36■■□□□ 1.17
PTPRJ-201ENST00000418331 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa22.36■■□□□ 1.17
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PTPRJ-201ENST00000418331 MYO1DO94832 1006 aa22.36■■□□□ 1.17
PTPRJ-201ENST00000418331 HERVK_113P62684 666 aa22.36■■□□□ 1.17
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PTPRJ-201ENST00000418331 CYP2W1Q8TAV3 490 aa22.36■■□□□ 1.17
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PTPRJ-201ENST00000418331 FAM129AQ9BZQ8 928 aa22.36■■□□□ 1.17
PTPRJ-201ENST00000418331 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa22.36■■□□□ 1.17
PTPRJ-201ENST00000418331 KIAA1257Q9ULG3 409 aa22.36■■□□□ 1.17
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PTPRJ-201ENST00000418331 ZNF197O14709 1029 aa22.36■■□□□ 1.17
PTPRJ-201ENST00000418331 VDRP11473 427 aa22.36■■□□□ 1.17
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PTPRJ-201ENST00000418331 PGM1P36871 562 aa22.36■■□□□ 1.17
PTPRJ-201ENST00000418331 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa22.36■■□□□ 1.17
PTPRJ-201ENST00000418331 VGLL2Q8N8G2 317 aa22.36■■□□□ 1.17
PTPRJ-201ENST00000418331 IPMKQ8NFU5 416 aa22.36■■□□□ 1.17
PTPRJ-201ENST00000418331 SH3KBP1Q96B97 665 aa22.36■■□□□ 1.17
PTPRJ-201ENST00000418331 DCUN1D1Q96GG9 259 aa22.36■■□□□ 1.17
PTPRJ-201ENST00000418331 CENPKQ9BS16 269 aa22.36■■□□□ 1.17
PTPRJ-201ENST00000418331 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
PTPRJ-201ENST00000418331 TASP1Q9H6P5 420 aa22.35■■□□□ 1.17
PTPRJ-201ENST00000418331 ALDH1A1P00352 501 aa22.35■■□□□ 1.17
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PTPRJ-201ENST00000418331 TRADDQ15628 312 aa22.35■■□□□ 1.17
PTPRJ-201ENST00000418331 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
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PTPRJ-201ENST00000418331 PPP1R36Q96LQ0 422 aa22.35■■□□□ 1.17
PTPRJ-201ENST00000418331 PNKPQ96T60 521 aa22.35■■□□□ 1.17
PTPRJ-201ENST00000418331 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
PTPRJ-201ENST00000418331 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
PTPRJ-201ENST00000418331 ZNF212Q9UDV6 495 aa22.35■■□□□ 1.17
PTPRJ-201ENST00000418331 NDUFS3O75489 264 aa22.35■■□□□ 1.17
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PTPRJ-201ENST00000418331 HSD17B3P37058 310 aa22.35■■□□□ 1.17
PTPRJ-201ENST00000418331 RGS2P41220 211 aa22.35■■□□□ 1.17
PTPRJ-201ENST00000418331 STKLD1Q8NE28 680 aa22.35■■□□□ 1.17
PTPRJ-201ENST00000418331 PBXIP1Q96AQ6 731 aa22.35■■□□□ 1.17
PTPRJ-201ENST00000418331 MTFR1LQ9H019 292 aa22.35■■□□□ 1.17
PTPRJ-201ENST00000418331 KIZQ2M2Z5 673 aa22.35■■□□□ 1.17
PTPRJ-201ENST00000418331 RFX8Q6ZV50 586 aa22.35■■□□□ 1.17
PTPRJ-201ENST00000418331 ACOT1Q86TX2 421 aa22.35■■□□□ 1.17
PTPRJ-201ENST00000418331 EFHBQ8N7U6 833 aa22.35■■□□□ 1.17
PTPRJ-201ENST00000418331 PNMA5Q96PV4 448 aa22.35■■□□□ 1.17
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