RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409006.3

KDELR3-202, Transcript of KDEL endoplasmic reticulum protein retention receptor 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene KDELR3, Length 931 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR3-202ENST00000409006 OSBPL6Q9BZF3 934 aa24.23■■□□□ 1.47
KDELR3-202ENST00000409006 LRRC27Q9C0I9 530 aa24.23■■□□□ 1.47
KDELR3-202ENST00000409006 GPR88Q9GZN0 384 aa24.23■■□□□ 1.47
KDELR3-202ENST00000409006 ATXN3LQ9H3M9 355 aa24.23■■□□□ 1.47
KDELR3-202ENST00000409006 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
KDELR3-202ENST00000409006 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
KDELR3-202ENST00000409006 HCRTO43612 131 aa24.22■■□□□ 1.47
KDELR3-202ENST00000409006 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
KDELR3-202ENST00000409006 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
KDELR3-202ENST00000409006 BFSP1Q12934 665 aa24.22■■□□□ 1.47
KDELR3-202ENST00000409006 OSTM1Q86WC4 334 aa24.22■■□□□ 1.47
KDELR3-202ENST00000409006 OR5B17Q8NGF7 314 aa24.22■■□□□ 1.47
KDELR3-202ENST00000409006 ZNF507Q8TCN5 953 aa24.22■■□□□ 1.47
KDELR3-202ENST00000409006 FAM200AQ8TCP9 573 aa24.22■■□□□ 1.47
KDELR3-202ENST00000409006 IRF7Q92985 503 aa24.22■■□□□ 1.47
KDELR3-202ENST00000409006 LRRC3BQ96PB8 259 aa24.22■■□□□ 1.47
KDELR3-202ENST00000409006 BCO2Q9BYV7 579 aa24.22■■□□□ 1.47
KDELR3-202ENST00000409006 BLZF1Q9H2G9 400 aa24.22■■□□□ 1.47
KDELR3-202ENST00000409006 IL21Q9HBE4 155 aa24.22■■□□□ 1.47
KDELR3-202ENST00000409006 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
KDELR3-202ENST00000409006 GREB1Q4ZG55 1949 aa24.22■■□□□ 1.47
KDELR3-202ENST00000409006 ARNTLO00327 626 aa24.21■■□□□ 1.47
KDELR3-202ENST00000409006 TGFB1I1O43294 461 aa24.21■■□□□ 1.47
KDELR3-202ENST00000409006 KRT19P08727 400 aa24.21■■□□□ 1.47
KDELR3-202ENST00000409006 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
KDELR3-202ENST00000409006 GPR15P49685 360 aa24.21■■□□□ 1.47
KDELR3-202ENST00000409006 AMPD3Q01432 767 aa24.21■■□□□ 1.47
KDELR3-202ENST00000409006 EHHADHQ08426 723 aa24.21■■□□□ 1.47
KDELR3-202ENST00000409006 CCDC142Q17RM4 750 aa24.21■■□□□ 1.47
KDELR3-202ENST00000409006 FAM26FQ5R3K3 315 aa24.21■■□□□ 1.47
KDELR3-202ENST00000409006 ZNF852Q6ZMS4 543 aa24.21■■□□□ 1.47
KDELR3-202ENST00000409006 ITIH5Q86UX2 942 aa24.21■■□□□ 1.47
KDELR3-202ENST00000409006 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
KDELR3-202ENST00000409006 ZNF687Q8N1G0 1237 aa24.21■■□□□ 1.47
KDELR3-202ENST00000409006 LRRC52Q8N7C0 313 aa24.21■■□□□ 1.47
KDELR3-202ENST00000409006 SPPL2BQ8TCT7 592 aa24.21■■□□□ 1.47
KDELR3-202ENST00000409006 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
KDELR3-202ENST00000409006 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa24.21■■□□□ 1.47
KDELR3-202ENST00000409006 CLDN23Q96B33 292 aa24.21■■□□□ 1.47
KDELR3-202ENST00000409006 INTS13Q9NVM9 706 aa24.21■■□□□ 1.47
KDELR3-202ENST00000409006 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
KDELR3-202ENST00000409006 HSPBP1Q9NZL4 362 aa24.21■■□□□ 1.47
KDELR3-202ENST00000409006 ITGA11Q9UKX5 1188 aa24.21■■□□□ 1.47
KDELR3-202ENST00000409006 CFAP54Q96N23 3096 aa24.2■■□□□ 1.46
KDELR3-202ENST00000409006 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.46
KDELR3-202ENST00000409006 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP24.2■■□□□ 1.46
KDELR3-202ENST00000409006 ME1P48163 572 aa24.2■■□□□ 1.46
KDELR3-202ENST00000409006 RBP5P82980 135 aa24.2■■□□□ 1.46
KDELR3-202ENST00000409006 CYP4F8P98187 520 aa24.2■■□□□ 1.46
KDELR3-202ENST00000409006 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
KDELR3-202ENST00000409006 GPR158Q5T848 1215 aa24.2■■□□□ 1.46
KDELR3-202ENST00000409006 RESP18Q5W5W9 173 aa24.2■■□□□ 1.46
KDELR3-202ENST00000409006 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa24.2■■□□□ 1.46
KDELR3-202ENST00000409006 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
KDELR3-202ENST00000409006 STKLD1Q8NE28 680 aa24.2■■□□□ 1.46
KDELR3-202ENST00000409006 KCNG4Q8TDN1 519 aa24.2■■□□□ 1.46
KDELR3-202ENST00000409006 TRPV5Q9NQA5 729 aa24.2■■□□□ 1.46
KDELR3-202ENST00000409006 GDAP2Q9NXN4 497 aa24.2■■□□□ 1.46
KDELR3-202ENST00000409006 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
KDELR3-202ENST00000409006 SNX9Q9Y5X1 595 aa24.2■■□□□ 1.46
KDELR3-202ENST00000409006 ZNF233A6NK53 670 aa24.19■■□□□ 1.46
KDELR3-202ENST00000409006 ZNF263O14978 683 aa24.19■■□□□ 1.46
KDELR3-202ENST00000409006 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
KDELR3-202ENST00000409006 TMEM191BP0C7N4 346 aa24.19■■□□□ 1.46
KDELR3-202ENST00000409006 SMARCB1Q12824 385 aa24.19■■□□□ 1.46
KDELR3-202ENST00000409006 UNC13DQ70J99 1090 aa24.19■■□□□ 1.46
KDELR3-202ENST00000409006 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa24.19■■□□□ 1.46
KDELR3-202ENST00000409006 SCFD1Q8WVM8 642 aa24.19■■□□□ 1.46
KDELR3-202ENST00000409006 CHAMP1Q96JM3 812 aa24.19■■□□□ 1.46
KDELR3-202ENST00000409006 NELL2Q99435 816 aa24.19■■□□□ 1.46
KDELR3-202ENST00000409006 PKMYT1Q99640 499 aa24.19■■□□□ 1.46
KDELR3-202ENST00000409006 PI4K2AQ9BTU6 479 aa24.19■■□□□ 1.46
KDELR3-202ENST00000409006 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
KDELR3-202ENST00000409006 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa24.19■■□□□ 1.46
KDELR3-202ENST00000409006 PTPRDP23468 1912 aa24.19■■□□□ 1.46
KDELR3-202ENST00000409006 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa24.19■■□□□ 1.46
KDELR3-202ENST00000409006 CLIC2O15247 247 aa24.18■■□□□ 1.46
KDELR3-202ENST00000409006 HUS1O60921 280 aa24.18■■□□□ 1.46
KDELR3-202ENST00000409006 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
KDELR3-202ENST00000409006 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
KDELR3-202ENST00000409006 AFMP43652 599 aa24.18■■□□□ 1.46
KDELR3-202ENST00000409006 FCHO2Q0JRZ9 810 aa24.18■■□□□ 1.46
KDELR3-202ENST00000409006 CUL4BQ13620 913 aa24.18■■□□□ 1.46
KDELR3-202ENST00000409006 VEPH1Q14D04 833 aa24.18■■□□□ 1.46
KDELR3-202ENST00000409006 SOWAHAQ2M3V2 549 aa24.18■■□□□ 1.46
KDELR3-202ENST00000409006 SDHAF4Q5VUM1 108 aa24.18■■□□□ 1.46
KDELR3-202ENST00000409006 TMEM150AQ86TG1 271 aa24.18■■□□□ 1.46
KDELR3-202ENST00000409006 NELFCDQ8IXH7 590 aa24.18■■□□□ 1.46
KDELR3-202ENST00000409006 RDH13Q8NBN7 331 aa24.18■■□□□ 1.46
KDELR3-202ENST00000409006 E2F7Q96AV8 911 aa24.18■■□□□ 1.46
KDELR3-202ENST00000409006 ACBD6Q9BR61 282 aa24.18■■□□□ 1.46
KDELR3-202ENST00000409006 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa24.18■■□□□ 1.46
KDELR3-202ENST00000409006 RCOR1Q9UKL0 485 aa24.18■■□□□ 1.46
KDELR3-202ENST00000409006 PIAS3Q9Y6X2 628 aa24.18■■□□□ 1.46
KDELR3-202ENST00000409006 PRAMEF12O95522 483 aa24.17■■□□□ 1.46
KDELR3-202ENST00000409006 FGF19O95750 216 aa24.17■■□□□ 1.46
KDELR3-202ENST00000409006 TSPY1Q01534 308 aa24.17■■□□□ 1.46
KDELR3-202ENST00000409006 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
KDELR3-202ENST00000409006 ADSSL1Q8N142 457 aa24.17■■□□□ 1.46
KDELR3-202ENST00000409006 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24 ms