RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000405333.5

ODC1-202, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene ODC1, Length 1,943 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1-202ENST00000405333 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
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ODC1-202ENST00000405333 CYTH4Q9UIA0 394 aa21.42■■□□□ 1.02
ODC1-202ENST00000405333 LRFN2Q9ULH4 789 aa21.42■■□□□ 1.02
ODC1-202ENST00000405333 KIAA0355O15063 1070 aa21.41■■□□□ 1.02
ODC1-202ENST00000405333 TACC1O75410 805 aa21.41■■□□□ 1.02
ODC1-202ENST00000405333 ACRP10323 421 aa21.41■■□□□ 1.02
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ODC1-202ENST00000405333 MYO1AQ9UBC5 1043 aa21.41■■□□□ 1.02
ODC1-202ENST00000405333 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa21.41■■□□□ 1.02
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ODC1-202ENST00000405333 ATP2C2O75185 946 aa21.41■■□□□ 1.02
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ODC1-202ENST00000405333 PCDHGC3Q9UN70 934 aa21.41■■□□□ 1.02
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ODC1-202ENST00000405333 NCANO14594 1321 aa21.4■■□□□ 1.02
ODC1-202ENST00000405333 ATP8B3O60423 1300 aa21.4■■□□□ 1.02
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ODC1-202ENST00000405333 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
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ODC1-202ENST00000405333 MON1BQ7L1V2 547 aa21.4■■□□□ 1.02
ODC1-202ENST00000405333 MCOLN2Q8IZK6 566 aa21.4■■□□□ 1.02
ODC1-202ENST00000405333 UBA3Q8TBC4 463 aa21.4■■□□□ 1.02
ODC1-202ENST00000405333 ZNF653Q96CK0 615 aa21.4■■□□□ 1.02
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ODC1-202ENST00000405333 C11orf70Q9BRQ4 267 aa21.4■■□□□ 1.02
ODC1-202ENST00000405333 SNX25Q9H3E2 840 aa21.4■■□□□ 1.02
ODC1-202ENST00000405333 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP21.4■■□□□ 1.02
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ODC1-202ENST00000405333 VDRP11473 427 aa21.39■■□□□ 1.02
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ODC1-202ENST00000405333 CCDC130P13994 396 aa21.38■■□□□ 1.01
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ODC1-202ENST00000405333 TRIM58Q8NG06 486 aa21.37■■□□□ 1.01
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ODC1-202ENST00000405333 GJB6O95452 261 aa21.37■■□□□ 1.01
ODC1-202ENST00000405333 LSM8O95777 96 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
ODC1-202ENST00000405333 CYP1A2P05177 515 aa21.37■■□□□ 1.01
ODC1-202ENST00000405333 PFKMP08237 780 aa21.37■■□□□ 1.01
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